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POU1F1基因與CAST基因單核苷酸多態(tài)性與兔肉質性狀關聯性分析

發(fā)布時間:2017-08-20 07:22

  本文關鍵詞:POU1F1基因與CAST基因單核苷酸多態(tài)性與兔肉質性狀關聯性分析


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【摘要】:垂體特異性轉錄因子(Pituitary Specific Transcriptiona Factorl, POU1/Pit-1)和鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin, CAST)在動物體內主要參與肌肉生長過程,因其對肉質性狀有重要的決定性作用而被認為是影響動物經濟性質的重要候選基因。本試驗隨機選擇天府黑兔、香檳兔、伊拉兔三個品種(系)作為研究對象,利用PCR產物直接測序法檢測了家兔POU1F1基因內含子5,CAST基因內含子5的單核苷酸多態(tài)性(SNPs),并分析了不同基因型與肉質性狀的相關性,以期為肉兔早期選種提供可靠的候選基因材料,為肉兔育種提供分子理論基礎。本試驗的主要研究結果如下:(1)在CAST基因內含子5發(fā)現了一個變異位點,一共檢測到3種基因型(GG,TT和GT)。等位基因T和基因型TT在三個家兔品種中占有優(yōu)勢?ǚ綑z驗顯示3個肉兔品種未處于哈溫平衡狀態(tài),分析顯示3個家兔群體多態(tài)信息含量(PIC)呈中度多態(tài)。關聯性分析表明,無論是背最長肌還是后腿肌,GT基因型家兔的pH0h和b*0h顯著高于TT基因型(P0.05)。對家兔后腿肌而言,攜帶GT基因型個體的pH24h顯著高于GG基因型(P0.05)。家兔背最長肌TT基因型肌內脂肪含量顯著高于GG和GT基因型(P0.05),而后腿基因型GG肌內脂肪含量最高。(2)在POUIF1基因內含子5發(fā)現一個變異位點共3種基因型(CC,TT和CT)。等位基因C和基因型CC在三個家兔品種中占有優(yōu)勢。卡方檢驗顯示3個肉兔品種未處于哈溫群體平衡狀態(tài),分析顯示3個家兔群體多態(tài)信息含量(PIC)處于中度多態(tài)性。關聯性分析表明,不同基因型家兔背最長肌pH (Oh,24h), L* (Oh, 24h), a* (Oh,24h), and b* (Oh,24h)之間差異未達到顯著水平。就家兔后腿肌而言,CC基因型pH值顯著高于CT基因型(P0.05)。TT基因型家兔蒸煮損失顯著低于CC和CT基因型(P0.05)。TT基因型家兔背最長肌肌內脂肪含量顯著低于CC和CT基因型(P0.05)。CT基因型家兔后腿肌內脂肪含量顯著低于CC和TT基因型(P0.05)。(3) POU1F1基因SNP位點與后腿的pH值之間存在顯著相關性。同時,對家兔背最長肌和后腿的肌內脂肪含量也有顯著性影響。CAST基因不同基因型對家兔背最長肌和后腿的pH值無顯著影響,但是對肉色有明顯影響。(4)對來自三個品種共372只肉兔進行屠宰并測定其主要肉質性狀指標,三個品種之間的宰前活重及胴體重差異不顯著,通過對不同品種背最長肌及右后腿肌進行pH值、肉色和脂肪率進行了測定。結果發(fā)現,在背最長肌上,剛屠宰時天府黑兔的pH值極顯著高于伊拉兔和香檳兔,在右后腿肌上與背最長肌在肉色及脂肪含量上趨勢一致,品種之間存在差異。
【關鍵詞】: POU1F1基因 CAST基因 肉質 關聯性分析
【學位授予單位】:四川農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S829.1
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-10
  • 1 文獻綜述10-27
  • 1.1 我國肉兔養(yǎng)殖現狀10-11
  • 1.2 兔肉的營養(yǎng)特點11-12
  • 1.2.1 兔肉中含有優(yōu)質的蛋白質11
  • 1.2.2 兔肉中的脂肪含量和有毒物質含量低11-12
  • 1.3 POU1F1基因的研究進展12-21
  • 1.3.1 POU1F1蛋白的結構13
  • 1.3.2 POU1F1的生物學效應和作用機制13-14
  • 1.3.3 POU1Fl基因的結構14-15
  • 1.3.4 POU1F1基因遺傳突變的研究進展15-21
  • 1.3.4.1 人類POU1F1基因遺傳突變的研究進展15-16
  • 1.3.4.2 小鼠POU1F1基因遺傳突變的研究進展16-17
  • 1.3.4.3 豬POU1F1基因遺傳突變的研究進展17-18
  • 1.3.4.4 牛POU1F1基因遺傳突變的研究進展18-20
  • 1.3.4.5 綿羊POU1F1基因遺傳變異研究20
  • 1.3.4.6 山羊POU1F1基因遺傳變異研究20-21
  • 1.4 CAST基因的研究進展21-24
  • 1.4.1 CAST蛋白的結構21-22
  • 1.4.2 CAST蛋白對肉品質的影響22
  • 1.4.3 CAST基因與肉品質的相關性研究22-24
  • 1.5 單核苷酸多態(tài)性遺傳標記(SNP)的概述24-26
  • 1.5.1 單核苷酸多態(tài)性遺傳標記(SNP)的簡介24
  • 1.5.2 PCR-SSCP技術的簡介24-26
  • 1.5.3 幾種經典分子標記的比較26
  • 1.6 本研究的目的和意義26-27
  • 2 材料與方法27-32
  • 2.1 試驗材料27-28
  • 2.1.1 試驗群體27
  • 2.1.2 儀器與設備27-28
  • 2.1.3 主要試劑及試劑盒28
  • 2.1.4 試驗主要分子生物學軟件28
  • 2.2 實驗的方法28-32
  • 2.2.1 引物的設計28
  • 2.2.2 肉質測量的方法28-29
  • 2.2.3 基因組DNA的提取29
  • 2.2.4 DNA濃度和純度的檢測29-30
  • 2.2.5 PCR反應30
  • 2.2.6 PCR產物的檢測30
  • 2.2.7 PCR產物的測序30
  • 2.2.8 測序結果的處理30-31
  • 2.2.9 遺傳數據處理31-32
  • 2.2.10 數據處理32
  • 3 結果與分析32-42
  • 3.1 三個品種肉兔肉質性狀測定結果32-34
  • 3.2 POU1F1基因遺傳變異位點檢測結果34-35
  • 3.3 POU1F1基因突變位點分析35-36
  • 3.4 POU1F1基因突變與主要肉質性狀關聯分析36-38
  • 3.5 CAST基因遺傳變異位點檢測結果38
  • 3.6 CAST基因突變位點分析38-39
  • 3.7 CAST基因突變與主要肉質性狀關聯分析39-42
  • 4 討論42-45
  • 4.1 pH對肉質的影響42-43
  • 4.2 肉色對肉質的影響43
  • 4.3 蒸煮損失和肌內脂肪對肉質的影響43-44
  • 4.4 CAST基因和POU1F1基因多態(tài)性對其他動物肉質的影響44-45
  • 4.5 不同品種之間肉質差異45
  • 5 結論45-46
  • 6 參考文獻46-55
  • 致謝55

【相似文獻】

中國期刊全文數據庫 前10條

1 張賢群,覃矜,SKondracki;品種、性別和飼喂水平對背最長肌脂肪酸成分的影響[J];國外畜牧學(豬與禽);2001年01期

2 馬文強;馮杰;許梓榮;汪以真;劉建新;;豬背最長肌肌紅蛋白基因片段的克隆及甘氨酸鐵對其表達的影響[J];浙江大學學報(農業(yè)與生命科學版);2009年05期

3 黃金秀;劉作華;楊飛云;葉婷;江山;肖融;;品種、體重和營養(yǎng)對豬背最長肌肌纖維組織學特性的影響[J];中國畜牧雜志;2010年13期

4 虞德兵;熊鍇;張宇霞;葦小菲;文平;王林云;黃瑞華;劉紅林;;豬IGF2 Intron3 G3072A突變及其在背最長肌中差異表達[J];南京農業(yè)大學學報;2010年06期

5 宋凡;閆冬梅;周淑蘭;;豬背最長肌、皮下脂肪及飼料脂肪酸組成的快速測定[J];飼料研究;2011年10期

6 孟質文;張瑞紅;安s,

本文編號:705297


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