基于蛋白質(zhì)組學(xué)初步探究煙粉虱與雙生病毒的相互作用
發(fā)布時間:2021-03-02 12:01
煙粉虱Bemisia tacbaci(Gennadius)屬半翅目(Hemiptera)粉虱科(Aleyraodidae),是一類世界性重大農(nóng)業(yè)害蟲。煙粉虱傳播的雙生病毒科(Geminiviridae)菜豆金黃花葉病毒屬(Begomovirus)病毒給我國農(nóng)作物生產(chǎn)構(gòu)成巨大的威脅。菜豆金黃花葉病毒屬病毒經(jīng)煙粉虱以持久循環(huán)型方式傳播,它們的外殼蛋白(coat protein,CP)是目前唯一已知參與病毒被煙粉虱特異性傳播的結(jié)構(gòu)蛋白。CP可能通過和煙粉虱蛋白發(fā)生復(fù)雜的相互作用來侵染煙粉虱中腸、唾液腺等組織,從而使病毒成功傳播。另外,已知番茄黃曲葉病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)進(jìn)入煙粉虱體內(nèi)后能激活煙粉虱自噬和抗菌肽等免疫反應(yīng),這些免疫反應(yīng)不利于病毒的侵染及積累,F(xiàn)階段有關(guān)煙粉虱-菜豆金黃花葉病毒屬病毒互作的研究比較少,我們對二者復(fù)雜互作關(guān)系的認(rèn)識還較為淺顯;诖,本研究借助酵母雙雜交核系統(tǒng)篩選了可能和TYLCV CP互作的煙粉虱蛋白,并利用同位素標(biāo)記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolut...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1雙生病毒基因組結(jié)構(gòu)圖
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文通過酵母雙雜交核系統(tǒng)篩選與TYLCVCP互作的煙粉虱蛋白31圖3.1酵母雙雜交系統(tǒng)篩選與TYLCVCP互作的煙粉虱蛋白。(A)酵母雙雜交系統(tǒng)流程圖;(B)煙粉虱cDNA文庫插入片段的PCR鑒定;(C)使用TYLCVCP抗體通過蛋白質(zhì)印跡檢測pGBKT7-TYLCVCP在酵母菌株中表達(dá)(≈46kDa);(D)誘餌載體pGBKT7-TYLCVCP自激活檢測。pGBKT7-p53和pGADT7-LargeT為陽性對照,pGBKT7-p53和pGADT7為陰性對照。Fig3.1IdentificationofwhiteflythatinteractwithTYLCVCPusingtheY2Hsystem.(A)Schematicdiagramofworkflowforthesystem.(B)PCRidentificationofinsertsintheprimarywhiteflycDNAlibrary.(C)ExpressionofpGBKT7-TYLCVCPinyeastwasidentifiedusingwesternblotbyantibodyofTYLCVCP(≈46kDa).(D)Auto-activationdetectionofbaitvectorpGBKT7-TYLCVCPinyeast.pGBKT7-p53andpGADT7-LargeTwereusedaspositivecontrols;pGBKT7-p53andpGADT7wereusedasnegativecontrols.
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文通過酵母雙雜交核系統(tǒng)篩選與TYLCVCP互作的煙粉虱蛋白33SD/-Trp-Leu-His-Ade(含有X-α-Gal和AbA)選擇性培養(yǎng)基上生長且變藍(lán),則說明兩個蛋白之間存在互作(圖3.2A),并構(gòu)建互作蛋白之間的網(wǎng)絡(luò)圖(圖3.2B)。圖3.2煙粉虱蛋白與TYLCVCP蛋白之間的相互作用。(A)采用酵母雙雜交核系統(tǒng)驗(yàn)證TYLCVCP與篩選得到的煙粉虱蛋白之間的互作。pGBKT7-TYLCVCP和15個獵物質(zhì)粒分別共轉(zhuǎn)酵母菌株,并在DDO和QDO/X/A兩種選擇性培養(yǎng)基上培養(yǎng)生長,pGBKT7-p53和pGADT7-LargeT作為陽性對照(+),pGBKT7-p53和pGADT7作為陰性對照(-);(B)15個候選煙粉虱蛋白與TYLCVCP蛋白的互作網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)使用Cytoscape生成,紅線表示從數(shù)據(jù)庫搜索工具中預(yù)測的互作(STRING9.1;http://stringdb.org),黑線代表從酵母雙雜交核系統(tǒng)中驗(yàn)證的互作蛋白。Fig3.2InteractionsbetweenwhiteflyproteinsandTYLCVCP.(A)VerificationofinteractionsbetweenTYLCVCPandidentifiedwhiteflyproteinsusingY2Hassay.TYLCVCPand15respectivepreyproteinswereusedtocotransformyeastforgrowthonDDOandQDO/X/Aselectivemedium.pGBKT7-p53andpGADT7-LargeTwereusedaspositivecontrols(+);pGBKT7-p53andpGADT7wereusedasnegativecontrols(-).(B)Proteininteractionnetworkanalysisof15candidatewhiteflyproteinsandTYLCVCP.ThisnetworkwasgeneratedwithCytoscape.Theredlinemeanstheinteractionpredictedfromthedatabasesearchtoolfortheretrievalofinteractingproteins(STRING9.1;http://stringdb.org),andtheblacklinestandsfortheinteractionsupportedbyY2Hassaysystem.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙粉虱對菜豆金黃花葉病毒屬病毒的傳播:病毒對媒介昆蟲的適應(yīng)[J]. 潘李隆,遲瑤,范運(yùn)運(yùn),劉樹生. 昆蟲學(xué)報. 2019(07)
[2]Differential efficiency of a begomovirus to cross the midgut of different species of whiteflies results in variation of virus transmission by the vectors[J]. Lilong Pan,Qunfang Chen,Tao Guo,Xinru Wang,Ping Li,Xiaowei Wang,Shusheng Liu. Science China(Life Sciences). 2018(10)
[3]泛素-蛋白酶體系統(tǒng)對煙粉虱體內(nèi)番茄黃曲葉病毒的影響[J]. 夏文強(qiáng),梁燕,劉銀泉,劉樹生,王曉偉. 昆蟲學(xué)報. 2017(12)
[4]蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法及應(yīng)用的研究進(jìn)展[J]. 譚偉,黃莉,謝芝勛. 中國畜牧獸醫(yī). 2014(09)
[5]吉林番茄黃化曲葉病毒分離物的檢測及其DNA-A全基因組序列分析[J]. 王祥,李剛,趙黎明,劉金亮,辛志梅,竺曉平. 植物保護(hù). 2014(02)
[6]PaLCuCNV和TYLCCNV復(fù)合侵染引起更嚴(yán)重的番茄黃化曲葉病[J]. 熊艷,周常勇,李茵,王春艷,孫現(xiàn)超,青玲. 園藝學(xué)報. 2014(02)
[7]Molecular Detection of TYLCV Isolates from Xinjiang Autonomous Region of China and Analysis of Its DNA-A Genome Sequences[J]. Ding Yingna,Li Shifang,Zhang Sheng,Cui Yuanyu,Yang Hua,He Wei,Sun Xiaojun. Plant Diseases and Pests. 2013(06)
[8]浙江省番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定及序列分析[J]. 袁偉,萬紅建,王榮青,葉青靜,阮美穎,李志邈,周國治,姚祝平,劉云飛,楊悅儉. 分子植物育種. 2013(02)
[9]利用mtCOIPCR-RFLP技術(shù)鑒定中國境內(nèi)九個煙粉虱隱種[J]. 秦麗,王佳,邴孝利,劉樹生. 昆蟲學(xué)報. 2013(02)
[10]昆蟲天然免疫反應(yīng)分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 張明明,初源,趙章武,安春菊. 昆蟲學(xué)報. 2012(10)
碩士論文
[1]溫州地區(qū)番茄黃化曲葉病毒病流行規(guī)律與綜合防治[D]. 許方程.浙江大學(xué) 2011
本文編號:3059223
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1雙生病毒基因組結(jié)構(gòu)圖
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文通過酵母雙雜交核系統(tǒng)篩選與TYLCVCP互作的煙粉虱蛋白31圖3.1酵母雙雜交系統(tǒng)篩選與TYLCVCP互作的煙粉虱蛋白。(A)酵母雙雜交系統(tǒng)流程圖;(B)煙粉虱cDNA文庫插入片段的PCR鑒定;(C)使用TYLCVCP抗體通過蛋白質(zhì)印跡檢測pGBKT7-TYLCVCP在酵母菌株中表達(dá)(≈46kDa);(D)誘餌載體pGBKT7-TYLCVCP自激活檢測。pGBKT7-p53和pGADT7-LargeT為陽性對照,pGBKT7-p53和pGADT7為陰性對照。Fig3.1IdentificationofwhiteflythatinteractwithTYLCVCPusingtheY2Hsystem.(A)Schematicdiagramofworkflowforthesystem.(B)PCRidentificationofinsertsintheprimarywhiteflycDNAlibrary.(C)ExpressionofpGBKT7-TYLCVCPinyeastwasidentifiedusingwesternblotbyantibodyofTYLCVCP(≈46kDa).(D)Auto-activationdetectionofbaitvectorpGBKT7-TYLCVCPinyeast.pGBKT7-p53andpGADT7-LargeTwereusedaspositivecontrols;pGBKT7-p53andpGADT7wereusedasnegativecontrols.
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文通過酵母雙雜交核系統(tǒng)篩選與TYLCVCP互作的煙粉虱蛋白33SD/-Trp-Leu-His-Ade(含有X-α-Gal和AbA)選擇性培養(yǎng)基上生長且變藍(lán),則說明兩個蛋白之間存在互作(圖3.2A),并構(gòu)建互作蛋白之間的網(wǎng)絡(luò)圖(圖3.2B)。圖3.2煙粉虱蛋白與TYLCVCP蛋白之間的相互作用。(A)采用酵母雙雜交核系統(tǒng)驗(yàn)證TYLCVCP與篩選得到的煙粉虱蛋白之間的互作。pGBKT7-TYLCVCP和15個獵物質(zhì)粒分別共轉(zhuǎn)酵母菌株,并在DDO和QDO/X/A兩種選擇性培養(yǎng)基上培養(yǎng)生長,pGBKT7-p53和pGADT7-LargeT作為陽性對照(+),pGBKT7-p53和pGADT7作為陰性對照(-);(B)15個候選煙粉虱蛋白與TYLCVCP蛋白的互作網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)使用Cytoscape生成,紅線表示從數(shù)據(jù)庫搜索工具中預(yù)測的互作(STRING9.1;http://stringdb.org),黑線代表從酵母雙雜交核系統(tǒng)中驗(yàn)證的互作蛋白。Fig3.2InteractionsbetweenwhiteflyproteinsandTYLCVCP.(A)VerificationofinteractionsbetweenTYLCVCPandidentifiedwhiteflyproteinsusingY2Hassay.TYLCVCPand15respectivepreyproteinswereusedtocotransformyeastforgrowthonDDOandQDO/X/Aselectivemedium.pGBKT7-p53andpGADT7-LargeTwereusedaspositivecontrols(+);pGBKT7-p53andpGADT7wereusedasnegativecontrols(-).(B)Proteininteractionnetworkanalysisof15candidatewhiteflyproteinsandTYLCVCP.ThisnetworkwasgeneratedwithCytoscape.Theredlinemeanstheinteractionpredictedfromthedatabasesearchtoolfortheretrievalofinteractingproteins(STRING9.1;http://stringdb.org),andtheblacklinestandsfortheinteractionsupportedbyY2Hassaysystem.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙粉虱對菜豆金黃花葉病毒屬病毒的傳播:病毒對媒介昆蟲的適應(yīng)[J]. 潘李隆,遲瑤,范運(yùn)運(yùn),劉樹生. 昆蟲學(xué)報. 2019(07)
[2]Differential efficiency of a begomovirus to cross the midgut of different species of whiteflies results in variation of virus transmission by the vectors[J]. Lilong Pan,Qunfang Chen,Tao Guo,Xinru Wang,Ping Li,Xiaowei Wang,Shusheng Liu. Science China(Life Sciences). 2018(10)
[3]泛素-蛋白酶體系統(tǒng)對煙粉虱體內(nèi)番茄黃曲葉病毒的影響[J]. 夏文強(qiáng),梁燕,劉銀泉,劉樹生,王曉偉. 昆蟲學(xué)報. 2017(12)
[4]蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法及應(yīng)用的研究進(jìn)展[J]. 譚偉,黃莉,謝芝勛. 中國畜牧獸醫(yī). 2014(09)
[5]吉林番茄黃化曲葉病毒分離物的檢測及其DNA-A全基因組序列分析[J]. 王祥,李剛,趙黎明,劉金亮,辛志梅,竺曉平. 植物保護(hù). 2014(02)
[6]PaLCuCNV和TYLCCNV復(fù)合侵染引起更嚴(yán)重的番茄黃化曲葉病[J]. 熊艷,周常勇,李茵,王春艷,孫現(xiàn)超,青玲. 園藝學(xué)報. 2014(02)
[7]Molecular Detection of TYLCV Isolates from Xinjiang Autonomous Region of China and Analysis of Its DNA-A Genome Sequences[J]. Ding Yingna,Li Shifang,Zhang Sheng,Cui Yuanyu,Yang Hua,He Wei,Sun Xiaojun. Plant Diseases and Pests. 2013(06)
[8]浙江省番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定及序列分析[J]. 袁偉,萬紅建,王榮青,葉青靜,阮美穎,李志邈,周國治,姚祝平,劉云飛,楊悅儉. 分子植物育種. 2013(02)
[9]利用mtCOIPCR-RFLP技術(shù)鑒定中國境內(nèi)九個煙粉虱隱種[J]. 秦麗,王佳,邴孝利,劉樹生. 昆蟲學(xué)報. 2013(02)
[10]昆蟲天然免疫反應(yīng)分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 張明明,初源,趙章武,安春菊. 昆蟲學(xué)報. 2012(10)
碩士論文
[1]溫州地區(qū)番茄黃化曲葉病毒病流行規(guī)律與綜合防治[D]. 許方程.浙江大學(xué) 2011
本文編號:3059223
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3059223.html
最近更新
教材專著