手足口�。℉and,foot,and mouth disease,HFMD）是一種常見于5歲以下嬰幼兒和兒童的急性傳染性疾病,少數(shù)患兒并發(fā)病毒性腦炎、腦干腦炎、肺水腫、急性弛緩性麻痹等重癥甚至死亡。過去的二十年里,HFMD在世界范圍內(nèi),特別是亞太平洋地區(qū)頻頻暴發(fā),已成為亞太地區(qū)重要公共衛(wèi)生問題之一。二十余種腸道病毒（Enterovirus,EV）可引起HFMD,其中EV-A組的EV-A71、CV-A16、CV-A6、CV-A10等為引起暴發(fā)和流行的主要病原。EV-A71感染易導致重癥和死亡,為HFMD疫苗研發(fā)的首個目標。單價EV-A71滅活疫苗于2015年12月在我國大陸獲批,并逐漸推廣應用。本研究的第一部分內(nèi)容為基于Genbank中收錄的世界范圍歷年EV-A71序列建立數(shù)據(jù)庫,應用基于聚類的貝葉斯方法、系統(tǒng)地理發(fā)生學方法和群體動態(tài)分析方法,對世界和我國大陸地區(qū)EV-A71的演化和時空動態(tài)進行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)歐洲為歷史上世界EV-A71流行的核心輸出地,顯著輸出路徑遷移率總和為5.89transition/年,東亞對EV-A71的流行和演化起到樞紐作用;而我國大陸地區(qū)核心輸出地為華東地區(qū)... 

【文章頁數(shù)】：176 頁

【學位級別】：博士

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縮略詞表
摘要
Abstract
第一章 腸道病毒71型分子流行動態(tài)研究
    1.前言
        1.1 EV-A71結(jié)構(gòu)和功能位點
            1.1.1 EV-A71結(jié)構(gòu)概述
            1.1.2 EV-A71中和表位
            1.1.3 EV-A71毒力位點
            1.1.4 EV-A71抗原位點
            1.1.5 2A蛋白
        1.2 群體動態(tài)推斷
        1.3 系統(tǒng)地理發(fā)生學
        1.4 適應性進化及選擇壓力分析
        1.5 本研究目的和意義
    2.材料和方法
        2.1 分析材料
            2.1.1 EV-A71序列的獲取和篩選
            2.1.2 分析設(shè)備
            2.1.3 主要分析軟件
        2.2 分析方法
            2.2.1 核苷酸序列替換飽和檢驗
            2.2.2 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
            2.2.3 貝葉斯進化起源分析
            2.2.4 系統(tǒng)地理發(fā)生學分析
            2.2.5 群體動態(tài)推斷
            2.2.6 基因選擇壓力和位點差異分析
            2.2.7 重組分析
    3.結(jié)果
        3.1 數(shù)據(jù)篩選結(jié)果
        3.2 系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果
            3.2.1 世界范圍EV-A71系統(tǒng)發(fā)育樹
            3.2.2 世界范圍EV-A71的傳播和演化
            3.2.3 我國大陸EV-A71的傳播和演化
        3.3 群體動態(tài)結(jié)果
            3.3.1 EV-A71歷史動態(tài)
            3.3.2 2015 年后流行的基因亞型的歷史動態(tài)
        3.4 選擇壓力分析和關(guān)鍵位點變異結(jié)果
            3.4.1 2015 年后流行株各基因選擇壓力分析
            3.4.2 2A-102位點分析
            3.4.3 2015 年后流行株關(guān)鍵位點變異情況
        3.5 重組分析結(jié)果
    4.討論
    5.小結(jié)
第二章 EV-A71 疫苗應用后HFMD流行病學研究
    1 前言
        1.1 我國大陸HFMD流行病學研究現(xiàn)狀
            1.1.1 病原構(gòu)成特征
            1.1.2 分子流行病學特征
            1.1.3 血清流行病學進展
        1.2 疫苗研發(fā)策略
        1.3 本研究的目的和意義
        1.4 技術(shù)路線
    2 材料和方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 樣本來源
            2.1.2 細胞和毒株
            2.1.3 試劑和耗材
            2.1.4 儀器設(shè)備
            2.1.5 主要試劑配制
        2.2 方法
            2.2.1.HFMD病例標本核酸檢測
            2.2.2.血清學檢測
    3 結(jié)果
        3.1 HFMD病原譜
            3.1.1 HFMD病原譜
        3.2 2018 ~2019年廣東和江蘇HFMD主要病原的分子流行病學
            3.2.1 EV-A71分子流行病學
            3.2.2 CV-A16分子流行病學
            3.2.3 CV-A6分子流行病學
            3.2.4 CV-A10分子流行病學
        3.3 EV血清流行病學調(diào)查結(jié)果
            3.3.1 血清流調(diào)樣本分布情況
            3.3.2 HFMD主要病原中和抗體陽性率和GMT
            3.3.3 中和抗體陽性率和GMT的月齡分布特征
            3.3.4 陽春7種病原中和抗體檢測結(jié)果
            3.3.5 抗體水平高低分布情況
            3.3.6 多種EV感染
        3.4 EV-A71疫苗免疫原性和交叉中和
    4 討論
    5 小結(jié)
第三章 總結(jié)與展望
    1 總結(jié)
    2 下一步計劃
    3 創(chuàng)新點
    4 展望
參考文獻
綜述
    參考文獻
在讀期間論文發(fā)表情況
附錄
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3693290