彌漫型胃癌(diffuse-type gastric cancer,DGC)是胃癌臨床病理學(xué)分型中預(yù)后最差的一種癌癥,缺乏有效的分子靶向治療藥物。因此,有必要進(jìn)一步揭示彌漫型胃癌的分子特征并篩選新的潛在藥物靶點(diǎn)。我們采用磷酸化組學(xué)技術(shù)對83例彌漫型胃癌病人的癌組織與癌旁組織的磷酸化肽段進(jìn)行富集分析與定量檢測。經(jīng)過數(shù)據(jù)的預(yù)處理與質(zhì)量控制,采用無監(jiān)督聚類算法發(fā)現(xiàn)彌漫型胃癌可在磷酸化位點(diǎn)水平進(jìn)一步分為三個(gè)分子亞型(Ph1-3)。Ph1型病人的總體生存時(shí)間要明顯好于另外兩個(gè)亞型,Ph2和Ph3型病人的總體生存時(shí)間都較短。Ph2型病人對化療較為敏感,Ph3型的病人對化療不敏感。我們進(jìn)一步采用激酶活性預(yù)測方法獲得每個(gè)病人的激酶活性譜,并基于83例病人的激酶活性譜篩選到16個(gè)候選激酶靶點(diǎn),這些激酶的活性與彌漫型胃癌的總體生存時(shí)間顯著相關(guān),集中在MTOR、cell cycle、MAPK與m RNA splicing等信號通路。此外,通過文獻(xiàn)綜述發(fā)現(xiàn),目前對于臨床組織樣本的磷酸化組數(shù)據(jù)分析工作不夠深入,沒有充分發(fā)揮磷酸化組數(shù)據(jù)的獨(dú)特優(yōu)勢。因此,我們以Clinical Proteomic Tumor An...

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圖1.1全球胃癌每10萬人發(fā)病頻次圖譜(Ajanietal.,2017)

第1章前言5一步以ClinicalProteomicTumorAnalysisConsortium(CPTAC)團(tuán)隊(duì)發(fā)表的高級別漿液型卵巢癌數(shù)據(jù)為例，總結(jié)出了磷酸化組數(shù)據(jù)分析策略，構(gòu)建了磷酸化組數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析流程，充分利用磷酸化組數(shù)據(jù)的信息，識別出活性與病人預(yù)后時(shí)間顯著相關(guān)....

圖1.2胃癌的勞倫分型(Chenetal.,2016b)

第1章前言7圖1.2胃癌的勞倫分型(Chenetal.,2016b)以病理學(xué)為基礎(chǔ)的勞倫分型將胃癌分為腸型(Intestinaltype)、彌漫型(Diffusetype)和混合型(Mixedtype)。1.3.1.2胃癌分子分型目前國際上研究胃癌分子分型的兩大工作團(tuán)隊(duì)分別是TC....

圖1.3TCGA團(tuán)隊(duì)與ACRG團(tuán)隊(duì)的胃癌分子分型與相應(yīng)分子特征(CancerGenomeAtlasResearch,2014;CorsoandGiordano,2016;Cristescuetal.,2015)

第1章前言8微衛(wèi)星穩(wěn)定/間充質(zhì)轉(zhuǎn)換型(MSS/EMT,displayinglossofcadherin)，微衛(wèi)星穩(wěn)定/TP53陰性型(MSS/TP53–)(圖1.3)。MSS/EMT亞型主要在年輕人中發(fā)病，診斷出來的時(shí)候一般已經(jīng)是晚期，并且為彌漫型胃癌，屬于預(yù)后最差的一類亞型，相....

圖1.4彌漫型胃癌的蛋白質(zhì)組分子分型(Geetal.,2018)

第1章前言10然殺傷細(xì)胞與巨噬細(xì)胞中。該課題組的蛋白質(zhì)組層面研究工作讓我們更清楚地從蛋白質(zhì)層面了解彌漫型胃癌的亞型特征與潛在藥物靶點(diǎn)，同時(shí)也是最早將蛋白質(zhì)組的分子分型與病人臨床預(yù)后關(guān)聯(lián)的主要研究工作之一，為后續(xù)課題開展奠定了重要的工作基矗圖1.4彌漫型胃癌的蛋白質(zhì)組分子分型(Ge....

本文編號：3931394