發(fā)布時間：2023-06-03 03:18

　　小麥是我國重要的主糧之一,沉淀值作為小麥品質性狀組成之一,對小麥育種和食品加工有重要影響。沉淀值是評價小麥面筋含量重要指標之一,與面包體積和面團形成、穩(wěn)定時間等有密切關系。因此,對小麥沉淀值及其遺傳規(guī)律進行研究,對于小麥育種和品質改良有著重要意義。本文利用660K基因芯片基因分型,通過收集的493份小麥核心種質材料進行沉淀值的全基因組關聯(lián)分析,通過2年時間3個地區(qū)5個環(huán)境下種植與面粉沉淀值測定,利用全基因組關聯(lián)分析解析沉淀值遺傳控制機理。主要研究結果如下:(1)參試材料屬于自然群體,群體結構分析表明,本研究所用材料適合做全基因組關聯(lián)分析,材料間親緣關系較遠,只有43份材親緣關系較近,符合全基因組關聯(lián)分析材料約占總材料的92%,對結果準確性和可信度奠定基礎。(2)小麥沉淀值特性在參加試驗的493份材料間的變異較廣泛,且頻率分布成正態(tài)分布,少部分材料在5個環(huán)境下沉淀值較大,如陜優(yōu)225等。山東(SD)和陜西(SX)環(huán)境下,小麥品質較其他3個環(huán)境明顯提高,SX環(huán)境沉淀值變異最大,其他環(huán)境下基本一致。(3)全基因組關聯(lián)分析中發(fā)現(xiàn)在1A、1B、1D、6A、7D染色體上都檢測到強遺傳效應SNP遺傳...

【文章頁數】：62 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 小麥沉淀值及其研究進展
        1.1.1 沉淀值的測定方法
        1.1.2 沉淀值影響因素
        1.1.3 環(huán)境對沉淀值的影響
        1.1.4 基因型對沉淀值影響
    1.2 關聯(lián)分析基本方法
        1.2.1 數量性狀基因座的傳統(tǒng)連鎖作圖
        1.2.2 全基因組關聯(lián)分析
        1.2.3 全基因組關聯(lián)分析的發(fā)展
        1.2.4 單核苷酸多態(tài)性及基因芯片
        1.2.5 連鎖不平衡
        1.2.6 影響連鎖不平衡的因素
    1.3 研究的目的與意義
    1.4 技術路線
第二章 沉淀值的全基因組關聯(lián)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實驗材料與大田種植
        2.1.2 面粉制備
    2.2 性狀的測定與分析
        2.2.1 沉淀值地測定
        2.2.2 DNA提取與分型
        2.2.3 SNP標記的填補與統(tǒng)計
        2.2.4 表型數據
        2.2.5 群體結構分析
        2.2.6 連鎖不平衡分析
        2.2.7 關聯(lián)分析與SNP位點的篩選
第三章 結果分析
    3.1 沉淀值數數據分析
    3.2 660K SNP基因芯片分型結果
    3.3 群體結構分析
    3.4 主成分分析
    3.5 親緣關系分析
    3.6 連鎖不平衡分析
    3.7 五個環(huán)境下沉淀值性狀的全基因組關聯(lián)分析
        3.7.1 原始數據關聯(lián)分析
        3.7.2 基因填補后關聯(lián)分析
        3.7.3 K=29 時填補后數據關聯(lián)分析
        3.7.4 K=29 時原始數據平均值關聯(lián)分析
    3.8 單倍型Block分析
    3.9 關聯(lián)位點優(yōu)異等位變異
第四章 討論
    4.1 小麥沉淀值特性
    4.2 全基因組關聯(lián)分析
    4.3 小麥沉淀值關聯(lián)分析
        4.3.1 群體結構
        4.3.2 混合線性模型選擇
        4.3.3 SNP位點定位
第五章 結論和展望
    5.1 全文結論
        5.1.1 沉淀值
        5.1.2 關聯(lián)分析遺傳標記
    5.2 展望
參考文獻
致謝
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本文編號：3828559