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披堿草氫離子焦磷酸化酶(EdHPPase1)基因轉(zhuǎn)化小麥的效應(yīng)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-07-07 12:55
  氫離子轉(zhuǎn)運(yùn)無(wú)機(jī)焦磷酸化酶(H+-PPase)是一類(lèi)區(qū)別于H+-ATPase的H+轉(zhuǎn)運(yùn)酶,對(duì)植物體內(nèi)的生理以及生化過(guò)程具有積極的影響。H+-PPase作為質(zhì)子泵,對(duì)植物抗逆起重要作用。EdHPPase1基因的表達(dá)在模式作物中的功能已被驗(yàn)證,然而對(duì)農(nóng)作物的生理機(jī)制和調(diào)控機(jī)理很少有表明,為了更好的探究EdHPPase1在農(nóng)作物中的功能,本研究分別通過(guò)水培試驗(yàn)和田間試驗(yàn)兩種途徑驗(yàn)證EdHPPase1基因在非生物脅迫下的響應(yīng)。生物信息學(xué)分析表明,披堿草焦磷酸化酶(EdHPPase1)基因開(kāi)放閱讀框共有2310bp,編碼氨基酸770個(gè),且EdHPPase1有15個(gè)跨膜螺旋結(jié)構(gòu),通過(guò)氨基酸序列比對(duì)結(jié)構(gòu)顯示:含有完整的保守域。蛋白同源性對(duì)比發(fā)現(xiàn),與已知羊草、大麥的無(wú)機(jī)焦磷酸化酶蛋白的同源性高達(dá)98%。水培試驗(yàn)下,堿脅迫處理時(shí),生理指標(biāo)顯示,轉(zhuǎn)基因小麥的鮮重含量、相對(duì)含水量顯著高于野生型,失水率較野生型減慢;根系掃描結(jié)果顯示,與野生型相比,披堿草無(wú)機(jī)焦磷酸化酶(EdHPPase1)基因的表達(dá)使轉(zhuǎn)基因小麥根的投影面積、... 

【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

披堿草氫離子焦磷酸化酶(EdHPPase1)基因轉(zhuǎn)化小麥的效應(yīng)分析


比較酵母PPase家族YPPase(1-a)(Heikinheimo,etal.2001)和枯草桿菌PPase

視圖,位點(diǎn)


第一章前言6圖1比較酵母PPase家族YPPase(1-a)(Heikinheimo,etal.2001)和枯草桿菌PPase家族(BsPPase)的底物結(jié)合構(gòu)象的整體功能區(qū)視圖(1-b)(Fabrichniy,etal.2007)以及H+泵綠豆的PPase(1-c)(Lin,etal.2012)。圖所示為結(jié)構(gòu)域,這和圖2都是用PyMol(PyMol分子圖形系統(tǒng),版本1.2r3pre,Schródinger,LLC)繪制的。Fig1.SidebysidecomparisonofoverallribbonviewsofsubstrateboundconformationsofFamilyIyeastPPase(YPPase,1-a)(Heikinheimo,etal.2001),FamilyIIB.subtilisPPase(BsPPase.1-b)(Fabrichniy,etal.2007)andH+‐pumpingmungbeanPPase(VrPPase,1-c)(Lin,etal.2012).Thedomainstructureisshown,ThisandFig.2weredrawnwithPyMol(ThePyMOLMolecularGraphicsSystem,Version1.2r3pre,Schrdinger,LLC).圖2比較了YPPase(2-a)、BsPPase(2-b)和VrPPase(2-c)的水解位點(diǎn),強(qiáng)調(diào)了這三種酶在詳細(xì)的活性位點(diǎn)幾何結(jié)構(gòu)上的差異。在所有情況下,易裂鍵都是垂直的,親核細(xì)胞位于正下方。鍵側(cè)鏈以原子顏色顯示,如Mg2+(綠色)、F-(青色)、Mn2+(BsPPase)淺紫色和K+(VrPPase)紫色。VrPPase中的親核水標(biāo)記為Wn并顯示為紅色;在各圖中,親電磷性P1在每個(gè)圖中都是較低的。氫鍵和離子相互作用用虛線(xiàn)表示。Fig2.SidebysidecomparisonofthehydrolyticsitesofYPPase(2-a),BsPPase(2-b)andVrPPase(2-c),emphasisingthedifferenceindetailedactivesitegeometrybetweenthethreeenzymes.Inallcasesthescissilebondisvertical,withthenucleophiledirectlyunderneath.Keysidechainsareshowninatomcolours,asareMg2+(green),F(cyan),theMn2+(BsPPase)lightpurple,andtheK+(VrPPase)purple.ThenucleophilicwaterinVrPPaseislabelledWn

三級(jí)結(jié)構(gòu),綠豆


第一章前言8圖3.綠豆V-PPase的三級(jí)結(jié)構(gòu)。Linetal.(2012)揭示了弧菌V-PPase的晶體結(jié)構(gòu),它以同型二聚體存在(A和B)來(lái)自RCSB蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)(rcsb.org;4A01)的細(xì)胞質(zhì)側(cè)面(A)和側(cè)視圖(B)的V-PPase三維圖像,該圖像基于已發(fā)表的數(shù)據(jù)(Linetal.2012)。(C)V-PPase二聚體頂視圖的示意圖,以顯示跨膜螺旋(TM1-TM16)的排列。內(nèi)圈和外圈中的TM螺旋分別以淺棕色和藍(lán)色顯示。(D)基于先前報(bào)告的底物水解,能量轉(zhuǎn)移,H+轉(zhuǎn)運(yùn)和H+釋放功能域的示意圖(Linetal.2012,Kellosaloetal.2012,Lietal.2016)。Fig3.TertiarystructureofV-PPaseofVignaradiata.Linetal.(2012)revealedthecrystalstructureofV.radiataV-PPase,whichexistsasahomodimer.(AandB)Three-dimensionalimagesofV-PPasefromthecytoplasmicside(A)andthesideview(B)takenfromtheRCSBProteinDataBank(rcsb.org;4A01),whichisbasedonpublisheddata(Linetal.2012).(C)SchematicrepresentationofthetopviewoftheV-PPasedimertoshowthearrangementofthetransmembranehelices(TM1–TM16).TMhelicesintheinnerandouterringsareshowninlightbrownandblue,respectively.(D)Aschematicmodelofthefunctionaldomainsforsubstratehydrolysis,energytransfer,H+translocationandH+releasebasedonpreviousreports(Linetal.2012,Kellosaloetal.2012,Lietal.2016).1.2.4H+-PPase的多樣性在模式作物擬南芥中,VPPs包括兩個(gè)亞型,一個(gè)為基因編碼Ⅰ型酶又稱(chēng)AVP1,利用酵母的異源表達(dá)表明,AVP1靶向于液泡膜,并在將質(zhì)子從細(xì)胞質(zhì)泵入液泡的同時(shí)水解PPi(Kimetal,1994)。利用該酵母表達(dá),AVP1被證明是一種I型H+-PPase(K+刺激酶),表明酵母因其折疊方式包含H+偶聯(lián)PPi水解所需的信息,所以能夠作為?

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào):3269671

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