本文關(guān)鍵詞：POU1F1基因與CAST基因單核苷酸多態(tài)性與兔肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析

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【摘要】：垂體特異性轉(zhuǎn)錄因子(Pituitary Specific Transcriptiona Factorl, POU1/Pit-1)和鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin, CAST)在動(dòng)物體內(nèi)主要參與肌肉生長(zhǎng)過(guò)程,因其對(duì)肉質(zhì)性狀有重要的決定性作用而被認(rèn)為是影響動(dòng)物經(jīng)濟(jì)性質(zhì)的重要候選基因。本試驗(yàn)隨機(jī)選擇天府黑兔、香檳兔、伊拉兔三個(gè)品種(系)作為研究對(duì)象,利用PCR產(chǎn)物直接測(cè)序法檢測(cè)了家兔POU1F1基因內(nèi)含子5,CAST基因內(nèi)含子5的單核苷酸多態(tài)性(SNPs),并分析了不同基因型與肉質(zhì)性狀的相關(guān)性,以期為肉兔早期選種提供可靠的候選基因材料,為肉兔育種提供分子理論基礎(chǔ)。本試驗(yàn)的主要研究結(jié)果如下：(1)在CAST基因內(nèi)含子5發(fā)現(xiàn)了一個(gè)變異位點(diǎn),一共檢測(cè)到3種基因型(GG,TT和GT)。等位基因T和基因型TT在三個(gè)家兔品種中占有優(yōu)勢(shì)�？ǚ綑z驗(yàn)顯示3個(gè)肉兔品種未處于哈溫平衡狀態(tài),分析顯示3個(gè)家兔群體多態(tài)信息含量(PIC)呈中度多態(tài)。關(guān)聯(lián)性分析表明,無(wú)論是背最長(zhǎng)肌還是后腿肌,GT基因型家兔的pH0h和b*0h顯著高于TT基因型(P0.05)。對(duì)家兔后腿肌而言,攜帶GT基因型個(gè)體的pH24h顯著高于GG基因型(P0.05)。家兔背最長(zhǎng)肌TT基因型肌內(nèi)脂肪含量顯著高于GG和GT基因型(P0.05),而后腿基因型GG肌內(nèi)脂肪含量最高。(2)在POUIF1基因內(nèi)含子5發(fā)現(xiàn)一個(gè)變異位點(diǎn)共3種基因型(CC,TT和CT)。等位基因C和基因型CC在三個(gè)家兔品種中占有優(yōu)勢(shì)�？ǚ綑z驗(yàn)顯示3個(gè)肉兔品種未處于哈溫群體平衡狀態(tài),分析顯示3個(gè)家兔群體多態(tài)信息含量(PIC)處于中度多態(tài)性。關(guān)聯(lián)性分析表明,不同基因型家兔背最長(zhǎng)肌pH (Oh,24h), L* (Oh, 24h), a* (Oh,24h), and b* (Oh,24h)之間差異未達(dá)到顯著水平。就家兔后腿肌而言,CC基因型pH值顯著高于CT基因型(P0.05)。TT基因型家兔蒸煮損失顯著低于CC和CT基因型(P0.05)。TT基因型家兔背最長(zhǎng)肌肌內(nèi)脂肪含量顯著低于CC和CT基因型(P0.05)。CT基因型家兔后腿肌內(nèi)脂肪含量顯著低于CC和TT基因型(P0.05)。(3) POU1F1基因SNP位點(diǎn)與后腿的pH值之間存在顯著相關(guān)性。同時(shí),對(duì)家兔背最長(zhǎng)肌和后腿的肌內(nèi)脂肪含量也有顯著性影響。CAST基因不同基因型對(duì)家兔背最長(zhǎng)肌和后腿的pH值無(wú)顯著影響,但是對(duì)肉色有明顯影響。(4)對(duì)來(lái)自三個(gè)品種共372只肉兔進(jìn)行屠宰并測(cè)定其主要肉質(zhì)性狀指標(biāo),三個(gè)品種之間的宰前活重及胴體重差異不顯著,通過(guò)對(duì)不同品種背最長(zhǎng)肌及右后腿肌進(jìn)行pH值、肉色和脂肪率進(jìn)行了測(cè)定。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在背最長(zhǎng)肌上,剛屠宰時(shí)天府黑兔的pH值極顯著高于伊拉兔和香檳兔,在右后腿肌上與背最長(zhǎng)肌在肉色及脂肪含量上趨勢(shì)一致,品種之間存在差異。
【關(guān)鍵詞】：兔 POU1F1基因 CAST基因 肉質(zhì) 關(guān)聯(lián)性分析
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：S829.1
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 1 文獻(xiàn)綜述10-27
• 1.1 我國(guó)肉兔養(yǎng)殖現(xiàn)狀10-11
• 1.2 兔肉的營(yíng)養(yǎng)特點(diǎn)11-12
• 1.2.1 兔肉中含有優(yōu)質(zhì)的蛋白質(zhì)11
• 1.2.2 兔肉中的脂肪含量和有毒物質(zhì)含量低11-12
• 1.3 POU1F1基因的研究進(jìn)展12-21
• 1.3.1 POU1F1蛋白的結(jié)構(gòu)13
• 1.3.2 POU1F1的生物學(xué)效應(yīng)和作用機(jī)制13-14
• 1.3.3 POU1Fl基因的結(jié)構(gòu)14-15
• 1.3.4 POU1F1基因遺傳突變的研究進(jìn)展15-21
• 1.3.4.1 人類(lèi)POU1F1基因遺傳突變的研究進(jìn)展15-16
• 1.3.4.2 小鼠POU1F1基因遺傳突變的研究進(jìn)展16-17
• 1.3.4.3 豬POU1F1基因遺傳突變的研究進(jìn)展17-18
• 1.3.4.4 牛POU1F1基因遺傳突變的研究進(jìn)展18-20
• 1.3.4.5 綿羊POU1F1基因遺傳變異研究20
• 1.3.4.6 山羊POU1F1基因遺傳變異研究20-21
• 1.4 CAST基因的研究進(jìn)展21-24
• 1.4.1 CAST蛋白的結(jié)構(gòu)21-22
• 1.4.2 CAST蛋白對(duì)肉品質(zhì)的影響22
• 1.4.3 CAST基因與肉品質(zhì)的相關(guān)性研究22-24
• 1.5 單核苷酸多態(tài)性遺傳標(biāo)記(SNP)的概述24-26
• 1.5.1 單核苷酸多態(tài)性遺傳標(biāo)記(SNP)的簡(jiǎn)介24
• 1.5.2 PCR-SSCP技術(shù)的簡(jiǎn)介24-26
• 1.5.3 幾種經(jīng)典分子標(biāo)記的比較26
• 1.6 本研究的目的和意義26-27
• 2 材料與方法27-32
• 2.1 試驗(yàn)材料27-28
• 2.1.1 試驗(yàn)群體27
• 2.1.2 儀器與設(shè)備27-28
• 2.1.3 主要試劑及試劑盒28
• 2.1.4 試驗(yàn)主要分子生物學(xué)軟件28
• 2.2 實(shí)驗(yàn)的方法28-32
• 2.2.1 引物的設(shè)計(jì)28
• 2.2.2 肉質(zhì)測(cè)量的方法28-29
• 2.2.3 基因組DNA的提取29
• 2.2.4 DNA濃度和純度的檢測(cè)29-30
• 2.2.5 PCR反應(yīng)30
• 2.2.6 PCR產(chǎn)物的檢測(cè)30
• 2.2.7 PCR產(chǎn)物的測(cè)序30
• 2.2.8 測(cè)序結(jié)果的處理30-31
• 2.2.9 遺傳數(shù)據(jù)處理31-32
• 2.2.10 數(shù)據(jù)處理32
• 3 結(jié)果與分析32-42
• 3.1 三個(gè)品種肉兔肉質(zhì)性狀測(cè)定結(jié)果32-34
• 3.2 POU1F1基因遺傳變異位點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果34-35
• 3.3 POU1F1基因突變位點(diǎn)分析35-36
• 3.4 POU1F1基因突變與主要肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析36-38
• 3.5 CAST基因遺傳變異位點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果38
• 3.6 CAST基因突變位點(diǎn)分析38-39
• 3.7 CAST基因突變與主要肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析39-42
• 4 討論42-45
• 4.1 pH對(duì)肉質(zhì)的影響42-43
• 4.2 肉色對(duì)肉質(zhì)的影響43
• 4.3 蒸煮損失和肌內(nèi)脂肪對(duì)肉質(zhì)的影響43-44
• 4.4 CAST基因和POU1F1基因多態(tài)性對(duì)其他動(dòng)物肉質(zhì)的影響44-45
• 4.5 不同品種之間肉質(zhì)差異45
• 5 結(jié)論45-46
• 6 參考文獻(xiàn)46-55
• 致謝55

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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本文編號(hào)：705297