番茄SlR1-A-like基因的克隆及功能分析
發(fā)布時間:2021-01-26 05:47
番茄是我國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中重要的經(jīng)濟作物,但其在生長過程中經(jīng)常遭受各種不利環(huán)境的威脅,給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成重大經(jīng)濟損失。隨著生物技術(shù)的發(fā)展,通過基因工程手段提高植物的抗逆性已成為十分可行的方法,而此技術(shù)的關(guān)鍵在于對抗逆基因的挖掘與研究。本研究首次從番茄中克隆得到SlR1-A-like基因,成功構(gòu)建了過表達載體,并獲得轉(zhuǎn)基因本氏煙草植株,對轉(zhuǎn)基因植株在冷脅迫及致病疫霉侵染過程中所發(fā)揮的作用進行探究,具體研究結(jié)果如下:(1)生物信息學分析表明,SlR1-A-like基因全長1701 bp,編碼566個氨基酸,所形成的SlR1-A-like蛋白為親水性、非跨膜蛋白,該蛋白具有NB-ARC功能結(jié)構(gòu)域,蛋白分子量為65.7kDa,等電點為5.69。(2)組織表達分析結(jié)果表明,SlR1-A-like基因在番茄葉片中表達量最高。非生物脅迫及激素誘導(dǎo)下SlR1-A-like基因表達模式分析結(jié)果表明,該基因在不同處理下均有一定程度的表達響應(yīng),以冷脅迫和SA處理后SlR1-A-like基因表達上調(diào)效果最明顯。亞細胞定位結(jié)果表明,SlR1-A-like蛋白定位在細胞核與細胞質(zhì)。(3)對轉(zhuǎn)基因和野生型本氏煙草進行冷脅迫處...
【文章來源】: 劉海震 山東農(nóng)業(yè)大學
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
SlR1-A-like蛋白親水性/疏水性預(yù)測及跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測
山東農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文33圖3-2SlR1-A-like蛋白結(jié)構(gòu)分析(A)功能結(jié)構(gòu)域;(B)二級結(jié)構(gòu);(C)三級結(jié)構(gòu)。Fig.3-2StructuralanalysisofSlR1-A-likeprotein(A)Functionaldomain;(B)Secondarystructure;(C)Tertiarystructure.3.1.3SlR1-A-like蛋白的同源蛋白比對分析通過NCBI網(wǎng)站查找得到不同物種中同源蛋白的氨基酸序列,利用DNAMAN軟件對不同氨基酸序列進行比對,比對結(jié)果發(fā)現(xiàn),所有同源蛋白均具有NB-ARC保守結(jié)構(gòu)域(圖3-3)。利用MEGA5.0軟件建立進化關(guān)系樹,進化樹分析表明,SlR1-A-like蛋白在相同物種中與SlMi-1C蛋白親緣關(guān)系最近,在不同物種中與鱗莖茄的SbRpi-blb2蛋白親緣關(guān)系最近(圖3-4)。
番茄SlR1-A-like基因的克隆及功能分析34圖3-3SlR1-A-like氨基酸多序列比對Fig.3-3MultiplesequencealignmentsofSlR1-A-likeproteins圖3-4SlR1-A-like同源蛋白進化樹分析Fig.3-4EvolutionarytreeanalysisofSlR1-A-likehomologousproteins
【參考文獻】:
期刊論文
[1]宿松地區(qū)油茶煤污病的發(fā)生及防治[J]. 余英才. 農(nóng)業(yè)災(zāi)害研究. 2019(02)
[2]番茄青枯病綜合防治研究進展[J]. 謝秀明,沈虹,孫錦. 中國果菜. 2018(11)
[3]耐低溫弱光番茄新品種唐粉108的選育[J]. 陳勝萍,周國順,劉曉光,陳志. 中國蔬菜. 2018(08)
[4]番茄抗晚疫病基因Ph-3的分子標記開發(fā)及應(yīng)用[J]. 胡明瑜,白文欽,潘曉雪,吳紅,汝學娟,羅佳,尹賢貴,潘光輝,雷開榮. 植物病理學報. 2018(04)
[5]植物抗寒性研究進展[J]. 李文明,辛建攀,魏馳宇,田如男. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(12)
[6]外源水楊酸誘導(dǎo)對番茄幼苗抗冷性的影響[J]. 張帆,李景富,姜景彬,張賀,陳秀玲,許向陽. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(03)
[7]番茄褪綠病毒病研究進展[J]. 王志榮,王孝宣,杜永臣,高建昌,國艷梅,黃澤軍. 園藝學報. 2016(09)
[8]番茄抗病育種研究進展[J]. 劉健,劉娜. 上海蔬菜. 2016(01)
[9]木本植物低溫脅迫生理及分子機制研究進展[J]. 烏鳳章,王賀新,徐國輝,張自川. 林業(yè)科學. 2015(07)
[10]植物內(nèi)源激素研究進展[J]. 段娜,賈玉奎,徐軍,陳海玲,孫鵬. 中國農(nóng)學通報. 2015(02)
博士論文
[1]SIGLRs和SICaMs在調(diào)控番茄低溫抗性中的機制研究[D]. 李卉梓.浙江大學 2019
[2]大麥條紋花葉病毒侵染的本生煙葉綠體的三維結(jié)構(gòu)解析及其組學分析[D]. 靳雪嬌.中國農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]煙草花葉病毒弱毒疫苗的研制及其分子生物學[D]. 邵碧英.福建農(nóng)林大學 2001
碩士論文
[1]番茄SlGAMYBL2基因克隆及非生物脅迫中的功能分析[D]. 李姍姍.廣西大學 2018
[2]煙草NtR1-A-like基因的克隆和功能分析[D]. 劉斌.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]炭疽菌侵染后茶樹cDNA-AFLP體系構(gòu)建和基因差異表達研究[D]. 賴建東.福建農(nóng)林大學 2016
[4]不同砧木番茄嫁接苗耐冷性生理機制的研究[D]. 程群科.西南大學 2012
本文編號:3000581
【文章來源】: 劉海震 山東農(nóng)業(yè)大學
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
SlR1-A-like蛋白親水性/疏水性預(yù)測及跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測
山東農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文33圖3-2SlR1-A-like蛋白結(jié)構(gòu)分析(A)功能結(jié)構(gòu)域;(B)二級結(jié)構(gòu);(C)三級結(jié)構(gòu)。Fig.3-2StructuralanalysisofSlR1-A-likeprotein(A)Functionaldomain;(B)Secondarystructure;(C)Tertiarystructure.3.1.3SlR1-A-like蛋白的同源蛋白比對分析通過NCBI網(wǎng)站查找得到不同物種中同源蛋白的氨基酸序列,利用DNAMAN軟件對不同氨基酸序列進行比對,比對結(jié)果發(fā)現(xiàn),所有同源蛋白均具有NB-ARC保守結(jié)構(gòu)域(圖3-3)。利用MEGA5.0軟件建立進化關(guān)系樹,進化樹分析表明,SlR1-A-like蛋白在相同物種中與SlMi-1C蛋白親緣關(guān)系最近,在不同物種中與鱗莖茄的SbRpi-blb2蛋白親緣關(guān)系最近(圖3-4)。
番茄SlR1-A-like基因的克隆及功能分析34圖3-3SlR1-A-like氨基酸多序列比對Fig.3-3MultiplesequencealignmentsofSlR1-A-likeproteins圖3-4SlR1-A-like同源蛋白進化樹分析Fig.3-4EvolutionarytreeanalysisofSlR1-A-likehomologousproteins
【參考文獻】:
期刊論文
[1]宿松地區(qū)油茶煤污病的發(fā)生及防治[J]. 余英才. 農(nóng)業(yè)災(zāi)害研究. 2019(02)
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[3]耐低溫弱光番茄新品種唐粉108的選育[J]. 陳勝萍,周國順,劉曉光,陳志. 中國蔬菜. 2018(08)
[4]番茄抗晚疫病基因Ph-3的分子標記開發(fā)及應(yīng)用[J]. 胡明瑜,白文欽,潘曉雪,吳紅,汝學娟,羅佳,尹賢貴,潘光輝,雷開榮. 植物病理學報. 2018(04)
[5]植物抗寒性研究進展[J]. 李文明,辛建攀,魏馳宇,田如男. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(12)
[6]外源水楊酸誘導(dǎo)對番茄幼苗抗冷性的影響[J]. 張帆,李景富,姜景彬,張賀,陳秀玲,許向陽. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(03)
[7]番茄褪綠病毒病研究進展[J]. 王志榮,王孝宣,杜永臣,高建昌,國艷梅,黃澤軍. 園藝學報. 2016(09)
[8]番茄抗病育種研究進展[J]. 劉健,劉娜. 上海蔬菜. 2016(01)
[9]木本植物低溫脅迫生理及分子機制研究進展[J]. 烏鳳章,王賀新,徐國輝,張自川. 林業(yè)科學. 2015(07)
[10]植物內(nèi)源激素研究進展[J]. 段娜,賈玉奎,徐軍,陳海玲,孫鵬. 中國農(nóng)學通報. 2015(02)
博士論文
[1]SIGLRs和SICaMs在調(diào)控番茄低溫抗性中的機制研究[D]. 李卉梓.浙江大學 2019
[2]大麥條紋花葉病毒侵染的本生煙葉綠體的三維結(jié)構(gòu)解析及其組學分析[D]. 靳雪嬌.中國農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]煙草花葉病毒弱毒疫苗的研制及其分子生物學[D]. 邵碧英.福建農(nóng)林大學 2001
碩士論文
[1]番茄SlGAMYBL2基因克隆及非生物脅迫中的功能分析[D]. 李姍姍.廣西大學 2018
[2]煙草NtR1-A-like基因的克隆和功能分析[D]. 劉斌.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]炭疽菌侵染后茶樹cDNA-AFLP體系構(gòu)建和基因差異表達研究[D]. 賴建東.福建農(nóng)林大學 2016
[4]不同砧木番茄嫁接苗耐冷性生理機制的研究[D]. 程群科.西南大學 2012
本文編號:3000581
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