發(fā)布時(shí)間：2017-06-19 22:03

  本文關(guān)鍵詞：Acc1基因在仲彬草屬P染色體組中的系統(tǒng)發(fā)育及分子進(jìn)化，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：小麥族(Triticeae)是禾本科早熟禾亞科中一個(gè)有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值、多年生植物占優(yōu)勢的族,包括有30個(gè)屬465個(gè)物種,有二倍體,更多為多倍體物種,有著復(fù)雜且多樣的染色體組組成,如A、S、D、Ns、P、St等基本染色體組的二倍體及演化形成的同源多倍體和異源多倍體。其中,含P染色體組的物種包括在冰草屬(Agropyron Gaertn., P)、仲彬草屬(Kengyilia Yen et J.L.Yang, StYP)、杜威草屬(Douglasdeweya Yen, J.L.Yang et B.R.Baum, StP)以及沙灘麥屬(Psammopyrum Love, EStP)等屬中。仲彬草屬(Kengyilia Yen et J. L Yang)為小麥族一個(gè)重要的多年生屬,由顏濟(jì)和楊俊良教授在1990年以Kengyilia gobicola Yen et J. L Yang為模式種建立的,約有30個(gè)種或變種。仲彬草屬染色體組組成為StYP,其P染色體組源于二倍體的冰草(Agropyron cristatum (L.) Gaertn.)。目前,已有研究表明仲彬草屬物種分布受P染色體組的影響,但P染色體組如何參與到仲彬草屬物種的形成?如何分化?地理分布格局如何?等問題都還不清楚。本研究通過對(duì)13個(gè)仲彬草屬物種(13份)、2個(gè)冰草屬物種(60份)及33個(gè)二倍體物種的229條Acc1基因序列分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,探討仲彬草屬中P染色體組的系統(tǒng)發(fā)育與分子進(jìn)化,主要結(jié)果如下：1、系統(tǒng)發(fā)育及多態(tài)性分析表明仲彬草屬P染色體組存在中亞和青藏高原的地理分化式樣,P染色體組的來源與冰草地理起源有關(guān),中亞地區(qū)仲彬草和青藏高原地區(qū)仲彬草屬物種成為兩個(gè)獨(dú)立起源的譜系。2、全世界的冰草大體分為中亞、東亞、青藏高原和歐洲4個(gè)居群,聚類分析表明這4個(gè)居群分散形成3個(gè)亞支,Fst變化范圍從0.01943到0.17588,推測冰草居群間存在地理隔離或者多重雜交。中亞冰草居群核苷酸多態(tài)性豐富,與其他3個(gè)地區(qū)存在較高的遺傳分化程度,可能是地理隔離或地理距離過遠(yuǎn)的結(jié)果,因此推測中亞居群的冰草可能為冰草的分化中心。青藏高原地區(qū)的冰草居群和東亞的冰草居群遺傳分化指數(shù)最小(Fst=0.0194),遺傳關(guān)系較近,可能與這兩個(gè)居群分化時(shí)間相對(duì)較晚有關(guān)。中亞和歐洲這兩個(gè)冰草居群分化程度低,中亞居群的冰草可能直接參與到歐洲冰草的形成,或者歐洲居群保留了更多的祖先遺傳信息。3、青藏高原地區(qū)仲彬草屬和四倍體冰草Acc1位點(diǎn)多態(tài)性比較發(fā)現(xiàn),仲彬草屬物種存在著相當(dāng)多的古老變異,這些古老變異可能隨著群體歷史擴(kuò)張事件被固定下來。而中亞地區(qū)仲彬草屬、二倍體冰草與四倍體冰草的Acc1位點(diǎn)處多態(tài)性比較發(fā)現(xiàn),仲彬草屬物種在多倍化過程中存在遺傳瓶頸,二倍體的冰草經(jīng)歷了選擇消除事件,四倍體冰草經(jīng)歷了種群擴(kuò)張。4、仲彬草屬的Y染色體組雖然與簇毛麥屬(V染色體組)形成姐妹支,但所有的Y類型的Acc1序列都有5 bp ATTAT,與其他的二倍體染色體組類型不同。因此,推測Y和St染色體組二倍體供體來源可能不同。
【關(guān)鍵詞】：小麥族 仲彬草屬 冰草 Acc1基因 系統(tǒng)發(fā)育 分子進(jìn)化
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S512.1
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 1. 文獻(xiàn)綜述10-17
• 1.1 仲彬草屬研究概況10-12
• 1.2 冰草屬研究概況12-13
• 1.3 分子進(jìn)化13-14
• 1.4 Acc1基因14-16
• 1.5 本研究目的與意義16-17
• 2. 材料與方法17-28
• 2.1 材料17-22
• 2.2 方法22-26
• 2.2.1 植物總DNA的提取22-23
• 2.2.2 PCR擴(kuò)增23-24
• 2.2.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的回收及純化24
• 2.2.4 目的片段的克隆24-26
• 2.3 數(shù)據(jù)分析26-28
• 2.3.1 Acc1基因序列分析27
• 2.3.2 系統(tǒng)發(fā)育27
• 2.3.3 多態(tài)性分析27-28
• 3. 結(jié)果分析28-42
• 3.1 Acc1基因序列分析28-31
• 3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析31-36
• 3.3 多態(tài)性分析36-39
• 3.3.1 核苷酸多態(tài)性分析36-37
• 3.3.2 dn/ds及其Z值檢測分析37-38
• 3.3.3 共享多態(tài)性位點(diǎn)和固定不同核苷酸位點(diǎn)分析38-39
• 3.4 冰草居群內(nèi)遺傳變異和遺傳分化39-42
• 3.4.1 遺傳距離39-40
• 3.4.2 冰草居群間的遺傳分化指數(shù)Fst值和基因流Nm值40-42
• 4. 討論42-48
• 4.1 仲彬草屬中P染色體組的系統(tǒng)發(fā)育42-43
• 4.2 不同冰草居群的遺傳分化43-45
• 4.3 Acc1基因在P染色體組中的分子進(jìn)化45-46
• 4.3.1 仲彬草屬及相同地區(qū)二倍體冰草的分子進(jìn)化45
• 4.3.2 仲彬草屬和相同地區(qū)四倍體冰草的分子進(jìn)化45-46
• 4.3.3 二倍體冰草和四倍體冰草中的分子進(jìn)化46
• 4.4 Y染色體組的可能起源46-48
• 5. 結(jié)論48-49
• 參考文獻(xiàn)49-57
• 致謝57

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  本文關(guān)鍵詞：Acc1基因在仲彬草屬P染色體組中的系統(tǒng)發(fā)育及分子進(jìn)化，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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