自閉癥“藥物-靶點(diǎn)”關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析及關(guān)系預(yù)測
發(fā)布時(shí)間:2023-02-15 15:32
目的:通過建立自閉癥藥物網(wǎng)絡(luò)以及建立自閉癥“藥物-靶點(diǎn)”關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò),通過網(wǎng)絡(luò)分析方法和計(jì)算機(jī)技術(shù),為自閉癥未來的治療提供潛在的靶點(diǎn)和藥物,為自閉癥患者推薦合理的新療法。數(shù)據(jù)與方法:本文以DrugBank全藥數(shù)據(jù)庫為數(shù)據(jù)源,通過Python抽取藥物-靶點(diǎn)關(guān)系數(shù)據(jù),共抽取到2527條藥物數(shù)據(jù)和3786條靶點(diǎn)數(shù)據(jù);2527條藥物數(shù)據(jù)建立藥物網(wǎng)絡(luò),對藥物網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)特點(diǎn)分析,并對藥物網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聚類分析,通過觀察每個(gè)藥物社區(qū)內(nèi)部的藥物分類特征,發(fā)現(xiàn)某些與社區(qū)內(nèi)藥物適應(yīng)證有明顯差異的藥物(自閉癥臨床藥物除外),再通過查閱相關(guān)資料來探究其是否與本社區(qū)內(nèi)主要適應(yīng)證具有相關(guān)性,通過自閉癥相關(guān)發(fā)病機(jī)制篩選出與自閉癥治療具有相關(guān)性的藥物作為自閉癥潛在治療藥物;2527條藥物數(shù)據(jù)和3786條靶點(diǎn)數(shù)據(jù)建立“藥物-靶點(diǎn)”二分網(wǎng)絡(luò),選擇基于物質(zhì)擴(kuò)散的二分網(wǎng)絡(luò)推薦算法,開展自閉癥相關(guān)的藥物和靶點(diǎn)推薦,為發(fā)現(xiàn)自閉癥治療領(lǐng)域的潛在價(jià)值提供思路。結(jié)果:對藥物網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)特點(diǎn)分析和聚類分析發(fā)現(xiàn)有5個(gè)藥物表現(xiàn)出良好的藥物價(jià)值屬性,分別為 Zinc(鋅)、amitriptyline(阿米替林)、Olanzapine(奧氮平)...
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 問題的提出與研究意義
1.2 國內(nèi)外相關(guān)研究綜述
1.3 技術(shù)路線及流程
1.4 研究方法
1.5 數(shù)據(jù)來源與獲取
1.5.1 數(shù)據(jù)來源
1.5.2 數(shù)據(jù)獲取
1.6 論文框架
1.7 論文的創(chuàng)新點(diǎn)
2 自閉癥相關(guān)藥物網(wǎng)絡(luò)研究
2.1 藥物網(wǎng)絡(luò)特點(diǎn)分析
2.1.1 社會網(wǎng)絡(luò)分析
2.1.2 PageRank算法分析
2.2 藥物網(wǎng)絡(luò)聚類分析
2.2.1 自閉癥臨床用藥聚類分析
2.2.2 自閉癥特定適應(yīng)證的潛力藥物發(fā)現(xiàn)
3 基于“藥物-靶點(diǎn)”二分網(wǎng)絡(luò)開展?jié)撛诎悬c(diǎn)和藥物推薦研究
3.1 二分網(wǎng)絡(luò)推薦算法
3.1.1 算法簡介
3.1.2 算法原理
3.2 自閉癥相關(guān)藥物的靶點(diǎn)推薦及其有效性驗(yàn)證
3.2.1 自閉癥相關(guān)藥物的靶點(diǎn)推薦
3.2.2 推薦結(jié)果的有效性驗(yàn)證
3.3 自閉癥相關(guān)靶點(diǎn)的藥物推薦及其有效性驗(yàn)證
3.3.1 自閉癥相關(guān)靶點(diǎn)的藥物推薦
3.3.2 推薦結(jié)果的有效性驗(yàn)證
3.4 潛在靶點(diǎn)與藥物推薦結(jié)果分析
4 結(jié)論與討論
4.1 討論
4.2 結(jié)論
4.3 建議
4.4 研究不足與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡介
本文編號:3743437
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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Abstract
1 引言
1.1 問題的提出與研究意義
1.2 國內(nèi)外相關(guān)研究綜述
1.3 技術(shù)路線及流程
1.4 研究方法
1.5 數(shù)據(jù)來源與獲取
1.5.1 數(shù)據(jù)來源
1.5.2 數(shù)據(jù)獲取
1.6 論文框架
1.7 論文的創(chuàng)新點(diǎn)
2 自閉癥相關(guān)藥物網(wǎng)絡(luò)研究
2.1 藥物網(wǎng)絡(luò)特點(diǎn)分析
2.1.1 社會網(wǎng)絡(luò)分析
2.1.2 PageRank算法分析
2.2 藥物網(wǎng)絡(luò)聚類分析
2.2.1 自閉癥臨床用藥聚類分析
2.2.2 自閉癥特定適應(yīng)證的潛力藥物發(fā)現(xiàn)
3 基于“藥物-靶點(diǎn)”二分網(wǎng)絡(luò)開展?jié)撛诎悬c(diǎn)和藥物推薦研究
3.1 二分網(wǎng)絡(luò)推薦算法
3.1.1 算法簡介
3.1.2 算法原理
3.2 自閉癥相關(guān)藥物的靶點(diǎn)推薦及其有效性驗(yàn)證
3.2.1 自閉癥相關(guān)藥物的靶點(diǎn)推薦
3.2.2 推薦結(jié)果的有效性驗(yàn)證
3.3 自閉癥相關(guān)靶點(diǎn)的藥物推薦及其有效性驗(yàn)證
3.3.1 自閉癥相關(guān)靶點(diǎn)的藥物推薦
3.3.2 推薦結(jié)果的有效性驗(yàn)證
3.4 潛在靶點(diǎn)與藥物推薦結(jié)果分析
4 結(jié)論與討論
4.1 討論
4.2 結(jié)論
4.3 建議
4.4 研究不足與展望
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