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中國甘蔗梢腐病病原鐮刀菌的種類特異性鑒定及快速檢測(cè)

發(fā)布時(shí)間:2017-04-13 01:05

  本文關(guān)鍵詞:中國甘蔗梢腐病病原鐮刀菌的種類特異性鑒定及快速檢測(cè),,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:背景:甘蔗梢腐病是影響我國甘蔗生產(chǎn)的重要真菌性病害,病原是鐮刀菌屬。如何準(zhǔn)確鑒定并快速的診斷甘蔗梢腐病對(duì)甘蔗的病害防控和種植管理有重要的意義。方法:于2012-2013年,通過從全國各大甘蔗產(chǎn)區(qū)(福建,廣東,廣西,海南和云南等)采集甘蔗病癥葉片樣品,總共分離鑒定病原菌株113株;诤颂求wDNA的非轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(rDNA-ITS)序列聚類分析和顯微形態(tài)學(xué)觀察,首次完成鑒定影響我國甘蔗梢腐病病原的多樣性,主要為鐮刀菌屬(Fusarium)的兩個(gè)類群gxl (F. verticillioides)及gx2 (F. proliferatum)組成;贗TS的序列差異設(shè)計(jì)特異性鑒定甘蔗梢腐病病原種類的TaqMan PCR及常規(guī)PCR的方法。并以甘蔗梢腐病原Fusarium. sp和其他甘蔗真菌病原(Sporisorium scitamineum和Phoma sp.)及甘蔗內(nèi)生真菌Acremonium sp.對(duì)其檢測(cè)方法的特異性和靈敏性進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)果:依據(jù)甘蔗梢腐病原的類型gx1 (F. verticillioides)及gx2 (F. proliferatum)的ITS序列差異設(shè)計(jì)TaqMan PCR及常規(guī)PCR特異性鑒定的探針和引物,成功鑒定甘蔗梢腐病原鐮刀菌gx1和gx2類型。其中TaqMan PCR方法的靈敏性是常規(guī)PCR的1000倍以上。由于TaqMan PCR具高靈敏性及高特異性可運(yùn)用于低濃度(10pg/ul)的真菌DNA攝入的檢測(cè)及鑒定,TaqMan PCR的甘蔗梢腐病病原檢測(cè)方法成功運(yùn)用于田間甘蔗病害檢測(cè)案例的實(shí)施。結(jié)論/意義:本研究確定兩種鐮刀菌種F. verticillioides和F. proliferatum,是目前中國甘蔗梢腐病流行的主要病原。并設(shè)計(jì)一種特異性TaqMan PCR檢測(cè)方法研究這些病原體在中國甘蔗主產(chǎn)區(qū)的流行。這種方法將會(huì)廣泛運(yùn)用于甘蔗病害的基礎(chǔ)研究工作及對(duì)甘蔗病害監(jiān)測(cè)與管理。
【關(guān)鍵詞】:甘蔗梢腐病 鐮刀菌 鑒定 檢測(cè)
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S435.661
【目錄】:
  • 摘要7-8
  • Abstract8-9
  • 第一章 綜述9-21
  • 1 植物鐮刀菌研究進(jìn)展9-19
  • 1.1 病原鐮刀菌的檢測(cè)鑒定與多樣性9-12
  • 1.2 鐮刀菌的侵染及其與寄主互作12-15
  • 1.3 鐮刀菌的次生代謝毒素15-16
  • 1.4 鐮刀菌致病基因及進(jìn)化16-18
  • 1.5 甘蔗的鐮刀菌病害18-19
  • 2 展望19-20
  • 3 本研究選題及意義20-21
  • 第二章 材料與方法21-30
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料和試劑21-23
  • 2.1.1 樣品材料及菌種21
  • 2.1.2 科赫法則病原鑒定材料21
  • 2.1.3 常用生化試劑21-22
  • 2.1.4 抗生素22
  • 2.1.5 培養(yǎng)基22
  • 2.1.6 主要儀器設(shè)備22-23
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法23-30
  • 2.2.1 甘蔗梢腐病原菌的收集及分離23-24
  • 2.2.2 病原菌的致病性實(shí)驗(yàn)及科赫法則鑒定24
  • 2.2.3 病原菌的DNA提取,ITS-PCR及測(cè)序24-25
  • 2.2.4 序列拼接,比對(duì)及進(jìn)化樹分析25-26
  • 2.2.5 特異探針及引物的設(shè)計(jì)及PCR體系26-28
  • 2.2.6 PCR檢測(cè)的特異性及靈敏性評(píng)價(jià)28
  • 2.2.7 田間甘蔗葉片的病原檢測(cè)案例實(shí)施28-30
  • 第三章 結(jié)果30-43
  • 3.1 甘蔗梢腐病原菌的鑒定及形態(tài)學(xué)分析30-33
  • 3.1.1 甘蔗梢腐病鐮刀菌的ITS聚類分析30-32
  • 3.1.2 梢腐病原真菌的形態(tài)學(xué)分析及病原鑒定32-33
  • 3.2 特異探針及引物設(shè)計(jì)33-35
  • 3.3 TaqMan PCR及常規(guī)PCR檢測(cè)的特異性及靈敏性35-40
  • 3.3.1 TaqMan PCR及常規(guī)PCR檢測(cè)的特異性比較35-38
  • 3.3.2 TaqMan PCR及常規(guī)PCR檢測(cè)的靈敏性比較38-40
  • 3.4 田間甘蔗葉片樣品的病原快速診斷案例實(shí)施40-43
  • 第四章 討論43-47
  • 4.1 中國甘蔗梢腐病的病原鑒定分析43-44
  • 4.2 運(yùn)用PCR技術(shù)的植物病原診斷研究44-45
  • 4.3 田間甘蔗梢腐病病原的診斷分析45
  • 4.4 結(jié)論45-47
  • 參考文獻(xiàn)47-54
  • 附錄一54-56
  • 附錄二56-61
  • 附錄三61-62
  • 致謝62-63
  • 附件63-73

【相似文獻(xiàn)】

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2 張玉娟;甘蔗梢腐病病原分子檢測(cè)及甘蔗組合、品種的抗病性評(píng)價(jià)[D];福建農(nóng)林大學(xué);2009年


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本文編號(hào):302435

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