力學(xué)微環(huán)境會隨著腫瘤生長和發(fā)展改變并對腫瘤產(chǎn)生影響,胞外基質(zhì)的力學(xué)性質(zhì)既能影響腫瘤惡性表型,又能促進(jìn)腫瘤的進(jìn)程,影響腫瘤的侵襲轉(zhuǎn)移。利用軟纖維蛋白膠構(gòu)建的體外三維培養(yǎng)系統(tǒng)可以高效的篩選出具有自我更新能力的高致瘤性腫瘤再生細(xì)胞(Tumor repopulating cells,TRCs)。腫瘤再生細(xì)胞已經(jīng)在抗癌藥物的篩選、腫瘤免疫治療等研究中嶄露頭角,細(xì)胞應(yīng)力纖維骨架、Sox 2基因表達(dá)、組蛋白甲基化水平等因素都對腫瘤再生細(xì)胞的形成有重要影響,但力學(xué)微環(huán)境影響腫瘤再生細(xì)胞形成的機(jī)制并沒有系統(tǒng)的闡明。本課題以人類腫瘤細(xì)胞系HeLa細(xì)胞為研究對象,對腫瘤再生細(xì)胞形成的時序性樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq,miRNA-Seq)及全基因組DNA甲基化測序,并構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子、miRNA、靶基因的共調(diào)控網(wǎng)絡(luò),結(jié)合差異表達(dá)基因的GO和KEGG通路的富集分析,尋找腫瘤再生細(xì)胞形成中關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子、miRNA及通路,并結(jié)合實驗驗證系統(tǒng)探討生物力誘導(dǎo)腫瘤再生細(xì)胞形成的可能機(jī)制。主要研究內(nèi)容及結(jié)果如下:(1)在90 Pa三維軟膠中培養(yǎng)的腫瘤再生細(xì)胞與普通平板培養(yǎng)的細(xì)胞相比,具有更強(qiáng)的侵襲轉(zhuǎn)移能力,并且干性基...

【文章頁數(shù)】：142 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 引言
    1.2 腫瘤力學(xué)微環(huán)境
    1.3 腫瘤再生細(xì)胞
    1.4 生物信息學(xué)研究細(xì)胞調(diào)控分子網(wǎng)絡(luò)
    1.5 本文研究內(nèi)容
2 生物力誘導(dǎo)腫瘤再生細(xì)胞形成
    2.1 引言
    2.2 材料與儀器
    2.3 實驗方法
    2.4 結(jié)果與討論
    2.5 本章小結(jié)
3 腫瘤再生細(xì)胞形成的差異基因分析
    3.1 引言
    3.2 實驗方法
    3.3 結(jié)果與討論
    3.4 本章小結(jié)
4 腫瘤再生細(xì)胞關(guān)鍵基因通路分析
    4.1 引言
    4.2 材料與儀器
    4.3 實驗方法
    4.4 結(jié)果與討論
    4.5 本章小結(jié)
5 腫瘤再生細(xì)胞中CCT3作用研究
    5.1 引言
    5.2 材料與儀器
    5.3 實驗方法
    5.4 結(jié)果與討論
    5.5 本章小結(jié)
6 腫瘤再生細(xì)胞中全基因組DNA甲基化動態(tài)變化
    6.1 引言
    6.2 材料與儀器
    6.3 實驗方法
    6.4 結(jié)果與討論
    6.5 本章小結(jié)
7 總結(jié)與展望
    7.1 全文總結(jié)與討論
    7.2 研究展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 Ⅰ 攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文
附錄 Ⅱ 主要縮略詞表



本文編號：3855683