小麥2B染色體新EST引物的開發(fā)與一個(gè)抗條銹病小偃麥滲入系的遺傳分析
本文關(guān)鍵詞:小麥2B染色體新EST引物的開發(fā)與一個(gè)抗條銹病小偃麥滲入系的遺傳分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:通過與模式植物短柄草、水稻以及玉米等已知基因組序列的比較基因組來開發(fā)新的標(biāo)記,用于基因的精細(xì)定位、基因克隆和分子標(biāo)記輔助育種,這對于小麥優(yōu)良基因的研究和應(yīng)用具有實(shí)踐和理論價(jià)值。此外條銹病嚴(yán)重危害著小麥產(chǎn)量,條銹菌生理小種的變異致使培育的抗條銹病品種逐漸喪失抗性,對新的抗條銹病基因資源的鑒定和研究是長期而緊迫的任務(wù)。本研究應(yīng)用比較基因組方法,通過小麥2B染色體EST與短柄草、水稻以及玉米基因組序列的比對信息,研究該染色體與其他三個(gè)基因組的同源性關(guān)系,根據(jù)共線性區(qū)段內(nèi)基因設(shè)計(jì)新的EST引物,進(jìn)行引物的染色體定位及有效性分析。另外我們對一個(gè)小偃麥滲入系材料11C666-3進(jìn)行了抗性鑒定和遺傳分析。獲得如下研究結(jié)果:1、小麥2B染色體上EST序列和三個(gè)基因組序列比對結(jié)果顯示,在三個(gè)基因組中共分布有同源性位點(diǎn)1125個(gè),其中玉米中287個(gè),水稻中299個(gè),短柄草中539個(gè),短柄草的Bd1、Bd5水稻的Os7、Os3以及玉米的Zm7與小麥染色體2B具有較高同源性。2、短柄草Bdl染色體的13467797bp-17757616bp區(qū)段內(nèi)集中分布70個(gè)同源性位點(diǎn),該區(qū)段與小麥2B染色體存在共線性的關(guān)系。3、根據(jù)短柄草Bdl染色體上的共線性區(qū)段,下載并篩選該區(qū)段內(nèi)的短柄草基因,利用其序列設(shè)計(jì)了242條EST引物,并用中國春缺體-四體系將162條引物定位到了小麥染色體上,其中38對引物在小麥2B染色體上有擴(kuò)增位點(diǎn)。4、運(yùn)用13個(gè)小麥品種(系)及材料11C666-3對染色體已定位的162對引物進(jìn)行了擴(kuò)增驗(yàn)證,平均有72.0%引物能擴(kuò)增出豐富條帶,能夠擴(kuò)增的引物所占比率范圍為59.2%-88.2%,有105對引物能在材料11C666-3中擴(kuò)增。多數(shù)引物可以應(yīng)用于不同小麥群體的分子標(biāo)記分析。5、對小偃麥滲入系材料11C666-3進(jìn)行了抗條銹病鑒定和遺傳分析。對材料11C666-3與感病品種綿陽11和臺(tái)長29分別做正反交,Fl自交得F2群體,通過F1、F2分離群體和雙親本田間混合條銹菌接種、抗條銹病鑒定,發(fā)現(xiàn)11C666-3對當(dāng)前流行條銹菌生理小種近免疫,F2抗:感分離比符合3:1的期望值,初步證明該材料的抗銹性由一對顯性核基因控制。
【關(guān)鍵詞】:小麥 比較基因組 分子標(biāo)記 條銹病 小偃麥
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S435.121.42
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-10
- 第一章 文獻(xiàn)綜述10-21
- 1.1 小麥基因組研究現(xiàn)狀10-11
- 1.2 比較基因組學(xué)11-15
- 1.2.1 概念及其方法特點(diǎn)11-12
- 1.2.2 小麥比較基因組學(xué)的研究現(xiàn)狀12-13
- 1.2.3 比較基因組學(xué)的研究價(jià)值13-15
- 1.3 分子標(biāo)記技術(shù)15-18
- 1.3.1 分子標(biāo)記技術(shù)概念15
- 1.3.2 分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn)15
- 1.3.3 分子標(biāo)記技術(shù)研究現(xiàn)狀15-18
- 1.4 小麥抗條銹病研究進(jìn)展18-19
- 1.5 研究目的及意義19-20
- 1.6 技術(shù)路線20-21
- 第二章 小麥2B染色體上新EST引物的開發(fā)21-35
- 2.1 前言21
- 2.2 材料與方法21-26
- 2.2.1 試驗(yàn)材料21-22
- 2.2.2 主要儀器22
- 2.2.3 研究方法22-26
- 2.3 結(jié)果與分析26-32
- 2.3.1 小麥EST序列與三個(gè)基因組比對26-29
- 2.3.2 小麥2B與短柄草Bd1的共線性區(qū)段及引物設(shè)計(jì)29-30
- 2.3.3 引物染色體定位30-31
- 2.3.4 引物的有效性分析31-32
- 2.4 討論32-34
- 2.4.1 小麥2B上EST序列與其他三個(gè)基因組的比對分析32-33
- 2.4.2 小麥染色體2B與短柄草染色體Bd1同源性33
- 2.4.3 新設(shè)計(jì)EST引物染色體定位分析33-34
- 2.5 結(jié)論34-35
- 第三章 一個(gè)抗條銹病小偃麥滲入系的遺傳分析35-41
- 3.1 前言35
- 3.2 材料與方法35-37
- 3.2.1 小麥資源35-36
- 3.2.2 條銹菌菌株36
- 3.2.3 遺傳群體構(gòu)建36
- 3.2.4 抗性鑒定36-37
- 3.3 結(jié)果與分析37-39
- 3.3.1 11C666-3抗條銹性特征37-38
- 3.3.2 11C666-3抗性基因的遺傳分析38-39
- 3.4 討論39-40
- 3.4.1 小偃麥滲入系11C666-3抗性評價(jià)39-40
- 3.4.2 11C666-3抗性基因遺傳40
- 3.5 結(jié)論40-41
- 參考文獻(xiàn)41-48
- 致謝48-49
- 附(表格)49-59
- 攻讀學(xué)位期間參與發(fā)表的學(xué)術(shù)論文59
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,本文編號(hào):360240
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