小麥骨干親本周8425B穗部性狀及株高的QTL定位
本文選題:小麥 + 周8425B ; 參考:《西北農(nóng)林科技大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:周8425B具有矮稈、高產(chǎn)、抗病等優(yōu)點,是我國最重要的骨干種質(zhì)之一。本研究以周8425B/小偃81創(chuàng)建的第八代RIL群體為試驗材料,利用Illumina公司研發(fā)的90k基因芯片進(jìn)行了全基因組掃描后,篩選出親本差異標(biāo)記,使用基于最大似然估計算法的CarthaGene軟件構(gòu)建遺傳連鎖圖譜。使用IciMapping軟件進(jìn)行多環(huán)境QTL定位。以期為小麥穗部性狀及株高的精細(xì)定位及基因克隆提供參考。1.使用90k芯片對群體進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)親本多態(tài)性標(biāo)記11037個,控制缺失率并且去除不連鎖標(biāo)記后共9290個標(biāo)記用于遺傳圖譜的構(gòu)建。共分成63個連鎖群,分布在小麥21條染色體上,遺傳連鎖圖譜總長3894.64 cM,平均密度0.42 cM。2.在三個不同環(huán)境及平均環(huán)境中共定位到77個QTL。分布在19條染色體上,包括影響穗長性狀的 QTL 18 個(PVE:4.03%-29.05%),小穗數(shù) 12 個(PVE:3.48%-15.86%),不育小穗數(shù) 14 個(PVE:3.01%-25.05%),穗粒數(shù) 11 個(PVE:2.10%-45.25%),千粒重16 個(PVE:4.79%-20.77%)和株高位點 6 個(PVE:3.95%-16.25%)。14 個 QTL 可在 2個或多個不同環(huán)境中被定位到。13個QTL包含在前人定位的區(qū)間內(nèi)或與之相近。39個位點變異解釋率(PVE)大于10%,為主效QTL。3.一些相關(guān)性較高的性狀的QTL經(jīng)常被發(fā)現(xiàn)存在于相近的染色體區(qū)域,本研究發(fā)現(xiàn)在4A、6A和7B上存在QTL富集現(xiàn)象。在4A染色體上聚集了影響穗長、不育小穗數(shù)和穗粒數(shù)的數(shù)量性狀位點。在6A上發(fā)現(xiàn)了穗長、小穗數(shù)、不育小穗數(shù)、穗粒數(shù)和千粒重的QTL;7B上定位到了控制穗長、小穗數(shù)和千粒重的QTL,這幾個位點幾乎存在于同一位置,可能為同一位點控制多個表型性狀。4.QSl.nafu-6A.2(穗長)、QSl.nafu-7A(穗長)、QSsn.nafu-2A.1(不育小穗數(shù))、QSsn.nafu-2D(不育小穗數(shù))和QGns.nafu-2B(穗粒數(shù))可以在多個環(huán)境下檢測出來,并且具有較高的LOD值(10)和PVE值(20%),這些位點的遺傳貢獻(xiàn)率較大,主要控制小麥穗部的生長發(fā)育。
[Abstract]:Zhou8425B is one of the most important germplasm in China because of its advantages of dwarf, high yield and disease resistance. In this study, the eighth generation of RIL population created by Zhou 8425B/ Xiaoyan 81 was used as the experimental material. The 90k gene chip developed by Illumina Company was used to scan the whole genome, and the parental differential markers were screened. Genetic linkage map is constructed by using CarthaGene software based on maximum likelihood estimation algorithm. Use IciMapping software for multi-environment QTL positioning. So as to provide reference for fine mapping and gene cloning of ear characters and plant height of wheat. A total of 9290 markers were used to construct genetic map after the deletion rate was controlled and the unlinked markers were removed by using 90k microarray to detect the population, and found that 11037 polymorphism markers of parents were used to construct the genetic map. It was divided into 63 linkage groups and distributed on 21 chromosomes of wheat. The total length of the linkage map was 3894.64 cm and the average density was 0.42 cM.2. A total of 77 QTLs were located in three different and average environments. On 19 chromosomes, Including 18 PVE: 4.03-29.05, 12 spikelets, 14 sterile spikelets, 14 sterile spikelets, 11 grains per ear, 2.10 to 45.2525, 16 thousand grain weight, 16 PVE: 4.79 -20.77) and 6 PVE: 3.95-16.2525 QTL, 14 QTL can be determined in two or more different environments. The interpretation rate of variation of 39 loci was greater than 100.The main effect was QTL.3. Some highly correlated traits of QTL were often found in similar chromosomal regions. In this study, QTL enrichment was found on 4AX6A and 7B. The quantitative trait loci affecting ear length, number of sterile spikelets and spikelets per spike were gathered on chromosome 4A. It was found that the QTLL7B with spikelet length, spikelet number, sterile spikelet number, spikelet number and 1000-grain weight were located on QTL7B with controlled panicle length, spikelet number and 1000-grain weight. Multiple phenotypic traits. 4.QSl.nafu-6A.2 (QSl.nafu-7A) (QSsn.nafu-2A.1) (sterile spikelet number / nafu-2Dsterile spikelet number) and QGns.nafu-2B (grain number per spike) could be detected in multiple environments. And it has higher LOD value (10) and PVE value (20%). The genetic contribution rate of these loci is large, which mainly controls the growth and development of the ear part of the wheat.
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S512.1
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 徐海風(fēng);竇秉德;侯北偉;朱曉濱;楊晉彬;;小麥雌性育性雙向極端群體QTL定位策略初探[J];淮陰師范學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版);2009年01期
2 田翠;張濤;蔣開鋒;楊莉;鄭家奎;;水稻QTL定位研究進(jìn)展[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2009年03期
3 蘇成付;邱新棉;李付振;;棉花QTL定位原理、方法和研究進(jìn)展[J];中國棉花;2012年08期
4 劉賓;趙亮;張坤普;朱占玲;田賓;田紀(jì)春;;小麥株高發(fā)育動態(tài)QTL定位[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年22期
5 曹修才,侯廷榮,,張桂閣,李學(xué)杰;玉米株高整齊度與穗部性狀關(guān)系的研究[J];玉米科學(xué);1996年02期
6 任永哲;徐艷花;白嬌嬌;王文靜;張慶琛;馬原松;裴冬麗;;調(diào)控小麥株高的QTL定位[J];種子;2014年03期
7 王淑玲;林波;包巖;陳麗紅;修麗;;水稻穗部性狀與品質(zhì)性狀的相關(guān)分析[J];吉林農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年05期
8 翟廣謙,陳永欣,田福海,徐惠民;玉米株高整齊度與穗部性狀的相關(guān)性分析[J];山西農(nóng)業(yè)科學(xué);1998年03期
9 李雁,王江民;玉米穗部性狀與株高整齊度相關(guān)性研究[J];云南農(nóng)業(yè)科技;1998年04期
10 李泉木,王振華,金益,呂慧穎;玉米穗部性狀與產(chǎn)量的相關(guān)分析[J];國外農(nóng)學(xué)-雜糧作物;1999年03期
相關(guān)會議論文 前10條
1 梁正偉;王志春;林鴻宣;矢野昌裕;;水稻耐堿性QTL定位分析[A];2005年全國植物逆境生理與分子生物學(xué)研討會論文摘要匯編[C];2005年
2 王曉明;蔣鋒;劉鵬飛;張姿麗;陳青春;;甜玉米主要農(nóng)藝性狀的QTL定位研究[A];2012年全國玉米遺傳育種學(xué)術(shù)研討會暨新品種展示觀摩會論文及摘要集[C];2012年
3 萬建林;;水稻耐亞鐵毒的QTL定位及遺傳分析[A];湖北省遺傳學(xué)會、江西省遺傳學(xué)會2006年學(xué)術(shù)年會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要集[C];2006年
4 馮躍;曹立勇;吳偉明;沈希宏;占小登;翟榮榮;王汝慈;陳代波;程式華;;水稻苗期耐低氮脅迫的QTL定位[A];2009年中國作物學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2009年
5 景蕊蓮;楊德龍;昌小平;;小麥幾個抗旱相關(guān)生理性狀的QTL定位分析[A];2006年中國植物逆境生理生態(tài)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編[C];2006年
6 劉文欣;;玉米多分離群體的QTL定位方法及其在育種中的應(yīng)用[A];2012年全國玉米遺傳育種學(xué)術(shù)研討會暨新品種展示觀摩會論文及摘要集[C];2012年
7 李興;王勇;程滿金;勾芒芒;;黃土高原半干旱區(qū)不同集雨補灌條件下玉米穗部性狀分析[A];現(xiàn)代節(jié)水高效農(nóng)業(yè)與生態(tài)灌區(qū)建設(shè)(上)[C];2010年
8 岳兵;薛為亞;邢永忠;靳德明;張啟發(fā);;水稻后期抗旱性QTL定位[A];湖北省遺傳學(xué)會第七次代表大會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要集[C];2004年
9 吳海濱;張淑玲;趙德剛;李迪;;水稻主要農(nóng)藝性狀的QTL定位及一個極度偏分離分子標(biāo)記的分析[A];海南生物技術(shù)研究與發(fā)展研討會論文集[C];2006年
10 李紹波;章志宏;段世華;李紹清;付彬英;李陽生;朱英國;;水稻紅蓮型細(xì)胞質(zhì)雄性不育恢復(fù)性的QTL定位[A];湖北省遺傳學(xué)會第七次代表大會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要集[C];2004年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條
1 楊菁;九刺魚適應(yīng)性進(jìn)化中形態(tài)變化及形態(tài)學(xué)數(shù)量性狀的QTL定位研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年
2 崔闊澍;彩色馬鈴薯高密度分子遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及花青素等重要性狀QTL定位[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
3 張永虎;向日葵高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及抗旱相關(guān)農(nóng)藝性狀QTL定位[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
4 劉立盤;大麥旗葉重要性狀的QTL定位[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
5 龔文兵;香菇重要農(nóng)藝性狀的QTL定位[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
6 布素紅;多親本群體QTL定位和優(yōu)異雜交組合預(yù)測[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
7 楊聰;玉米穗行數(shù)及其相關(guān)性狀的遺傳分析及QTL定位[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
8 柳海東;春性甘藍(lán)型油菜遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及開花時間的QTL定位分析[D];青海大學(xué);2015年
9 陳志德;水稻不同品種耐鎘性鑒定及耐鎘脅迫相關(guān)性狀的QTL定位[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年
10 段凌鳳;水稻植株穗部性狀在體測量研究[D];華中科技大學(xué);2013年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 陰濤;甘藍(lán)型油菜株高和角果長及其相關(guān)性狀QTL定位[D];西南大學(xué);2015年
2 尹增奇;玉米籽粒構(gòu)型和葉片鋅鐵銅錳含量的QTL定位及相關(guān)分析[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
3 陳紅林;牙鲆家系數(shù)量遺傳分析及變態(tài)期偏轉(zhuǎn)方向的QTL定位[D];上海海洋大學(xué);2015年
4 凡迪;小麥植酸含量的QTL定位及其相關(guān)分析[D];貴州大學(xué);2015年
5 趙卜;小麥溫敏雄性不育系BNS恢復(fù)系9833恢復(fù)基因的遺傳分析及QTL定位[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
6 彭艷;番茄早熟性相關(guān)性分析及QTL定位[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
7 丁娟;甘藍(lán)型油菜苗期耐鹽生理及相關(guān)基因的QTL定位[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
8 葉亞瓊;小麥株高和千粒重QTL定位及其元分析[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
9 劉靖;小麥抗倒伏相關(guān)莖稈性狀的QTL定位[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
10 唐海強;托桂型菊花花器性狀的遺傳分析及其QTL定位[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
本文編號:1791525
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/1791525.html