滇重樓內(nèi)生真菌來源雜二萜化合物的基因組導(dǎo)向挖掘
發(fā)布時間:2022-01-20 01:21
植物內(nèi)生真菌與宿主植物長期共存,進化出了獨特的代謝機制。從這些代謝產(chǎn)物中尋找具有藥用價值的活性分子,是當前新藥及成藥前體來源的重要途徑。藥用植物內(nèi)生真菌來源于傳統(tǒng)藥用植物,更有可能產(chǎn)生具有生物活性的代謝產(chǎn)物。其中,雜二萜化合物由于普遍具有抗癌抗腫瘤等活性,受到廣泛關(guān)注。本文以聚酮-二萜(PK-DTs)雜化分子為目標,從云南梁王山產(chǎn)滇重樓Paris polyphylla var.yunnanensis植株內(nèi)分離得到的34株內(nèi)生真菌中篩選了適合我們研究的基因簇:經(jīng)過基因組測序和生物信息學(xué)分析,并與已知雜二萜化合物生物合成途徑相關(guān)的基因簇進行比對發(fā)現(xiàn),其中一株內(nèi)生真菌Aspergillus versicolor0312的第19基因簇可能與雜二萜化合物的生物合成途徑有關(guān)。據(jù)此,我們用異源表達策略開展了該基因簇的天然產(chǎn)物研究:在滇重樓內(nèi)生真菌0312的基因組內(nèi)鑒定了chevalon E(1)及其氧化衍生物的生物合成基因簇,并在異源表達宿主Aspergillus oryzae NSAR1中成功地重構(gòu)了該生物合成途徑。研究發(fā)現(xiàn),兩種細胞色素P450單加氧酶cle2和cle4,能將chevalon E...
【文章來源】:云南民族大學(xué)云南省
【文章頁數(shù)】:112 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
本研究所用技術(shù)路線
云南民族大學(xué)碩士學(xué)位論文23圖3.1滇重樓內(nèi)生真菌Aspergillusversicolor0312(左)和Aspergillusfelis0260(右)據(jù)此,我們對這兩株內(nèi)生真菌進行了新一代全基因組測序。3.2.1全基因組測序為了尋找Aspergillusversicolor0312和Aspergillusfelis0260中適合基因組挖掘研究的雜二萜因簇,我們將這兩株內(nèi)生真菌進行了第三代全基因組測序。我們偶然發(fā)現(xiàn)0312菌株在不同培養(yǎng)基中生長狀態(tài)差別很大,因此,對其進行了培養(yǎng)基的篩選實驗:利用實驗室常用的MEA培養(yǎng)基、PDB培養(yǎng)基、DPY培養(yǎng)基,在搖床內(nèi)使用相同條件振蕩培養(yǎng)(圖3.2),觀察發(fā)現(xiàn)PDB培養(yǎng)基生長狀態(tài)最佳,長得最快,并且菌絲均勻,其次是MEA培養(yǎng)基,而在DPY培養(yǎng)基內(nèi)長得最差。隨后,我們又對恒溫搖床設(shè)置了不同的溫度,觀察發(fā)現(xiàn)0312在25℃,200rpm/min條件下,長得最快,溫度升高,反而極大地抑制了其生長,低于25℃,生長也比較緩慢。因此,25℃,200rpm/min是0312菌株最佳的培養(yǎng)條件。圖3.2對Aspergillusversicolor0312篩選培養(yǎng)基
云南民族大學(xué)碩士學(xué)位論文23圖3.1滇重樓內(nèi)生真菌Aspergillusversicolor0312(左)和Aspergillusfelis0260(右)據(jù)此,我們對這兩株內(nèi)生真菌進行了新一代全基因組測序。3.2.1全基因組測序為了尋找Aspergillusversicolor0312和Aspergillusfelis0260中適合基因組挖掘研究的雜二萜因簇,我們將這兩株內(nèi)生真菌進行了第三代全基因組測序。我們偶然發(fā)現(xiàn)0312菌株在不同培養(yǎng)基中生長狀態(tài)差別很大,因此,對其進行了培養(yǎng)基的篩選實驗:利用實驗室常用的MEA培養(yǎng)基、PDB培養(yǎng)基、DPY培養(yǎng)基,在搖床內(nèi)使用相同條件振蕩培養(yǎng)(圖3.2),觀察發(fā)現(xiàn)PDB培養(yǎng)基生長狀態(tài)最佳,長得最快,并且菌絲均勻,其次是MEA培養(yǎng)基,而在DPY培養(yǎng)基內(nèi)長得最差。隨后,我們又對恒溫搖床設(shè)置了不同的溫度,觀察發(fā)現(xiàn)0312在25℃,200rpm/min條件下,長得最快,溫度升高,反而極大地抑制了其生長,低于25℃,生長也比較緩慢。因此,25℃,200rpm/min是0312菌株最佳的培養(yǎng)條件。圖3.2對Aspergillusversicolor0312篩選培養(yǎng)基
【參考文獻】:
期刊論文
[1]重樓屬植物在少數(shù)民族醫(yī)藥中的應(yīng)用[J]. 劉玉雨,徐福榮,范敏,段寶忠. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2019(03)
[2]冬凌草甲素抗癌活性的研究進展[J]. 欒劍,董慧婷,郭海勇. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2018(20)
[3]滇重樓(Paris polyphylla var.yunnanensis)的內(nèi)生細菌的分離與鑒定[J]. 廖秋紅,李艷冰,劉琴,楊生超,劉濤. 分子植物育種. 2018(18)
[4]Sansanmycin生物合成基因簇在天藍色鏈霉菌中的異源表達[J]. 范佳會,侍媛媛,江志波,李星星,雷璇,解云英,王麗非,洪斌. 藥學(xué)學(xué)報. 2018(06)
[5]中藥重樓的抗炎作用機制研究進展[J]. 熊偉,陳思如,修光輝,凌斌,孫潔,劉萍. 云南中醫(yī)中藥雜志. 2018(01)
[6]微生態(tài)學(xué)與后抗生素時代[J]. 王世榮,岳壽松. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2017(08)
[7]重樓皂苷Ⅰ對人肝癌細胞MHCC97-H增殖、周期、凋亡的影響[J]. 曾普華,葉書林,王佳佳,李為,劉丹,賀佐梅,鄧天好,周芳,郜文輝. 云南中醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2017(03)
[8]重樓皂苷Ⅰ對肺癌循環(huán)腫瘤細胞凋亡及周期的影響[J]. 王青,闕祖俊,羅斌,鄭婷婷,田建輝. 上海中醫(yī)藥雜志. 2017(05)
[9]滇重樓內(nèi)生真菌多樣性分析[J]. 段榮婷,李洪濤,李紅玉,周皓,楊雪瓊,蔡樂,楊亞濱. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報. 2017(09)
[10]合成生物學(xué)在天然產(chǎn)物研究中的應(yīng)用[J]. 王麗蘋,羅云孜. 生物技術(shù)通報. 2017(01)
碩士論文
[1]6-Hydroxymellein及類似物和Ansaspirolide的合成研究[D]. 劉金楊.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]中藥活性成分重樓皂苷Ⅵ抑制肺鱗癌細胞增殖的機制研究[D]. 徐俊.浙江大學(xué) 2018
[3]白僵菌素在構(gòu)巢曲霉中異源表達的研究[D]. 孫安徽.安徽大學(xué) 2016
[4]基因組導(dǎo)向的Streptomyces sp.SS中天然產(chǎn)物及其生物合成基因簇的發(fā)現(xiàn)[D]. 張寧寧.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2016
[5]基于遺傳改造發(fā)掘深海鏈霉菌Streptomyces somaliensis SCSIO ZH66的次級代謝產(chǎn)物[D]. 侯路寬.中國海洋大學(xué) 2015
[6]香茶菜屬二萜類化合物抗腫瘤作用的構(gòu)效關(guān)系及其分子機制研究[D]. 梁宇光.中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2007
本文編號:3597914
【文章來源】:云南民族大學(xué)云南省
【文章頁數(shù)】:112 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
本研究所用技術(shù)路線
云南民族大學(xué)碩士學(xué)位論文23圖3.1滇重樓內(nèi)生真菌Aspergillusversicolor0312(左)和Aspergillusfelis0260(右)據(jù)此,我們對這兩株內(nèi)生真菌進行了新一代全基因組測序。3.2.1全基因組測序為了尋找Aspergillusversicolor0312和Aspergillusfelis0260中適合基因組挖掘研究的雜二萜因簇,我們將這兩株內(nèi)生真菌進行了第三代全基因組測序。我們偶然發(fā)現(xiàn)0312菌株在不同培養(yǎng)基中生長狀態(tài)差別很大,因此,對其進行了培養(yǎng)基的篩選實驗:利用實驗室常用的MEA培養(yǎng)基、PDB培養(yǎng)基、DPY培養(yǎng)基,在搖床內(nèi)使用相同條件振蕩培養(yǎng)(圖3.2),觀察發(fā)現(xiàn)PDB培養(yǎng)基生長狀態(tài)最佳,長得最快,并且菌絲均勻,其次是MEA培養(yǎng)基,而在DPY培養(yǎng)基內(nèi)長得最差。隨后,我們又對恒溫搖床設(shè)置了不同的溫度,觀察發(fā)現(xiàn)0312在25℃,200rpm/min條件下,長得最快,溫度升高,反而極大地抑制了其生長,低于25℃,生長也比較緩慢。因此,25℃,200rpm/min是0312菌株最佳的培養(yǎng)條件。圖3.2對Aspergillusversicolor0312篩選培養(yǎng)基
云南民族大學(xué)碩士學(xué)位論文23圖3.1滇重樓內(nèi)生真菌Aspergillusversicolor0312(左)和Aspergillusfelis0260(右)據(jù)此,我們對這兩株內(nèi)生真菌進行了新一代全基因組測序。3.2.1全基因組測序為了尋找Aspergillusversicolor0312和Aspergillusfelis0260中適合基因組挖掘研究的雜二萜因簇,我們將這兩株內(nèi)生真菌進行了第三代全基因組測序。我們偶然發(fā)現(xiàn)0312菌株在不同培養(yǎng)基中生長狀態(tài)差別很大,因此,對其進行了培養(yǎng)基的篩選實驗:利用實驗室常用的MEA培養(yǎng)基、PDB培養(yǎng)基、DPY培養(yǎng)基,在搖床內(nèi)使用相同條件振蕩培養(yǎng)(圖3.2),觀察發(fā)現(xiàn)PDB培養(yǎng)基生長狀態(tài)最佳,長得最快,并且菌絲均勻,其次是MEA培養(yǎng)基,而在DPY培養(yǎng)基內(nèi)長得最差。隨后,我們又對恒溫搖床設(shè)置了不同的溫度,觀察發(fā)現(xiàn)0312在25℃,200rpm/min條件下,長得最快,溫度升高,反而極大地抑制了其生長,低于25℃,生長也比較緩慢。因此,25℃,200rpm/min是0312菌株最佳的培養(yǎng)條件。圖3.2對Aspergillusversicolor0312篩選培養(yǎng)基
【參考文獻】:
期刊論文
[1]重樓屬植物在少數(shù)民族醫(yī)藥中的應(yīng)用[J]. 劉玉雨,徐福榮,范敏,段寶忠. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2019(03)
[2]冬凌草甲素抗癌活性的研究進展[J]. 欒劍,董慧婷,郭海勇. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2018(20)
[3]滇重樓(Paris polyphylla var.yunnanensis)的內(nèi)生細菌的分離與鑒定[J]. 廖秋紅,李艷冰,劉琴,楊生超,劉濤. 分子植物育種. 2018(18)
[4]Sansanmycin生物合成基因簇在天藍色鏈霉菌中的異源表達[J]. 范佳會,侍媛媛,江志波,李星星,雷璇,解云英,王麗非,洪斌. 藥學(xué)學(xué)報. 2018(06)
[5]中藥重樓的抗炎作用機制研究進展[J]. 熊偉,陳思如,修光輝,凌斌,孫潔,劉萍. 云南中醫(yī)中藥雜志. 2018(01)
[6]微生態(tài)學(xué)與后抗生素時代[J]. 王世榮,岳壽松. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2017(08)
[7]重樓皂苷Ⅰ對人肝癌細胞MHCC97-H增殖、周期、凋亡的影響[J]. 曾普華,葉書林,王佳佳,李為,劉丹,賀佐梅,鄧天好,周芳,郜文輝. 云南中醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2017(03)
[8]重樓皂苷Ⅰ對肺癌循環(huán)腫瘤細胞凋亡及周期的影響[J]. 王青,闕祖俊,羅斌,鄭婷婷,田建輝. 上海中醫(yī)藥雜志. 2017(05)
[9]滇重樓內(nèi)生真菌多樣性分析[J]. 段榮婷,李洪濤,李紅玉,周皓,楊雪瓊,蔡樂,楊亞濱. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報. 2017(09)
[10]合成生物學(xué)在天然產(chǎn)物研究中的應(yīng)用[J]. 王麗蘋,羅云孜. 生物技術(shù)通報. 2017(01)
碩士論文
[1]6-Hydroxymellein及類似物和Ansaspirolide的合成研究[D]. 劉金楊.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]中藥活性成分重樓皂苷Ⅵ抑制肺鱗癌細胞增殖的機制研究[D]. 徐俊.浙江大學(xué) 2018
[3]白僵菌素在構(gòu)巢曲霉中異源表達的研究[D]. 孫安徽.安徽大學(xué) 2016
[4]基因組導(dǎo)向的Streptomyces sp.SS中天然產(chǎn)物及其生物合成基因簇的發(fā)現(xiàn)[D]. 張寧寧.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2016
[5]基于遺傳改造發(fā)掘深海鏈霉菌Streptomyces somaliensis SCSIO ZH66的次級代謝產(chǎn)物[D]. 侯路寬.中國海洋大學(xué) 2015
[6]香茶菜屬二萜類化合物抗腫瘤作用的構(gòu)效關(guān)系及其分子機制研究[D]. 梁宇光.中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2007
本文編號:3597914
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