基于SNP芯片的“濰麥8號(hào)/安農(nóng)91168”RIL群體農(nóng)藝及產(chǎn)量性狀QTL定位
發(fā)布時(shí)間:2021-04-07 07:02
小麥作為世界范圍內(nèi)的重要糧食作物,不斷改善和提高其產(chǎn)量和品質(zhì)對(duì)人們的生活具有重要的意義。小麥的許多農(nóng)藝性狀都屬于數(shù)量性狀,由多個(gè)位點(diǎn)控制,其表型值由環(huán)境和基因相互作用決定。因此構(gòu)建高密度小麥遺傳連鎖圖譜,對(duì)控制農(nóng)藝及產(chǎn)量性狀的QTL進(jìn)行定位,明確其在染色體的位置和效應(yīng),對(duì)于小麥遺傳改良具有重要的意義。本研究采用以濰麥8號(hào)和安農(nóng)91168為親本創(chuàng)制的重組自交系RIL群體為材料,利用SNP芯片技術(shù)進(jìn)行高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建,同時(shí)檢測多個(gè)環(huán)境下穩(wěn)定表達(dá)的小麥農(nóng)藝及產(chǎn)量性狀QTL,為進(jìn)一步精細(xì)定位和圖位克隆提供理論參考。獲得的主要結(jié)果如下:1、利用SNP基因芯片對(duì)濰麥8號(hào)和安農(nóng)91168以及RIL群體進(jìn)行全基因組掃描,構(gòu)建了一張包含2000個(gè)標(biāo)記,共有24個(gè)連鎖群,全長覆蓋2506.98cM的遺傳連鎖圖譜,標(biāo)記間平均遺傳距離為1.25cM。2、濰麥8號(hào)開花期與安農(nóng)91168相近都在200天左右,RIL群體開花期為197-207天,低氮處理下開花期提前1-2天。QTL分析定位到14個(gè)與開花期相關(guān)的QTL,分別位于2D、3B、4B、5A、5B、5D、6A、6D、7A等染色體上;其中9個(gè)QTL可解釋...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
符號(hào)說明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 DNA分子遺傳標(biāo)記的類型
1.1.1 隨機(jī)DNA分子標(biāo)記
1.1.1.1 簡單序列重復(fù)
1.1.1.2 單核苷酸多態(tài)性
1.1.1.3 多樣性微陣列技術(shù)
1.1.1.4 序列特異性擴(kuò)增區(qū)域
1.1.1.5 酶切擴(kuò)增多態(tài)性序列
1.1.2 目標(biāo)分子標(biāo)記技術(shù)類型
1.1.2.1 相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性
1.1.2.2 靶位區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性
1.1.2.3 保守區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性
1.1.2.4 目標(biāo)起始密碼子多態(tài)性
1.1.2.5 DNA序列多態(tài)性
1.1.3 功能性分子標(biāo)記
1.1.3.1 內(nèi)含子擴(kuò)增序列多態(tài)性
1.2 高通量基因分型技術(shù)
1.2.1 基于芯片技術(shù)的基因分型方法
1.2.2 基于全基因組重測序技術(shù)的基因分型方法
1.2.3 基于RNA-seq的基因分型方法
1.3 遺傳作圖方法
1.3.1 連鎖作圖
1.3.2 關(guān)聯(lián)作圖
1.3.2.1 基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析
1.3.2.2 基于全基因組掃描的關(guān)聯(lián)分析
1.4 本研究的目的和意義
2 試驗(yàn)材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 田間種植
2.3 農(nóng)藝性狀調(diào)查
2.4 植物高質(zhì)量DNA提取
2.5 相關(guān)試劑的配制
2.6 基因芯片的檢測
2.7 統(tǒng)計(jì)分析
2.8 QTL分析方法
3 結(jié)果與分析
3.1 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
3.2 農(nóng)藝性狀QTL定位
3.2.1 生育期QTL定位
3.2.2 株高、節(jié)間長度等株型性狀QTL定位相關(guān)的QTL
3.2.3 旗葉相關(guān)性狀的QTL定位
3.3 產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位
3.3.1 穗部性狀QTL結(jié)果分析
3.3.2 籽粒性狀QTL結(jié)果分析
3.4 一因多效QTL簇的檢測
4 討論
4.1 遺傳圖譜構(gòu)建
4.2 重要農(nóng)藝性狀QTL的比較
4.3 一因多效QTL簇
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表論文情況
本文編號(hào):3123022
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
符號(hào)說明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 DNA分子遺傳標(biāo)記的類型
1.1.1 隨機(jī)DNA分子標(biāo)記
1.1.1.1 簡單序列重復(fù)
1.1.1.2 單核苷酸多態(tài)性
1.1.1.3 多樣性微陣列技術(shù)
1.1.1.4 序列特異性擴(kuò)增區(qū)域
1.1.1.5 酶切擴(kuò)增多態(tài)性序列
1.1.2 目標(biāo)分子標(biāo)記技術(shù)類型
1.1.2.1 相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性
1.1.2.2 靶位區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性
1.1.2.3 保守區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性
1.1.2.4 目標(biāo)起始密碼子多態(tài)性
1.1.2.5 DNA序列多態(tài)性
1.1.3 功能性分子標(biāo)記
1.1.3.1 內(nèi)含子擴(kuò)增序列多態(tài)性
1.2 高通量基因分型技術(shù)
1.2.1 基于芯片技術(shù)的基因分型方法
1.2.2 基于全基因組重測序技術(shù)的基因分型方法
1.2.3 基于RNA-seq的基因分型方法
1.3 遺傳作圖方法
1.3.1 連鎖作圖
1.3.2 關(guān)聯(lián)作圖
1.3.2.1 基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析
1.3.2.2 基于全基因組掃描的關(guān)聯(lián)分析
1.4 本研究的目的和意義
2 試驗(yàn)材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 田間種植
2.3 農(nóng)藝性狀調(diào)查
2.4 植物高質(zhì)量DNA提取
2.5 相關(guān)試劑的配制
2.6 基因芯片的檢測
2.7 統(tǒng)計(jì)分析
2.8 QTL分析方法
3 結(jié)果與分析
3.1 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
3.2 農(nóng)藝性狀QTL定位
3.2.1 生育期QTL定位
3.2.2 株高、節(jié)間長度等株型性狀QTL定位相關(guān)的QTL
3.2.3 旗葉相關(guān)性狀的QTL定位
3.3 產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位
3.3.1 穗部性狀QTL結(jié)果分析
3.3.2 籽粒性狀QTL結(jié)果分析
3.4 一因多效QTL簇的檢測
4 討論
4.1 遺傳圖譜構(gòu)建
4.2 重要農(nóng)藝性狀QTL的比較
4.3 一因多效QTL簇
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表論文情況
本文編號(hào):3123022
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