采用Illumina Mi Seq高通量測序技術(shù)對采集自內(nèi)蒙古自治區(qū)巴彥淖爾市的10份酸粥樣品中的細(xì)菌多樣性進(jìn)行解析,同時(shí)基于細(xì)菌屬水平對其進(jìn)行圍繞中心點(diǎn)的劃分（PAM）,并基于PICRUSt和Bug Base軟件對細(xì)菌的基因功能及表型進(jìn)行預(yù)測。結(jié)果表明,所有酸粥樣品中的細(xì)菌隸屬于9個(gè)細(xì)菌門的55個(gè)屬,樣品間細(xì)菌多樣性和豐度存在明顯差異,但優(yōu)勢細(xì)菌門均為硬壁菌門（Firmicutes）和變形菌門（Proteobacteria）,優(yōu)勢細(xì)菌屬均為乳桿菌屬（Lactobacillus）和醋桿菌屬（Acetobacter）。所有酸粥樣品可分為兩個(gè)聚類,聚類I以醋桿菌屬（Acetobacter）為主,聚類II以乳桿菌屬（Lactobacillus）為主;兩個(gè)聚類中細(xì)菌對于碳水化合物的利用和細(xì)菌的生長繁殖等存在顯著差異（P<0.05）,隸屬于聚類I的酸粥樣品中,其細(xì)菌的代謝和繁殖更加迅速。 

【文章來源】：中國釀造. 2020,39(09)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

酸粥樣品中優(yōu)勢菌門和優(yōu)勢菌屬相對含量的比較分析

進(jìn)一步對酸粥樣本中OTU出現(xiàn)的頻率和平均相對含量進(jìn)行分析，以便于對酸粥樣品中的核心細(xì)菌類群進(jìn)行研究，結(jié)果見圖2。由圖2可知，獨(dú)有OTU數(shù)（僅在一個(gè)樣品中出現(xiàn)）占總數(shù)的88.26%，擁有序列數(shù)3 900條，占全部序列數(shù)的1.81%。而在所有樣品中出現(xiàn)的OTU數(shù)為0。由圖2亦可知，酸粥樣品中共有OTU（在80%的樣品中出現(xiàn)）數(shù)有6個(gè)，其所包含的序列數(shù)占全部序列數(shù)的10.08%，其中醋桿菌屬、農(nóng)桿菌屬（Agrostis）和乳桿菌屬的平均相對含量分別為9.01%、0.55%和0.45%。由此說明，雖然酸粥樣本中存在大量的核心菌群，但每份樣本中均存在許多獨(dú)特的細(xì)菌類型。酸粥中乳桿菌屬平均相對含量>60%，但其共有OTU的比例<0.50%，說明酸粥中隸屬于乳桿菌屬的細(xì)菌在種或株水平上存較大的差異。

由圖3可知，酸粥在兩份坐標(biāo)軸的空間排布并不相同，圖3a坐標(biāo)軸中的樣本在空間排布上較為分散，而圖3b坐標(biāo)軸中的樣本在空間排布上呈現(xiàn)明顯的聚類趨勢。由此說明，酸粥中存在著許多低豐度物種，且不同樣本中低豐度物種之間存在著較大差異，而不同酸粥樣本中優(yōu)勢菌的差異卻相對較小。為進(jìn)一步探究不同酸粥樣本在屬水平上的差異，本研究基于屬水平對10份酸粥樣品進(jìn)行PAM分析，結(jié)果見圖4。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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