桑樹(shù)韌皮部汁液蛋白質(zhì)的鑒定及Mul-BRD1蛋白的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-08 16:32
桑樹(shù)是家蠶的主要飼料樹(shù)種,且有很高的生態(tài)價(jià)值、經(jīng)濟(jì)價(jià)值和藥用價(jià)值。鹽和干旱是影響桑樹(shù)生長(zhǎng)的重要環(huán)境因素,提高桑樹(shù)抵抗逆境脅迫的能力有利于促進(jìn)蠶業(yè)生產(chǎn)發(fā)展和桑樹(shù)生態(tài)價(jià)值、經(jīng)濟(jì)價(jià)值和藥用價(jià)值的實(shí)現(xiàn)。桑樹(shù)韌皮部汁液中含有豐富的蛋白質(zhì),在信號(hào)傳遞、物質(zhì)運(yùn)輸和植物防御等方面具有重要作用。因此,對(duì)韌皮部汁液蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定并對(duì)其功能進(jìn)行研究,有助于揭示桑樹(shù)的抗逆機(jī)制,為桑樹(shù)抗性育種提供候選基因。本課題對(duì)桑樹(shù)韌皮部汁液蛋白質(zhì)組進(jìn)行了高通量分析,對(duì)鑒定到的溴結(jié)構(gòu)域蛋白(Bromodomain-containing protein 1)基因(Mul-BRD1)進(jìn)行了克隆,并對(duì)其表達(dá)特性和生物學(xué)功能進(jìn)行了研究,同時(shí)篩選鑒定出了Mul-BRD1蛋白的相互作用蛋白質(zhì)。研究結(jié)果有助于深入了解植物韌皮部的功能及其對(duì)環(huán)境響應(yīng)的分子機(jī)制和信號(hào)傳導(dǎo)途徑,為桑樹(shù)抗性育種提供了候選基因,同時(shí)也為深入研究Mul-BRD1基因的作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。本研究的主要結(jié)果如下:(1)桑樹(shù)韌皮部汁液蛋白質(zhì)組研究利用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)對(duì)桑樹(shù)韌皮部汁液蛋白質(zhì)組進(jìn)行了高通量分析,鑒定了712種蛋白質(zhì),其功能可分為20類(lèi),其中最豐富的類(lèi)別是與...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:115 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
溴結(jié)構(gòu)域蛋白的分類(lèi)(Filippakopoulosetal.,2012)
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文23凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè),并用膠回收試劑盒回收所酶切的目的DNA條帶。將DNA目的片段與經(jīng)過(guò)同樣雙酶切的植物表達(dá)載體pBI121相連接,連接反應(yīng)體系如下:將上述反應(yīng)液加入到已滅菌的250μL離心管中,通過(guò)移液槍吹吸混勻,16C過(guò)夜連接12h。取適量連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),用涂布器涂布于含有卡那霉素(Kan+)抗生素的固體LB培養(yǎng)基中過(guò)夜培養(yǎng),挑取單克隆進(jìn)行菌液PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增體系和擴(kuò)增條件同2.2.2.3,篩選陽(yáng)性菌株。獲得陽(yáng)性質(zhì)粒后測(cè)序。圖2-1植物表達(dá)載體pBI121-Mul-BRD1構(gòu)建示意圖Fig.2-1ConstructionofplantexpressionvectorpBI121-Mul-BRD12.2.3.3植物表達(dá)載體pROKII-MulBRD1-GFP的構(gòu)建根據(jù)該基因的核苷酸序列信息,設(shè)計(jì)含有酶切位點(diǎn)的特異性引物Mul-BRD1-5"(BamHI)和Mul-BRD1-3"(KpnI),并用帶有酶切位點(diǎn)的引物,以陽(yáng)性質(zhì)粒DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件和體系同2.2.2.3,回收目的基因片段,連接克隆載體pMD19-T并轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,菌液PCR篩選陽(yáng)性克隆,擴(kuò)增體系和條件同2.2.2.3,按照步驟2.2.3.1提取陽(yáng)性質(zhì)粒,進(jìn)行雙酶切,雙酶切反應(yīng)以及表達(dá)載體與目的片段連反應(yīng)液體積目的DNA片段(50ng/μL)5.5μL酶切后質(zhì)粒載體(21ng/μL)2.0μLT4Buffer2.0μLT4DNA連接酶(10U/μL)0.5μLTotal10.0μLSalⅠ35SpromoteroriKanrBamHⅠMul-BRD1SalⅠ35SpromoteroriKanrGUSBamHIpBI121T4LigaseBamHⅠSalⅠMul-BRD1BamHⅠ+SalⅠpBI121-Mul-BRD1
桑樹(shù)韌皮部汁液蛋白質(zhì)的鑒定及Mul-BRD1蛋白的功能研究24接轉(zhuǎn)化獲得陽(yáng)性質(zhì)粒體系同2.2.3.2。圖2-2植物表達(dá)載體pROKII-MulBRD1-GFP構(gòu)建示意圖Fig.2-2ConstructionofplantexpressionvectorpROKII-MulBRD1-GFP2.2.4轉(zhuǎn)基因擬南芥的獲得2.2.4.1農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化(1)從-80C冰箱中取保存的農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞,置于冰上融化。(2)在超凈工作臺(tái)中操作,吸取40μL感受態(tài)細(xì)胞放于干凈的1.5mL離心管中,向其加入適量重組質(zhì)粒DNA,用移液槍輕輕吹吸混勻,在冰盒上靜置30min。(3)將液氮倒入保溫桶中,隨后立即用液氮處理加入重組質(zhì)粒的感受態(tài)細(xì)胞1min,再于37℃中水浴5min。(4)在超凈工作臺(tái)上,向離心管中加入960μL不含任何抗生素的LB液體培養(yǎng)基,28C恒溫震蕩培養(yǎng)箱,250rpm培養(yǎng)3h,室溫,7000g離心1min,棄上清,加入100μLLB液體培養(yǎng)基吸打沉淀,懸浮菌體。(5)吸取40μL懸浮細(xì)胞涂布于含50mg/LKan+的LB固體培養(yǎng)皿上,28C倒置培養(yǎng)36-48h。(6)挑取單個(gè)菌落接種于含有400μLLB(50mg/LKan+)液體培養(yǎng)基的1.5mL離心管中,于28C培養(yǎng)箱震蕩培養(yǎng)5-7h。(7)菌液PCR檢測(cè):以1μL培養(yǎng)的菌液為模板,進(jìn)行菌液PCR鑒定,反應(yīng)體系同2.2.2.3。(8)選取得到的陽(yáng)性克隆菌液,接種于含有10mLLB(50mg/LKan+)液體培養(yǎng)基的50mL錐形瓶中過(guò)夜培養(yǎng)14-16h后加甘油保存菌種(菌液:甘油=3:1),于-80C保KpnⅠ35SpromoteroriBamHⅠMul-BRD1BamHⅠ35SpromoteroriEGFPKpnⅠpROKIIT4LigaseBamHⅠKpnⅠMul-BRD1BamHⅠ+KpnⅠpROKII-MulBRD1-GFPEGFP
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]BRD4-DNA相互作用促進(jìn)雙共價(jià)的染色質(zhì)結(jié)合[J]. 谷銳銳,韓欣冶,喻笛,賈艷杰,王琪,曾雷. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2020(05)
[2]水稻響應(yīng)缺鐵的韌皮部汁液蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 陳琳,林焱,陳鵬飛,王紹華,丁艷鋒. 植物學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]芹菜韌皮部蛋白質(zhì)AgPP2-2基因的克隆與表達(dá)[J]. 賈曉玲,王楓,馬靜,劉君,徐馨琰,熊愛(ài)生. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(02)
[4]乙酰轉(zhuǎn)移酶MYST家族的生物學(xué)功能[J]. 黃國(guó)濱,劉新光,陳維春. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2014(03)
博士論文
[1]溴結(jié)構(gòu)域蛋白BRD4維持胃癌細(xì)胞高侵襲轉(zhuǎn)移特性的作用及機(jī)制研究[D]. 覃中毅.中國(guó)人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué) 2019
[2]南瓜韌皮液mRNA結(jié)合蛋白的純化與CmRBP50核糖核蛋白復(fù)合體形成的分子機(jī)制[D]. 李蘋(píng)芳.浙江大學(xué) 2011
碩士論文
[1]桑樹(shù)韌皮部汁液mul-miR482和mul-miR58的生物學(xué)功能研究[D]. 郭方月.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]桑樹(shù)韌皮部汁液植原體響應(yīng)基因的研究[D]. 袁傳忠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3330297
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:115 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
溴結(jié)構(gòu)域蛋白的分類(lèi)(Filippakopoulosetal.,2012)
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文23凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè),并用膠回收試劑盒回收所酶切的目的DNA條帶。將DNA目的片段與經(jīng)過(guò)同樣雙酶切的植物表達(dá)載體pBI121相連接,連接反應(yīng)體系如下:將上述反應(yīng)液加入到已滅菌的250μL離心管中,通過(guò)移液槍吹吸混勻,16C過(guò)夜連接12h。取適量連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),用涂布器涂布于含有卡那霉素(Kan+)抗生素的固體LB培養(yǎng)基中過(guò)夜培養(yǎng),挑取單克隆進(jìn)行菌液PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增體系和擴(kuò)增條件同2.2.2.3,篩選陽(yáng)性菌株。獲得陽(yáng)性質(zhì)粒后測(cè)序。圖2-1植物表達(dá)載體pBI121-Mul-BRD1構(gòu)建示意圖Fig.2-1ConstructionofplantexpressionvectorpBI121-Mul-BRD12.2.3.3植物表達(dá)載體pROKII-MulBRD1-GFP的構(gòu)建根據(jù)該基因的核苷酸序列信息,設(shè)計(jì)含有酶切位點(diǎn)的特異性引物Mul-BRD1-5"(BamHI)和Mul-BRD1-3"(KpnI),并用帶有酶切位點(diǎn)的引物,以陽(yáng)性質(zhì)粒DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件和體系同2.2.2.3,回收目的基因片段,連接克隆載體pMD19-T并轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,菌液PCR篩選陽(yáng)性克隆,擴(kuò)增體系和條件同2.2.2.3,按照步驟2.2.3.1提取陽(yáng)性質(zhì)粒,進(jìn)行雙酶切,雙酶切反應(yīng)以及表達(dá)載體與目的片段連反應(yīng)液體積目的DNA片段(50ng/μL)5.5μL酶切后質(zhì)粒載體(21ng/μL)2.0μLT4Buffer2.0μLT4DNA連接酶(10U/μL)0.5μLTotal10.0μLSalⅠ35SpromoteroriKanrBamHⅠMul-BRD1SalⅠ35SpromoteroriKanrGUSBamHIpBI121T4LigaseBamHⅠSalⅠMul-BRD1BamHⅠ+SalⅠpBI121-Mul-BRD1
桑樹(shù)韌皮部汁液蛋白質(zhì)的鑒定及Mul-BRD1蛋白的功能研究24接轉(zhuǎn)化獲得陽(yáng)性質(zhì)粒體系同2.2.3.2。圖2-2植物表達(dá)載體pROKII-MulBRD1-GFP構(gòu)建示意圖Fig.2-2ConstructionofplantexpressionvectorpROKII-MulBRD1-GFP2.2.4轉(zhuǎn)基因擬南芥的獲得2.2.4.1農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化(1)從-80C冰箱中取保存的農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞,置于冰上融化。(2)在超凈工作臺(tái)中操作,吸取40μL感受態(tài)細(xì)胞放于干凈的1.5mL離心管中,向其加入適量重組質(zhì)粒DNA,用移液槍輕輕吹吸混勻,在冰盒上靜置30min。(3)將液氮倒入保溫桶中,隨后立即用液氮處理加入重組質(zhì)粒的感受態(tài)細(xì)胞1min,再于37℃中水浴5min。(4)在超凈工作臺(tái)上,向離心管中加入960μL不含任何抗生素的LB液體培養(yǎng)基,28C恒溫震蕩培養(yǎng)箱,250rpm培養(yǎng)3h,室溫,7000g離心1min,棄上清,加入100μLLB液體培養(yǎng)基吸打沉淀,懸浮菌體。(5)吸取40μL懸浮細(xì)胞涂布于含50mg/LKan+的LB固體培養(yǎng)皿上,28C倒置培養(yǎng)36-48h。(6)挑取單個(gè)菌落接種于含有400μLLB(50mg/LKan+)液體培養(yǎng)基的1.5mL離心管中,于28C培養(yǎng)箱震蕩培養(yǎng)5-7h。(7)菌液PCR檢測(cè):以1μL培養(yǎng)的菌液為模板,進(jìn)行菌液PCR鑒定,反應(yīng)體系同2.2.2.3。(8)選取得到的陽(yáng)性克隆菌液,接種于含有10mLLB(50mg/LKan+)液體培養(yǎng)基的50mL錐形瓶中過(guò)夜培養(yǎng)14-16h后加甘油保存菌種(菌液:甘油=3:1),于-80C保KpnⅠ35SpromoteroriBamHⅠMul-BRD1BamHⅠ35SpromoteroriEGFPKpnⅠpROKIIT4LigaseBamHⅠKpnⅠMul-BRD1BamHⅠ+KpnⅠpROKII-MulBRD1-GFPEGFP
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]BRD4-DNA相互作用促進(jìn)雙共價(jià)的染色質(zhì)結(jié)合[J]. 谷銳銳,韓欣冶,喻笛,賈艷杰,王琪,曾雷. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2020(05)
[2]水稻響應(yīng)缺鐵的韌皮部汁液蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 陳琳,林焱,陳鵬飛,王紹華,丁艷鋒. 植物學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]芹菜韌皮部蛋白質(zhì)AgPP2-2基因的克隆與表達(dá)[J]. 賈曉玲,王楓,馬靜,劉君,徐馨琰,熊愛(ài)生. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(02)
[4]乙酰轉(zhuǎn)移酶MYST家族的生物學(xué)功能[J]. 黃國(guó)濱,劉新光,陳維春. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2014(03)
博士論文
[1]溴結(jié)構(gòu)域蛋白BRD4維持胃癌細(xì)胞高侵襲轉(zhuǎn)移特性的作用及機(jī)制研究[D]. 覃中毅.中國(guó)人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué) 2019
[2]南瓜韌皮液mRNA結(jié)合蛋白的純化與CmRBP50核糖核蛋白復(fù)合體形成的分子機(jī)制[D]. 李蘋(píng)芳.浙江大學(xué) 2011
碩士論文
[1]桑樹(shù)韌皮部汁液mul-miR482和mul-miR58的生物學(xué)功能研究[D]. 郭方月.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]桑樹(shù)韌皮部汁液植原體響應(yīng)基因的研究[D]. 袁傳忠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3330297
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