共病是指兩種疾病共同存在的狀態(tài),與日益增加的不良健康結(jié)果相關(guān)。共病的早期篩查與預(yù)警有助于完善臨床診療思維,改善患者的預(yù)后。許多領(lǐng)域的共病研究處于起步階段,疾病間的關(guān)聯(lián)關(guān)系尚存在很大的不確定性。大量的疾病知識蘊藏在生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中,如何從海量的文獻(xiàn)中有效地挖掘共病關(guān)系、預(yù)測潛在的共病組合是本研究主要探討的問題。針對共病研究的必要性以及現(xiàn)有共病挖掘方法的局限性,本研究以糖尿病領(lǐng)域為例,從語義共現(xiàn)和引用行為兩個視角出發(fā),以SAO語義模型和引文全文本為基礎(chǔ),結(jié)合BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型預(yù)測潛在的共病關(guān)系。首先,分別基于共現(xiàn)關(guān)系和引用關(guān)系構(gòu)建共病網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域文獻(xiàn)的特點,利用SemRep和MetaMap工具,抽取論文中的疾病概念。分別構(gòu)造基于共現(xiàn)的共病對和基于引用的共病對,由此構(gòu)建3個共病網(wǎng)絡(luò)——共現(xiàn)關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)、引用關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)和二者取并集后的融合網(wǎng)絡(luò)。通過網(wǎng)絡(luò)基本特征指標(biāo)、微觀指標(biāo)和鏈路預(yù)測指標(biāo)對共病網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行評價和比較,發(fā)現(xiàn)融合網(wǎng)絡(luò)能夠更好地描述糖尿病領(lǐng)域的共病現(xiàn)象。選用融合網(wǎng)絡(luò)預(yù)測潛在的共病關(guān)系,利用鏈路預(yù)測算法計算融合網(wǎng)絡(luò)的14個網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)特征,包括基于局部信息的相似性指標(biāo)、基于路徑的相似性指標(biāo)和基...

【文章頁數(shù)】：95 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 研究背景
    1.2 研究意義
    1.3 共病關(guān)系發(fā)現(xiàn)研究現(xiàn)狀
        1.3.1 共病模式發(fā)現(xiàn)
        1.3.2 共病關(guān)系預(yù)測
    1.4 研究設(shè)計
        1.4.1 研究目標(biāo)
        1.4.2 研究內(nèi)容
        1.4.3 研究方法及技術(shù)路線
    1.5 論文組織結(jié)構(gòu)
第2章 相關(guān)概念界定與理論依據(jù)
    2.1 相關(guān)概念界定
    2.2 基于文獻(xiàn)的知識發(fā)現(xiàn)
        2.2.1 基于ABC共現(xiàn)模型的知識發(fā)現(xiàn)
        2.2.2 基于SAO語義模型的知識發(fā)現(xiàn)
        2.2.3 基于實體計量學(xué)的知識發(fā)現(xiàn)
    2.3 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)與應(yīng)用
        2.3.1 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)
        2.3.2 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用
    2.4 本章小結(jié)
第3章 基于概念共現(xiàn)與引用的潛在共病發(fā)現(xiàn)方法
    3.1 數(shù)據(jù)收集
    3.2 共病關(guān)系的提取
        3.2.1 SAO結(jié)構(gòu)提取
        3.2.2 基于引用的共病關(guān)系構(gòu)建
    3.3 共病網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析
    3.4 潛在共病關(guān)系發(fā)現(xiàn)
    3.5 潛在共病關(guān)系分析
    3.6 評價指標(biāo)
    3.7 本章小結(jié)
第4章 糖尿病領(lǐng)域共病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
    4.1 數(shù)據(jù)獲取
    4.2 共病關(guān)系提取
        4.2.1 基于共現(xiàn)的共病關(guān)系提取
        4.2.2 基于引用的共病關(guān)系提取
        4.2.3 共病關(guān)系清洗
    4.3 共病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析
        4.3.1 網(wǎng)絡(luò)基本特征分析
        4.3.2 網(wǎng)絡(luò)重要節(jié)點分析
        4.3.3 網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)特征分析
    4.4 本章小結(jié)
第5章 糖尿病領(lǐng)域潛在共病關(guān)系發(fā)現(xiàn)
    5.1 基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測模型構(gòu)建
    5.2 預(yù)測結(jié)果分析
    5.3 本章小結(jié)
第6章 總結(jié)與展望
    6.1 結(jié)論
    6.2 本研究的創(chuàng)新點
    6.3 本研究的局限性與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀碩士研究生期間所發(fā)表的論文
致謝



本文編號：3805042