香蘑屬DNA條形碼的研究
本文選題:口蘑科 + 香蘑屬; 參考:《沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:香蘑屬隸屬于擔(dān)子菌門,傘菌目,口蘑科,是一類擔(dān)子果口蘑狀,孢子表面粗糙為主要特征的真菌類群。香蘑屬大部分種類具有十分重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和藥用價(jià)值。目前香蘑屬與口蘑屬、杯傘屬和金錢菌屬之間的形態(tài)特征差異不顯著,單純依靠形態(tài)特征難以準(zhǔn)確反映物種生物學(xué)上的真實(shí)性和物種間的親緣關(guān)系,常常造成人為的鑒定錯(cuò)誤。因此,尋找更為準(zhǔn)確的鑒定方法十分必要,DNA條形碼技術(shù)是當(dāng)下比較好的一個(gè)解決途徑。以香蘑屬下7個(gè)種共85份材料作為供試標(biāo)本,選擇在真菌物種鑒定或者系統(tǒng)發(fā)育分析研究中常用的基因片段 rDNA-ITS、nrDNA-LSU、nrDNA-IGS、EF1-α、RPB2、RPB1以及mtSSU作為候選基因,使用真核生物通用引物進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序,篩選該屬的DNA條形碼。將種內(nèi)與種間遺傳距離差異、序列獲得難易程度(PCR和測(cè)序成功率),物種辨別能力等三個(gè)方面作為評(píng)價(jià)指標(biāo)。結(jié)果表明ITS種間變異大而在種內(nèi)相對(duì)保守,有明顯的Barcoding gap,序列易擴(kuò)增和測(cè)序,能夠準(zhǔn)確的對(duì)香蘑屬內(nèi)種進(jìn)行區(qū)別。故而建議將ITS作為最適宜香蘑屬的DNA條形碼。本研究結(jié)合GenBank中香蘑屬物種ITS基因序列,構(gòu)建了香蘑屬的系統(tǒng)發(fā)育樹,對(duì)香蘑屬內(nèi)種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)香蘑屬為多系類群,共分為了四個(gè)不同的分支,子實(shí)體的色調(diào)、孢子大小與孢子表面的小疣數(shù)量是香蘑屬種類鑒定的重要依據(jù);樝隳⑹且粋(gè)多系類群。這些發(fā)現(xiàn)對(duì)認(rèn)識(shí)中國(guó)香蘑屬的物種多樣性具有重要的科學(xué)意義。
[Abstract]:The genus Tricholoma belongs to basidiomycetes, Umbellidae and Tricholoma. It is a kind of fungi which is mainly characterized by matsutake and rough spore surface. Most species of Tricholoma have very important economic value and medicinal value. At present, there is no significant difference between the morphological characteristics of the genus Coprinus and the genera of Tricholoma. Depending solely on the morphological characteristics, it is difficult to accurately reflect the biological authenticity of species and the relationship between species, which often results in artificial identification errors. Therefore, it is necessary to find a more accurate identification method. A total of 85 samples from 7 species of Tricholoma comatus were selected as candidate genes, rDNA-ITSnDNA-LSUnrDNA-LSUnrDNA-EGF1- 偽 RPB2RPB1 and mtSSU as candidate genes, and were amplified and sequenced by using universal primers of eukaryotes. The DNA bar code of this genus was screened. The genetic distance difference between species and species, the degree of difficulty of sequence acquisition, the success rate of sequencing and the ability of species discrimination were used as evaluation indexes. The results showed that ITS had great interspecific variation and was relatively conserved within species, with obvious Barcoding gaps.The sequence was easy to be amplified and sequenced, which could distinguish the species of Tricholoma accurately. Therefore, it is suggested that ITS be the most suitable DNA bar code for the genus Tricholoma. In this study, the phylogenetic tree of Tricholoma was constructed based on the ITS gene sequence of Tricholoma species in GenBank, and the phylogenetic relationship of Tricholoma species was analyzed. The results showed that Tricholoma is a multi-lineage group, which is divided into four branches. The color of fruiting body, the size of spores and the quantity of verruca on the surface of spores are the important basis for species identification. Flower-faced mushroom is a multi-lineage group. These findings are of great scientific significance in understanding the species diversity of Tricholoma in China.
【學(xué)位授予單位】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S646
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本文編號(hào):1796624
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