大葉蛇葡萄黃酮類成分生物合成關(guān)鍵基因的克隆及功能鑒定
發(fā)布時間:2021-03-03 19:02
大葉蛇葡萄(Ampelopsis megalophylla Diels et Gilg)又稱大葉山葡萄,是我國湖北省恩施地區(qū)一種具特色的藥用植物,其嫩葉及嫩莖的加工品在當(dāng)?shù)乇环Q為“霉茶”。目前大葉蛇葡萄的藥用資源主要來源于野生,不同來源的大葉蛇葡萄品質(zhì)存在著一定的差異。眾所周知,藥用植物資源品質(zhì)的優(yōu)劣與其積累的活性次生代謝產(chǎn)物有著直接關(guān)系。因此,為了從源頭控制其資源品質(zhì),需從分子生物學(xué)角度闡明活性成分的生物合成途徑。目前有關(guān)大葉蛇葡萄主要活性成分生物合成關(guān)鍵酶基因的克隆及功能鑒定研究未見報道。本論文基于課題組前期建立的大葉蛇葡萄的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,篩選了大葉蛇葡萄活性成分黃酮類化合物生物合成的關(guān)鍵基因,擬克隆編碼大葉蛇葡萄類黃酮-3’,5’-羥化酶(F3’,5’H)、無色花色素還原酶(LAR)、黃酮醇-3-羥化酶(F3H)的基因以及進(jìn)行關(guān)鍵基因F3’,5’H的功能鑒定,以期為大葉蛇葡萄活性成分生物合成分子機(jī)制的闡明,以及將來進(jìn)一步從基因組水平改良大葉蛇葡萄藥用植物資源品質(zhì)提供依據(jù)。具體研究內(nèi)容及結(jié)果如下:(1)本論文在前期研究基礎(chǔ)上,以大葉蛇葡萄嫩葉為實驗材料,通過RT-PCR技術(shù)克隆了F...
【文章來源】:湖北中醫(yī)藥大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:131 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大葉蛇葡萄葉片RNA凝膠電泳圖
湖北中醫(yī)藥大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文20圖1-2F3’,5’H基因全長克隆凝膠電泳圖Fig.1-2Full-lengthcloningofF3’,5’Hbygelelectrophoresis注:Marker為TransDNAMarker,F(xiàn)3’,5’H為F3’,5’H基因3.2.2大葉蛇葡萄F3’,5’H基因序列分析F3’,5’H基因序列經(jīng)BLAST搜索比對后發(fā)現(xiàn)與藤茶(Ampelopsisgrossedentata)的F3’,5’H相似性最高為99%;與葡萄(Vitisvinifera)的F3’,5’H相似性為93%~94%。將測序結(jié)果通過DNAMAN等軟件進(jìn)行基本的信息分析,得到大葉蛇葡萄F3’,5’H基因全長1931bp,其中包含一個長度為1527bp的開放閱讀框,編碼508個氨基酸殘基(圖1-3)。3.3大葉蛇葡萄F3’,5’H基因編碼蛋白生物信息學(xué)分析3.3.1F3’,5’H基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)分析利用ServerExPASy-ProtParamtool的在線軟件分析F3’,5’H基因編碼氨基酸的理化性質(zhì),發(fā)現(xiàn)其相對分子質(zhì)量為56.84KDa,等電點為8.50,分子式為C2549H4038N694O717S30,不穩(wěn)定指數(shù)為39.23,屬于穩(wěn)定蛋白,脂肪族指數(shù)為92.17,總平均疏水性為-0.059小于0,為親水性蛋白。該蛋白含有508個氨基酸,其中亮氨酸(Leu)含量最高為11.4%,其次是丙氨酸(Ala)為8.5%,半胱氨酸(Cys)最低為0.8%。其中有53個負(fù)電荷氨基酸殘基(Asp+Glu),56個正電荷氨基酸殘基
大葉蛇葡萄黃酮類成分生物合成關(guān)鍵基因的克隆及功能鑒定(Arg+Lys),表明大葉蛇葡萄 F3’,5’H 蛋白是親水性蛋白。利用 NCBIConcserved Domain 搜 索 后 發(fā) 現(xiàn) F3’,5’H 基 因 編 碼 的 蛋 白 屬 于 P450(Cytochrome P450)家族成員(圖 1-4)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]明月草總黃酮對2型糖尿病模型小鼠降血糖作用研究[J]. 林騰,尹偉,許燕,王章姐,陶阿麗. 濱州醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2018(05)
[2]沙棘果渣總黃酮的降血脂及降血糖作用[J]. 孫琛,馮野,謝培,宋忠興,唐志書. 世界中醫(yī)藥. 2018(01)
[3]竹柳葉中黃酮類化合物的提取工藝和成分分析研究[J]. 韓穎,呂曉玲. 食品研究與開發(fā). 2017(14)
[4]大葉蛇葡萄提取物對SMMC-7721細(xì)胞增殖抑制作用的研究[J]. 黃靜,桂春,答國政,尚祥偉,明小芳,張秀橋. 中國現(xiàn)代中藥. 2017(04)
[5]胡柚皮黃酮對高脂血癥大鼠的降血脂作用研究[J]. 楊佩磊,蔣劍平,李全清,伍旭明,陳芝蕓. 中國中藥雜志. 2017(05)
[6]黃酮類化合物的構(gòu)效關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 趙雪巍,劉培玉,劉丹,孫珊珊,李貞,余可馨,張嫚麗,史清文. 中草藥. 2015(21)
[7]彩色馬鈴薯品種‘轉(zhuǎn)心烏’類黃酮-3’5’-羥化酶(F3’5’H)基因的生物信息學(xué)和表達(dá)分析[J]. 肖繼坪,楊曉娜,郭華春. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(07)
[8]篩選大葉蛇葡萄體外抗腫瘤活性物質(zhì)[J]. 桂春,黃靜,程佩佩,方玉,夏葉,張秀橋. 中成藥. 2015(07)
[9]葛根素心血管保護(hù)作用及其機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 魏述永. 中國中藥雜志. 2015(12)
[10]藥用植物轉(zhuǎn)錄因子AP2/ERF研究與展望[J]. 季愛加,羅紅梅,徐志超,張鑫,宋經(jīng)元,陳士林. 科學(xué)通報. 2015(14)
碩士論文
[1]黑穗醋栗類黃酮-3’,5’-羥化酶基因的克隆及表達(dá)特性研究[D]. 湯雪.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]大葉蛇葡萄不同器官黃酮類化合物代謝路徑差異表達(dá)基因研究[D]. 答國政.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[3]茶樹兒茶素在芽中積累規(guī)律及茶樹F3’5’H2的功能分析[D]. 王新珍.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]茶樹類黃酮-3’,5’-羥基化酶的功能分析[D]. 許玉嬌.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]大葉蛇葡萄黃酮提取物血清藥化及其對心、腎的保護(hù)作用研究[D]. 江燦.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2013
[6]三種云南野生觀賞植物中類黃酮3’,5’羥基化酶基因的克隆及其表達(dá)分析[D]. 王翠麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]茶樹類黃酮3’,5’-羥基化酶的基因克隆與功能研究[D]. 陳嘯天.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[8]大葉蛇葡萄總黃酮提取物質(zhì)量分析及其降壓藥效學(xué)研究[D]. 楊若婧.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2012
[9]新疆紫茉莉黃酮類化合物及色素的初步研究[D]. 李凌智.新疆大學(xué) 2010
[10]根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的F3’5’H基因?qū)栈ㄟz傳轉(zhuǎn)化的初步研究[D]. 徐建.西南大學(xué) 2007
本文編號:3061772
【文章來源】:湖北中醫(yī)藥大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:131 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大葉蛇葡萄葉片RNA凝膠電泳圖
湖北中醫(yī)藥大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文20圖1-2F3’,5’H基因全長克隆凝膠電泳圖Fig.1-2Full-lengthcloningofF3’,5’Hbygelelectrophoresis注:Marker為TransDNAMarker,F(xiàn)3’,5’H為F3’,5’H基因3.2.2大葉蛇葡萄F3’,5’H基因序列分析F3’,5’H基因序列經(jīng)BLAST搜索比對后發(fā)現(xiàn)與藤茶(Ampelopsisgrossedentata)的F3’,5’H相似性最高為99%;與葡萄(Vitisvinifera)的F3’,5’H相似性為93%~94%。將測序結(jié)果通過DNAMAN等軟件進(jìn)行基本的信息分析,得到大葉蛇葡萄F3’,5’H基因全長1931bp,其中包含一個長度為1527bp的開放閱讀框,編碼508個氨基酸殘基(圖1-3)。3.3大葉蛇葡萄F3’,5’H基因編碼蛋白生物信息學(xué)分析3.3.1F3’,5’H基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)分析利用ServerExPASy-ProtParamtool的在線軟件分析F3’,5’H基因編碼氨基酸的理化性質(zhì),發(fā)現(xiàn)其相對分子質(zhì)量為56.84KDa,等電點為8.50,分子式為C2549H4038N694O717S30,不穩(wěn)定指數(shù)為39.23,屬于穩(wěn)定蛋白,脂肪族指數(shù)為92.17,總平均疏水性為-0.059小于0,為親水性蛋白。該蛋白含有508個氨基酸,其中亮氨酸(Leu)含量最高為11.4%,其次是丙氨酸(Ala)為8.5%,半胱氨酸(Cys)最低為0.8%。其中有53個負(fù)電荷氨基酸殘基(Asp+Glu),56個正電荷氨基酸殘基
大葉蛇葡萄黃酮類成分生物合成關(guān)鍵基因的克隆及功能鑒定(Arg+Lys),表明大葉蛇葡萄 F3’,5’H 蛋白是親水性蛋白。利用 NCBIConcserved Domain 搜 索 后 發(fā) 現(xiàn) F3’,5’H 基 因 編 碼 的 蛋 白 屬 于 P450(Cytochrome P450)家族成員(圖 1-4)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]明月草總黃酮對2型糖尿病模型小鼠降血糖作用研究[J]. 林騰,尹偉,許燕,王章姐,陶阿麗. 濱州醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2018(05)
[2]沙棘果渣總黃酮的降血脂及降血糖作用[J]. 孫琛,馮野,謝培,宋忠興,唐志書. 世界中醫(yī)藥. 2018(01)
[3]竹柳葉中黃酮類化合物的提取工藝和成分分析研究[J]. 韓穎,呂曉玲. 食品研究與開發(fā). 2017(14)
[4]大葉蛇葡萄提取物對SMMC-7721細(xì)胞增殖抑制作用的研究[J]. 黃靜,桂春,答國政,尚祥偉,明小芳,張秀橋. 中國現(xiàn)代中藥. 2017(04)
[5]胡柚皮黃酮對高脂血癥大鼠的降血脂作用研究[J]. 楊佩磊,蔣劍平,李全清,伍旭明,陳芝蕓. 中國中藥雜志. 2017(05)
[6]黃酮類化合物的構(gòu)效關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 趙雪巍,劉培玉,劉丹,孫珊珊,李貞,余可馨,張嫚麗,史清文. 中草藥. 2015(21)
[7]彩色馬鈴薯品種‘轉(zhuǎn)心烏’類黃酮-3’5’-羥化酶(F3’5’H)基因的生物信息學(xué)和表達(dá)分析[J]. 肖繼坪,楊曉娜,郭華春. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(07)
[8]篩選大葉蛇葡萄體外抗腫瘤活性物質(zhì)[J]. 桂春,黃靜,程佩佩,方玉,夏葉,張秀橋. 中成藥. 2015(07)
[9]葛根素心血管保護(hù)作用及其機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 魏述永. 中國中藥雜志. 2015(12)
[10]藥用植物轉(zhuǎn)錄因子AP2/ERF研究與展望[J]. 季愛加,羅紅梅,徐志超,張鑫,宋經(jīng)元,陳士林. 科學(xué)通報. 2015(14)
碩士論文
[1]黑穗醋栗類黃酮-3’,5’-羥化酶基因的克隆及表達(dá)特性研究[D]. 湯雪.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]大葉蛇葡萄不同器官黃酮類化合物代謝路徑差異表達(dá)基因研究[D]. 答國政.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[3]茶樹兒茶素在芽中積累規(guī)律及茶樹F3’5’H2的功能分析[D]. 王新珍.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]茶樹類黃酮-3’,5’-羥基化酶的功能分析[D]. 許玉嬌.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]大葉蛇葡萄黃酮提取物血清藥化及其對心、腎的保護(hù)作用研究[D]. 江燦.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2013
[6]三種云南野生觀賞植物中類黃酮3’,5’羥基化酶基因的克隆及其表達(dá)分析[D]. 王翠麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]茶樹類黃酮3’,5’-羥基化酶的基因克隆與功能研究[D]. 陳嘯天.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[8]大葉蛇葡萄總黃酮提取物質(zhì)量分析及其降壓藥效學(xué)研究[D]. 楊若婧.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2012
[9]新疆紫茉莉黃酮類化合物及色素的初步研究[D]. 李凌智.新疆大學(xué) 2010
[10]根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的F3’5’H基因?qū)栈ㄟz傳轉(zhuǎn)化的初步研究[D]. 徐建.西南大學(xué) 2007
本文編號:3061772
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3061772.html
最近更新
教材專著