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咸豐和當陽地區(qū)鲊廣椒細菌群落結(jié)構(gòu)差異性研究

發(fā)布時間:2024-01-23 12:56
  采用Illumina Mi Seq高通量測序技術(shù)對咸豐地區(qū)鲊廣椒細菌群落結(jié)構(gòu)進行解析,同時結(jié)合之前研究報道的當陽地區(qū)鲊廣椒樣品分析數(shù)據(jù),探究不同地區(qū)鲊廣椒菌群結(jié)構(gòu)的異同。結(jié)果表明,咸豐地區(qū)鲊廣椒優(yōu)勢細菌門為硬壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)和放線菌門(Actinobacteria),優(yōu)勢細菌屬為乳酸桿菌屬(Lactobacillus)、片球菌屬(Pediococcus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)、鹽單胞菌屬(Halomonas)和明串珠菌屬(Leukonostoc)。其細菌的豐度和多樣性均極顯著高于當陽地區(qū)(P<0.01),同時,一些低豐度的菌群在兩個地區(qū)的樣品中存在顯著差異(P<0.05),乳桿菌屬和片球菌屬為主要優(yōu)勢菌屬和核心菌屬。此外,兩地區(qū)鲊廣椒中均廣泛分布有腸桿菌屬(Enterobacter)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)和芽孢桿菌屬(Bacillus)等致病共棲菌。相關(guān)性分析結(jié)果表明,鲊廣椒發(fā)酵菌群彼此間存在密切的相關(guān)關(guān)系,其制作和生產(chǎn)需要多種微生物的協(xié)調(diào)作...

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圖5鲊廣椒樣品細菌屬之間的相關(guān)性

圖5鲊廣椒樣品細菌屬之間的相關(guān)性


圖1各鲊廣椒樣品細菌菌群的稀疏曲線(a)和Shannon曲線(b)

圖1各鲊廣椒樣品細菌菌群的稀疏曲線(a)和Shannon曲線(b)


圖2咸豐地區(qū)鲊廣椒屬水平主要細菌的相對豐度

圖2咸豐地區(qū)鲊廣椒屬水平主要細菌的相對豐度


圖3基于加權(quán)UniFrac距離(a)和非加權(quán)UniFrac距離(b)咸豐與當陽地區(qū)鲊廣椒樣品細菌菌群結(jié)構(gòu)主坐標分析結(jié)果

圖3基于加權(quán)UniFrac距離(a)和非加權(quán)UniFrac距離(b)咸豐與當陽地區(qū)鲊廣椒樣品細菌菌群結(jié)構(gòu)主坐標分析結(jié)果



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