基于iTRAQ技術(shù)的木薯野生種和栽培種塊根蛋白質(zhì)組學(xué)研究
發(fā)布時間:2017-12-16 17:27
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【摘要】:木薯(Manihot esculenta Crantz)是大戟科(Euphorbiaceae)木薯屬(Manihot)作物,是一種重要的淀粉作物,也是熱帶、亞熱帶地區(qū)近8億人賴以生存的主要食物來源。其塊根除可作為人類糧食來源外,還可以被用作飼料和重要的工業(yè)原料,同時在醫(yī)藥、造紙、紡織、化工等方面均有重要作用。由于木薯淀粉具有巨大的經(jīng)濟(jì)價值,因此研究木薯塊根中淀粉合成積累調(diào)控的分子機(jī)制,對改良木薯品質(zhì)、培育高淀粉木薯品種具有重要意義。本研究以種植10個月的栽培種和野生種塊根為試驗材料,采用i TRAQ技術(shù)對野生橡膠木薯(M.glaziovii(MG))、野生近緣種(M.esculenta ssp flabellifolia(W14))、栽培種華南8號(M.esculenta cv.SC No.8(SC8))和華南205(SC205)4種木薯塊根的全蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,了解木薯野生種和栽培種塊根淀粉積累的蛋白質(zhì)調(diào)控機(jī)制,挖掘影響野生種和栽培種木薯塊根淀粉積累的重要蛋白質(zhì),為培育高產(chǎn)高淀粉的木薯優(yōu)良新品種提供理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.通過i TRAQ技術(shù)對4個木薯品種塊根蛋白質(zhì)組進(jìn)行相對定量分析,共得到譜圖402147張,通過Mascot軟件進(jìn)行分析后,匹配到的譜圖數(shù)量是45836張,其中Unique譜圖數(shù)量為33087張,共鑒定到5021個蛋白,21309個肽段,其中含16827個Unique肽段。鑒定到的蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量主要集中在10~80 k Da,肽段長度主要集中在7~102個氨基酸殘基數(shù)。2.將鑒定到的蛋白質(zhì)和COG數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,根據(jù)功能分為24類;其中預(yù)測到功能蛋白質(zhì)數(shù)量最多為826個,能量生產(chǎn)和轉(zhuǎn)化蛋白質(zhì)331個,氨基酸運(yùn)輸和代謝蛋白質(zhì)331個,碳水化合物運(yùn)輸和代謝蛋白質(zhì)351個,翻譯、核糖體結(jié)構(gòu)和生物合成蛋白質(zhì)361個,轉(zhuǎn)錄、翻譯后修飾、蛋白質(zhì)折疊和分子伴O兜鞍字,
本文編號:1296858
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