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不同源大腸桿菌耐藥性及整合子—基因盒研究

發(fā)布時間:2017-05-06 12:15

  本文關(guān)鍵詞:不同源大腸桿菌耐藥性及整合子—基因盒研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:抗菌藥物在醫(yī)學(xué)臨床、養(yǎng)殖業(yè)等領(lǐng)域大量使用,使細菌的耐藥性不斷增加,多重耐藥現(xiàn)象越來越嚴重,這給我們敲響了警鐘,耐藥性問題引起了各國的重視。大腸桿菌作為腸道重要的棲居菌之一,承受著不同藥物的誘導(dǎo)和選擇壓力,導(dǎo)致大腸桿菌耐藥性十分嚴重,使其也成為耐藥基因儲庫和交換的重要場所。本次研究從不同地區(qū)采集食品動物(豬,牛,雞)、寵物犬、大熊貓糞樣以及大熊貓生活環(huán)境樣本中分離、純化和鑒定出588株大腸桿菌。依據(jù)美國臨床實驗室標準化委員會(CLSI)推薦的紙片法及結(jié)果判斷標準,對所有分離的大腸桿菌菌株檢測其對13種抗菌藥物的耐藥性。結(jié)果顯示,588株大腸桿菌對13種抗菌藥物呈不同水平的耐藥性(耐藥率在7.48-80.44%),其中對氨芐西林、四環(huán)素、氟苯尼考和復(fù)方新諾明呈很高耐藥性(耐藥率超過70%),而對左氧氟沙星,阿米卡星,頭孢噻肟則呈較低耐藥性(耐藥率低于14%)。93.5%的菌株呈多重耐藥性,多重耐藥菌株主要為5-11耐。不同來源菌株耐藥性比較發(fā)現(xiàn),寵物犬源大腸桿菌對環(huán)丙沙星、氨芐西林、頭孢噻肟和阿米卡星的耐藥率極顯著高于其他源菌株(P0.01);食品動物源菌株對氟苯尼考,鏈霉素,諾氟沙星,四環(huán)素、頭孢曲松和氨曲南藥物耐藥率高于其他來源菌株,尤其對氟苯尼考,頭孢曲松,氨曲南和復(fù)方新諾明的耐藥率與其他源菌株有極顯著差異性(P0.01);大熊貓糞源和環(huán)境源菌株對多數(shù)藥物呈較低水平耐藥(耐藥率低于20.7%)。從588株大腸桿菌中隨機選取320株,通過PCR法擴增其整合酶1型、2型和3型基因。結(jié)果顯示,食品動物源菌株1類整合子檢出率最高為69.70%(138株/198株),其中,豬源、雞源和牛源分別為76.92%、71.79%和58.18%;犬源檢出率為64.10%;大熊貓源和環(huán)境源檢出率分別為50.75%和31.25%。2類整合子檢測發(fā)現(xiàn),2株豬源菌和2株雞源菌同時檢測出1型整合子和2型整合子;未檢測出3類整合子。隨機抽取145株1類整合子陽性菌,對其基因盒可變區(qū)進行PCR擴增和測序,結(jié)果顯示:食品動物源、犬源、大熊貓糞源及環(huán)境源菌株基因盒檢出率分別為91.36%、88.0%、58.82%和80.0%,檢出的基因盒共有7種,基因盒基因排列分別為dfrA27、dfrA17、aadA2, dfrA1-orfC, dfrA27-aadA2, aacA4-aadA1-catB2和dfrA12-orfF-aadA2。對4株2類整合子陽性菌株基因盒可變區(qū)檢測發(fā)現(xiàn),有2種不同類型的基因盒,分別為dfrA1-sat2-aadA1(1株)和dfrA1-sat2(3株)。本次對食品動物源、犬源、大熊貓糞源和環(huán)境源大腸桿菌耐藥性及整合子-基因盒研究發(fā)現(xiàn),不同源大腸桿菌對13種抗菌藥物呈不同水平的耐藥性,耐藥性與菌株來源有關(guān),其中犬源菌株耐藥性最嚴重,其次是食品動物源,大熊貓糞源及其生活環(huán)境源菌株耐藥性較低,耐藥菌株呈多重耐藥性:耐藥菌株中廣泛攜帶1類整合子,整合子-基因盒分子特征以介導(dǎo)氨基糖苷類和磺胺-甲氧芐啶類耐藥的aadA和dfrA基因類型為主;菌株的耐藥表型與其所攜帶的基因盒有一定的相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:大腸桿菌 不同源 耐藥性 整合子-基因盒
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S852.61
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-8
  • 縮略詞表8-13
  • 第一章 研究背景及目的意義13-26
  • 1 研究背景13-25
  • 1.1 大腸桿菌概述13-14
  • 1.2 不同源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀14-16
  • 1.2.1 寵物源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀14
  • 1.2.2 食品動物源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀14-15
  • 1.2.3 野生動物源及環(huán)境源大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀15-16
  • 1.3 大腸桿菌的耐藥機制16-18
  • 1.3.1 酶對抗生素的修飾和水解17
  • 1.3.2 抗生素作用靶點改變17
  • 1.3.3 細菌細胞膜通透性改變17
  • 1.3.4 細菌藥物外排系統(tǒng)17-18
  • 1.3.5 耐藥基因的轉(zhuǎn)移機制18
  • 1.4 整合子-基因盒系統(tǒng)18-25
  • 1.4.1 整合子結(jié)構(gòu)及分類19-20
  • 1.4.2 整合子的分布20-21
  • 1.4.3 基因盒結(jié)構(gòu)和功能21-23
  • 1.4.4 整合子-基因盒系統(tǒng)與大腸桿菌多重耐藥性的關(guān)系23-25
  • 1.4.5 整合子的檢測方法25
  • 2 研究目的及意義25-26
  • 第二章 不同源大腸桿菌的分離鑒定及耐藥性檢測26-38
  • 1 材料與方法26-30
  • 1.1 材料26-27
  • 1.1.1 樣品及來源26
  • 1.1.2 標準菌株26
  • 1.1.3 抗菌藥物藥敏紙片26
  • 1.1.4 培養(yǎng)基26-27
  • 1.1.5 細菌生化鑒定管27
  • 1.1.6 其他試劑27
  • 1.1.7 主要儀器與設(shè)備27
  • 1.2 方法27-30
  • 1.2.1 樣品采集27
  • 1.2.2 大腸桿菌分離、鑒定及保存27-28
  • 1.2.3 抗菌藥物的耐藥性檢測28-30
  • 2 結(jié)果與分析30-35
  • 2.1 大腸桿菌分離和鑒定30
  • 2.2 大腸桿菌對13種抗菌藥物的藥敏結(jié)果30-31
  • 2.3 不同源菌株對13種抗菌藥物耐藥情況比較31-33
  • 2.4 588株大腸桿菌對13種抗菌藥物的多重耐藥性33-35
  • 3 討論35-38
  • 3.1 不同源大腸桿菌對13種抗菌藥物的耐藥情況35-36
  • 3.2 規(guī)范使用抗生素,降低抗生素耐藥性36-38
  • 第三章 不同源大腸桿菌整合子-基因盒的檢測38-55
  • 1 材料和方法38-41
  • 1.1 材料38-39
  • 1.1.1 菌株38
  • 1.1.2 試劑38-39
  • 1.1.3 主要設(shè)備及儀器39
  • 1.2 方法39-41
  • 1.2.1 PCR檢測1、2、3型整合酶基因39-40
  • 1.2.2 基因盒的檢測及鑒定40-41
  • 2 結(jié)果與分析41-50
  • 2.1 不同源大腸桿菌菌株整合子的檢測結(jié)果及分析41-43
  • 2.1.1 PCR擴增不同類型整合子的檢測結(jié)果41-42
  • 2.1.2 不同源大腸桿菌1、2類整合子檢出情況及分布42-43
  • 2.2 不同源大腸桿菌整合子.基因盒流行特征43-47
  • 2.2.1 不同源大腸桿菌1類整合子-基因盒可變區(qū)PCR擴增及測序43-46
  • 2.2.2 不同源大腸桿菌2類整合子-基因盒PCR擴增及測序結(jié)果46-47
  • 2.3 整合子基因盒與耐藥表型的關(guān)系47-50
  • 3 討論50-55
  • 3.1 不同源大腸桿菌菌株整合子流行情況51-52
  • 3.2 不同源大腸桿菌菌株整合子-基因盒的檢測52-53
  • 3.3 整合子-基因盒與細菌耐性之間的關(guān)系53-55
  • 第四章 結(jié)論和創(chuàng)新55-57
  • 1 結(jié)論55-56
  • 2 創(chuàng)新56-57
  • 參考文獻57-65
  • 致謝65-66
  • 攻讀碩士期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文66

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4 王s

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