梭梭SUMO E3連接酶基因HaSIZ1的克隆和功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-03 17:41
干旱、土壤鹽漬化和極端溫度是影響植物生長(zhǎng)、限制農(nóng)作物生產(chǎn)的重要非生物脅迫。SUMO(Small ubiquitin-like modifier)化作為一種重要的翻譯后修飾,在調(diào)控植物生長(zhǎng)、發(fā)育和逆境應(yīng)答等方面發(fā)揮著重要作用。E3連接酶SIZ1可直接介導(dǎo)SUMO蛋白與靶蛋白的結(jié)合,直接影響植物在多種非生物脅迫下的SUMO化響應(yīng)。目前對(duì)SIZ1介導(dǎo)的SUMO化的研究都集中在擬南芥和水稻等甜土植物,荒漠植物大都具有極強(qiáng)的抗復(fù)合逆境能力,它們的SUMO E3連接酶是否具有與甜土植物不一樣的調(diào)控,目前還不清楚。本研究以我國(guó)西北荒漠地區(qū)優(yōu)勢(shì)物種梭梭為材料,分析了SUMO化在其應(yīng)對(duì)滲透脅迫、高鹽、高溫和低溫過(guò)程中的響應(yīng);并以其SUMO E3連接酶的編碼基因HaSIZ1為重點(diǎn),克隆了HaSIZ1的cDNA全長(zhǎng)并進(jìn)行了脅迫處理下的表達(dá)模式分析、亞細(xì)胞定位和擬南芥轉(zhuǎn)化等,取得以下主要研究結(jié)果:(1)克隆到梭梭HaSUMO1基因,其cDNA全長(zhǎng)為632 bp,ORF為291bp,共編碼96個(gè)氨基酸;HaSUMO1分子量約10.9 kDa,與擬南芥AtSUMO1氨基酸同源性約86%,Anti-AtSUMO1抗...
【文章來(lái)源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
SUMO化/去SUMO化循環(huán)過(guò)程(改自Elrouby等,2015)
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文梭梭SUMOE3連接酶基因HaSIZ1的克隆和功能分析31第三章結(jié)果與分析3.1不同脅迫處理誘導(dǎo)梭梭SUMO化蛋白的積累3.1.1梭梭HaSUMO1基因的克隆在擬南芥、水稻、蘋(píng)果和番茄等植物中的研究表明,在不同脅迫處理下,植物體內(nèi)SUMO化蛋白會(huì)發(fā)生不同程度的積累(張聳等,2017)。SUMO1是高等植物響應(yīng)非生物脅迫的重要SUMO蛋白,其在真核生物中高度保守,前人在水稻(Chaikam等,2010)、煙草(Zhang等,2017)和蘋(píng)果(Zhou等,2017)上的研究均利用擬南芥Anti-AtSUMO1抗體進(jìn)行免疫反應(yīng)。為了得到梭梭HaSUMO1的氨基酸序列,以比較其與擬南芥AtSUMO1的同源性,首先在NCBI網(wǎng)站下載了與梭梭同屬藜科的甜菜(Betavulgaris)、菠菜(Spinaciaoleracea)和藜麥(Chenopodiumquinoa)的SUMO1基因序列,分別為BvSUMO1(XM_010677451.2)、SoSUMO1(XM_021993360.1)和CqSUMO1(XM_021899999.1)。利用DNAMAN軟件比對(duì)其核苷酸序列,并在5’和3’非編碼區(qū)保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物,以梭梭cDNA為模板,擴(kuò)增到了梭梭HaSUMO1基因cDNA序列(如圖3-1),回收此條帶,連接到克隆載體pMD19-T并轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑取陽(yáng)性克隆測(cè)序,將所得序列用NCBI網(wǎng)站BLAST工具進(jìn)行比對(duì),確定所得序列為梭梭HaSUMO1基因序列。圖3-1梭梭HaSUMO1cDNA擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖Figure3-1AgarosegelelectrophoresisofHaSUMO1cDNAproducts克隆到梭梭HaSUMO1基因cDNA序列共632bp,5’非編碼區(qū)85bp,3’非編碼區(qū)256bp,ORF全長(zhǎng)291bp,共編碼96個(gè)氨基酸(如圖3-2),預(yù)測(cè)HaSUMO1蛋白分子量約10.9kDa,等電點(diǎn)為4.93(https://web.expasy.org/compute_pi/)。
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文梭梭SUMOE3連接酶基因HaSIZ1的克隆和功能分析32圖3-2HaSUMO1基因核苷酸序列及編碼氨基酸序列預(yù)測(cè)Figure3-2NucleotidesequenceandpredictedcoaddingaminoacidsequenceofHaSUMO13.1.2Anti-AtSUMO1抗體可用于檢測(cè)梭梭中SUMO蛋白利用DNAMAN軟件比對(duì)梭梭HaSUMO1和擬南芥AtSUMO1的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)二者具有很高的同源性(約86%)(圖3-3A),因此,推測(cè)Anti-AtSUMO1抗體可能也能用于對(duì)梭梭體內(nèi)SUMO化蛋白的檢測(cè)。分別提取擬南芥和梭梭幼苗總蛋白,用Anti-AtSUMO1抗體進(jìn)行Westernblot檢測(cè)。發(fā)現(xiàn)梭梭和擬南芥樣品在約11kDa處均可檢測(cè)到游離SUMO蛋白,說(shuō)明Anti-AtSUMO1抗體可用于檢測(cè)梭梭中的SUMO化蛋白(圖3-3B)。圖3-3AtSUMO1抗體檢測(cè)擬南芥和梭梭SUMO1蛋白A:梭梭HaSUMO1和擬南芥AtSUMO1氨基酸序列比對(duì),B:擬南芥Anti-AtSUMO1抗體檢測(cè)梭梭和擬南芥游離態(tài)SUMO蛋白Figure3-3DetectSUMO1ofArabidopsisandH.ammodendronuseAnti-body,A:AminoacidalignmentofAtSUMO1andHaSUMO1,B:DetectfreeSUMOofArabidopsisandH.ammodendronuseAtSUMO1anti-body
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SUMO E3連接酶在植物適應(yīng)非生物脅迫中的作用研究進(jìn)展[J]. 汪永平,任偉,王潤(rùn)娟,邵坤仲,高慧娟,張金林. 生物技術(shù)通報(bào). 2020(02)
[2]SUMO E3連接酶在植物生長(zhǎng)發(fā)育中的功能研究進(jìn)展[J]. 韓丹璐,賴建彬,陽(yáng)成偉. 植物學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]高等植物適應(yīng)鹽逆境研究進(jìn)展[J]. 張金林,李惠茹,郭姝媛,王鎖民,施華中,韓慶慶,包愛(ài)科,馬清. 草業(yè)學(xué)報(bào). 2015(12)
[4]植物SIZ1 SUMO E3連接酶的研究進(jìn)展[J]. 張聳,李曉東,孟慶偉. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]植物響應(yīng)干旱脅迫的分子機(jī)制[J]. 康宗利,楊玉紅,張立軍. 玉米科學(xué). 2006(02)
博士論文
[1]蘋(píng)果SUMO E3連接酶MdSIZ1調(diào)控逆境應(yīng)答和花青苷積累的研究[D]. 張蕊芬.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3061662
【文章來(lái)源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
SUMO化/去SUMO化循環(huán)過(guò)程(改自Elrouby等,2015)
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文梭梭SUMOE3連接酶基因HaSIZ1的克隆和功能分析31第三章結(jié)果與分析3.1不同脅迫處理誘導(dǎo)梭梭SUMO化蛋白的積累3.1.1梭梭HaSUMO1基因的克隆在擬南芥、水稻、蘋(píng)果和番茄等植物中的研究表明,在不同脅迫處理下,植物體內(nèi)SUMO化蛋白會(huì)發(fā)生不同程度的積累(張聳等,2017)。SUMO1是高等植物響應(yīng)非生物脅迫的重要SUMO蛋白,其在真核生物中高度保守,前人在水稻(Chaikam等,2010)、煙草(Zhang等,2017)和蘋(píng)果(Zhou等,2017)上的研究均利用擬南芥Anti-AtSUMO1抗體進(jìn)行免疫反應(yīng)。為了得到梭梭HaSUMO1的氨基酸序列,以比較其與擬南芥AtSUMO1的同源性,首先在NCBI網(wǎng)站下載了與梭梭同屬藜科的甜菜(Betavulgaris)、菠菜(Spinaciaoleracea)和藜麥(Chenopodiumquinoa)的SUMO1基因序列,分別為BvSUMO1(XM_010677451.2)、SoSUMO1(XM_021993360.1)和CqSUMO1(XM_021899999.1)。利用DNAMAN軟件比對(duì)其核苷酸序列,并在5’和3’非編碼區(qū)保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物,以梭梭cDNA為模板,擴(kuò)增到了梭梭HaSUMO1基因cDNA序列(如圖3-1),回收此條帶,連接到克隆載體pMD19-T并轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑取陽(yáng)性克隆測(cè)序,將所得序列用NCBI網(wǎng)站BLAST工具進(jìn)行比對(duì),確定所得序列為梭梭HaSUMO1基因序列。圖3-1梭梭HaSUMO1cDNA擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖Figure3-1AgarosegelelectrophoresisofHaSUMO1cDNAproducts克隆到梭梭HaSUMO1基因cDNA序列共632bp,5’非編碼區(qū)85bp,3’非編碼區(qū)256bp,ORF全長(zhǎng)291bp,共編碼96個(gè)氨基酸(如圖3-2),預(yù)測(cè)HaSUMO1蛋白分子量約10.9kDa,等電點(diǎn)為4.93(https://web.expasy.org/compute_pi/)。
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文梭梭SUMOE3連接酶基因HaSIZ1的克隆和功能分析32圖3-2HaSUMO1基因核苷酸序列及編碼氨基酸序列預(yù)測(cè)Figure3-2NucleotidesequenceandpredictedcoaddingaminoacidsequenceofHaSUMO13.1.2Anti-AtSUMO1抗體可用于檢測(cè)梭梭中SUMO蛋白利用DNAMAN軟件比對(duì)梭梭HaSUMO1和擬南芥AtSUMO1的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)二者具有很高的同源性(約86%)(圖3-3A),因此,推測(cè)Anti-AtSUMO1抗體可能也能用于對(duì)梭梭體內(nèi)SUMO化蛋白的檢測(cè)。分別提取擬南芥和梭梭幼苗總蛋白,用Anti-AtSUMO1抗體進(jìn)行Westernblot檢測(cè)。發(fā)現(xiàn)梭梭和擬南芥樣品在約11kDa處均可檢測(cè)到游離SUMO蛋白,說(shuō)明Anti-AtSUMO1抗體可用于檢測(cè)梭梭中的SUMO化蛋白(圖3-3B)。圖3-3AtSUMO1抗體檢測(cè)擬南芥和梭梭SUMO1蛋白A:梭梭HaSUMO1和擬南芥AtSUMO1氨基酸序列比對(duì),B:擬南芥Anti-AtSUMO1抗體檢測(cè)梭梭和擬南芥游離態(tài)SUMO蛋白Figure3-3DetectSUMO1ofArabidopsisandH.ammodendronuseAnti-body,A:AminoacidalignmentofAtSUMO1andHaSUMO1,B:DetectfreeSUMOofArabidopsisandH.ammodendronuseAtSUMO1anti-body
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SUMO E3連接酶在植物適應(yīng)非生物脅迫中的作用研究進(jìn)展[J]. 汪永平,任偉,王潤(rùn)娟,邵坤仲,高慧娟,張金林. 生物技術(shù)通報(bào). 2020(02)
[2]SUMO E3連接酶在植物生長(zhǎng)發(fā)育中的功能研究進(jìn)展[J]. 韓丹璐,賴建彬,陽(yáng)成偉. 植物學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]高等植物適應(yīng)鹽逆境研究進(jìn)展[J]. 張金林,李惠茹,郭姝媛,王鎖民,施華中,韓慶慶,包愛(ài)科,馬清. 草業(yè)學(xué)報(bào). 2015(12)
[4]植物SIZ1 SUMO E3連接酶的研究進(jìn)展[J]. 張聳,李曉東,孟慶偉. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]植物響應(yīng)干旱脅迫的分子機(jī)制[J]. 康宗利,楊玉紅,張立軍. 玉米科學(xué). 2006(02)
博士論文
[1]蘋(píng)果SUMO E3連接酶MdSIZ1調(diào)控逆境應(yīng)答和花青苷積累的研究[D]. 張蕊芬.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3061662
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