小麥?zhǔn)俏覈匾闹骷Z之一,沉淀值作為小麥品質(zhì)性狀組成之一,對(duì)小麥育種和食品加工有重要影響。沉淀值是評(píng)價(jià)小麥面筋含量重要指標(biāo)之一,與面包體積和面團(tuán)形成、穩(wěn)定時(shí)間等有密切關(guān)系。因此,對(duì)小麥沉淀值及其遺傳規(guī)律進(jìn)行研究,對(duì)于小麥育種和品質(zhì)改良有著重要意義。本文利用660K基因芯片基因分型,通過收集的493份小麥核心種質(zhì)材料進(jìn)行沉淀值的全基因組關(guān)聯(lián)分析,通過2年時(shí)間3個(gè)地區(qū)5個(gè)環(huán)境下種植與面粉沉淀值測定,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析解析沉淀值遺傳控制機(jī)理。主要研究結(jié)果如下:(1)參試材料屬于自然群體,群體結(jié)構(gòu)分析表明,本研究所用材料適合做全基因組關(guān)聯(lián)分析,材料間親緣關(guān)系較遠(yuǎn),只有43份材親緣關(guān)系較近,符合全基因組關(guān)聯(lián)分析材料約占總材料的92%,對(duì)結(jié)果準(zhǔn)確性和可信度奠定基礎(chǔ)。(2)小麥沉淀值特性在參加試驗(yàn)的493份材料間的變異較廣泛,且頻率分布成正態(tài)分布,少部分材料在5個(gè)環(huán)境下沉淀值較大,如陜優(yōu)225等。山東(SD)和陜西(SX)環(huán)境下,小麥品質(zhì)較其他3個(gè)環(huán)境明顯提高,SX環(huán)境沉淀值變異最大,其他環(huán)境下基本一致。(3)全基因組關(guān)聯(lián)分析中發(fā)現(xiàn)在1A、1B、1D、6A、7D染色體上都檢測到強(qiáng)遺傳效應(yīng)SNP遺傳...

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 小麥沉淀值及其研究進(jìn)展
        1.1.1 沉淀值的測定方法
        1.1.2 沉淀值影響因素
        1.1.3 環(huán)境對(duì)沉淀值的影響
        1.1.4 基因型對(duì)沉淀值影響
    1.2 關(guān)聯(lián)分析基本方法
        1.2.1 數(shù)量性狀基因座的傳統(tǒng)連鎖作圖
        1.2.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析
        1.2.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析的發(fā)展
        1.2.4 單核苷酸多態(tài)性及基因芯片
        1.2.5 連鎖不平衡
        1.2.6 影響連鎖不平衡的因素
    1.3 研究的目的與意義
    1.4 技術(shù)路線
第二章 沉淀值的全基因組關(guān)聯(lián)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與大田種植
        2.1.2 面粉制備
    2.2 性狀的測定與分析
        2.2.1 沉淀值地測定
        2.2.2 DNA提取與分型
        2.2.3 SNP標(biāo)記的填補(bǔ)與統(tǒng)計(jì)
        2.2.4 表型數(shù)據(jù)
        2.2.5 群體結(jié)構(gòu)分析
        2.2.6 連鎖不平衡分析
        2.2.7 關(guān)聯(lián)分析與SNP位點(diǎn)的篩選
第三章 結(jié)果分析
    3.1 沉淀值數(shù)數(shù)據(jù)分析
    3.2 660K SNP基因芯片分型結(jié)果
    3.3 群體結(jié)構(gòu)分析
    3.4 主成分分析
    3.5 親緣關(guān)系分析
    3.6 連鎖不平衡分析
    3.7 五個(gè)環(huán)境下沉淀值性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
        3.7.1 原始數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析
        3.7.2 基因填補(bǔ)后關(guān)聯(lián)分析
        3.7.3 K=29 時(shí)填補(bǔ)后數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析
        3.7.4 K=29 時(shí)原始數(shù)據(jù)平均值關(guān)聯(lián)分析
    3.8 單倍型Block分析
    3.9 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)優(yōu)異等位變異
第四章 討論
    4.1 小麥沉淀值特性
    4.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析
    4.3 小麥沉淀值關(guān)聯(lián)分析
        4.3.1 群體結(jié)構(gòu)
        4.3.2 混合線性模型選擇
        4.3.3 SNP位點(diǎn)定位
第五章 結(jié)論和展望
    5.1 全文結(jié)論
        5.1.1 沉淀值
        5.1.2 關(guān)聯(lián)分析遺傳標(biāo)記
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
發(fā)表論文及專利情況



本文編號(hào)：3828559