本文關(guān)鍵詞：魁蚶增殖放流效果評(píng)估與群體遺傳多樣性分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：魁蚶(Scapharca broughtonii)廣泛分布在東亞沿海,是我國重要的海水貝類,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。近年來,由于人們過度捕撈和生態(tài)環(huán)境的破壞等原因,導(dǎo)致其自然資源下降,已不能滿足市場需求。人工養(yǎng)殖和增殖放流活動(dòng)的開展,對(duì)魁蚶資源的增加和保護(hù)起到一定作用。但是養(yǎng)殖活動(dòng)對(duì)魁蚶遺傳多樣性的影響、魁蚶的增殖放流效果等問題尚未得到科學(xué)的結(jié)論。本研究以黃渤海重要增殖種類魁蚶作為研究對(duì)象,利用微衛(wèi)星作為分子標(biāo)記,對(duì)魁蚶家系進(jìn)行親緣關(guān)系分析,評(píng)估了微衛(wèi)星作為分子標(biāo)記進(jìn)行家系鑒定的效率,分析了鰲山灣放流魁蚶的回捕率。同時(shí),利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)5個(gè)養(yǎng)殖群體和2個(gè)野生群體的遺傳多樣性進(jìn)行比較,對(duì)放流魁蚶各階段遺傳多樣性進(jìn)行監(jiān)測,以期為魁蚶人工養(yǎng)殖種質(zhì)管理以及增殖放流效果評(píng)估提供參考資料。主要研究結(jié)果如下：1.基于微衛(wèi)星標(biāo)記的魁蚶家系鑒定及有效群體大小評(píng)估在水產(chǎn)動(dòng)物育種過程中,親本與子代間遺傳多樣性的變化、近交率等諸多問題逐漸受到人們的重視,系譜信息的獲得具有十分重要的意義。本研究利用6個(gè)高度多態(tài)的微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)30個(gè)魁蚶親本(♀16,(?)14)及其300個(gè)子代共330個(gè)個(gè)體進(jìn)行家系鑒定,評(píng)估苗種生產(chǎn)中親本與子代間的遺傳變異及有效種群大小。結(jié)果表明,家系鑒定成功率與模擬結(jié)果一致,使用6個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)可以達(dá)到超過99%的鑒定率。親本群體與子代群體間等位基因遺傳多樣性相似,子代群體的雜合度期望值顯著低于親本群體(P0.05),雜合度觀測值和親本群體相比略有降低,但不顯著。所有魁蚶父母本都參與了繁殖過程,并具有多重父權(quán)和多重母權(quán)的現(xiàn)象。不平衡的性別比和親本繁殖成功率的差異導(dǎo)致了有效種群大小的降低(Nt=26.08)。根據(jù)有效種群大小估算的魁蚶養(yǎng)殖群體一代近交率為7.68%,表明親本較少的繁育群體可能會(huì)發(fā)生顯著的近交衰退,增加親本數(shù)量、平衡親本的性別比例及配子的貢獻(xiàn)率是降低近交風(fēng)險(xiǎn)的有效措施。2.基于微衛(wèi)星標(biāo)記的魁蚶增殖放流效果評(píng)估本研究在以往報(bào)道的魁蚶微衛(wèi)星中開發(fā)出6組多重PCR (Multiplex PCRs),提高了基因分型的效率。運(yùn)用其中的3組多重PCR對(duì)放流的46個(gè)魁蚶親本(♀42,84)及208個(gè)回捕的魁蚶個(gè)體進(jìn)行基因分型,建立放流親本的遺傳信息,并對(duì)放流回捕個(gè)體的遺傳信息與親本的遺傳信息進(jìn)行比較,鑒定回捕個(gè)體中的放流個(gè)體。同時(shí)對(duì)放流親本、放流苗種和回捕的放流個(gè)體進(jìn)行遺傳多樣性的比較,監(jiān)測放流過程中魁蚶群體的遺傳多樣性變化。結(jié)果表明,回捕的208個(gè)個(gè)體中有66個(gè)是放流個(gè)體,放流個(gè)體所占比例為31.73%。放流群體在放流后期的遺傳多樣性出現(xiàn)下降趨勢。3.魁蚶養(yǎng)殖群體和野生群體遺傳多樣性研究利用4組多重PCR,對(duì)魁蚶的5個(gè)養(yǎng)殖群體和2個(gè)野生群體的遺傳多樣性進(jìn)行比較。結(jié)果表明,相對(duì)于野生群體而言,養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性略有降低,但不顯著。養(yǎng)殖群體和野生群體的位點(diǎn)平均等位基因數(shù)分別為]4.4和15.9,平均期望雜合度分別為0.817和0.835。此外,Fst值顯示7個(gè)群體具有顯著的遺傳分化。基于遺傳距離利用UPGMA法進(jìn)行聚類分析可以區(qū)分魁蚶的養(yǎng)殖群體和野生群體。
【關(guān)鍵詞】：魁蚶 微衛(wèi)星 家系鑒定 增殖放流 遺傳多樣性 養(yǎng)殖群體 野生群體 多重PCR
【學(xué)位授予單位】：中國海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S917.4
【目錄】：

• 摘要5-7
• Abstract7-13
• 第一章 文獻(xiàn)綜述13-23
• 第一節(jié) 遺傳標(biāo)記的種類和特點(diǎn)13-15
• 1 形態(tài)學(xué)標(biāo)記13
• 2 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記13-14
• 3 生化標(biāo)記14
• 4 分子標(biāo)記14-15
• 第二節(jié) 微衛(wèi)星標(biāo)記及其在水產(chǎn)動(dòng)物家系鑒定中的應(yīng)用15-16
• 1. 微衛(wèi)星DNA(SSR)分子標(biāo)記15
• 2. 微衛(wèi)星標(biāo)記在水生動(dòng)物家系鑒定中的應(yīng)用15-16
• 第三節(jié) 海洋生物資源的增殖放流16-20
• 1 增殖放流的定義及發(fā)展16-17
• 1.1 增殖放流16-17
• 1.2 增殖放流的發(fā)展17
• 2 增殖放流效果評(píng)估17-18
• 3 微衛(wèi)星標(biāo)記在增殖放流中的應(yīng)用18
• 4 魁蚶增殖放流現(xiàn)狀18-20
• 第四節(jié) 群體遺傳學(xué)20-22
• 1 遺傳多樣性20
• 2 魁蚶遺傳多樣性研究進(jìn)展20-22
• 第五節(jié) 本研究的目的及意義22-23
• 第二章 魁蚶家系的鑒定與放流群體回捕率評(píng)估23-45
• 第一節(jié) 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的魁蚶家系鑒定及有效種群大小分析23-36
• 0 引言23-24
• 1 材料與方法24-26
• 1.1 樣品來源與采集24
• 1.2 DNA的提取及微衛(wèi)星分析24-25
• 1.3 統(tǒng)計(jì)分析25-26
• 2 結(jié)果26-34
• 2.1 家系鑒定成功率26-28
• 2.2 親本和子代遺傳多樣性比較28-29
• 2.3 親本繁殖成功率比較29-34
• 3 討論34-36
• 3.1 家系分析34
• 3.2 遺傳多樣性和親本貢獻(xiàn)率34-36
• 第二節(jié) 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的魁蚶增殖放流個(gè)體的鑒定36-45
• 0 前言36
• 1 材料與方法36-38
• 1.1 樣品采集及DNA提取36-37
• 1.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記分析37
• 1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析37-38
• 2 結(jié)果38-44
• 2.1 魁蚶微衛(wèi)星標(biāo)記多重PCR技術(shù)38-40
• 2.2 魁蚶親本遺傳信息數(shù)據(jù)庫的建立40-41
• 2.3 9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)累積鑒定成功率評(píng)估41-43
• 2.4 回捕魁蚶的初步篩選43
• 2.5 回捕魁蚶的DNA鑒定43-44
• 3 討論44-45
• 第三章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的魁蚶群體遺傳學(xué)研究45-59
• 第一節(jié) 魁蚶養(yǎng)殖群體和野生群體遺傳多樣性比較45-54
• 0 前言45-46
• 1 材料與方法46-47
• 1.1 樣品采集和DNA提取46
• 1.2 微衛(wèi)星基因分型46
• 1.3 數(shù)據(jù)分析46-47
• 2 結(jié)果47-52
• 2.1 遺傳多樣性47-50
• 2.2 遺傳分化50-52
• 3 討論52-54
• 第二節(jié) 魁蚶放流群體遺傳多樣性監(jiān)測54-59
• 0 引言54-55
• 1 材料與方法55
• 1.1 樣品采集55
• 1.2 DNA提取和SSRs分析55
• 1.3 數(shù)據(jù)分析55
• 2 結(jié)果55-57
• 3 討論57-59
• 參考文獻(xiàn)59-70
• 致謝70-71
• 個(gè)人簡歷71
• 學(xué)術(shù)成果71

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