肝細(xì)胞癌（以下簡稱肝癌）占原發(fā)性肝癌的80%以上,是最常見的惡性腫瘤之一。肝癌起病隱匿,惡性程度極高,現(xiàn)有的篩查與早期診斷方式對肝癌診斷靈敏度不高,亟需探尋更有效的診斷標(biāo)志物。肝切除術(shù)仍然是最佳的治療選擇,但術(shù)后5年生存率僅為30-50%,復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移率則超過60%,因此篩選對肝癌患者總體生存及復(fù)發(fā)有預(yù)測作用的標(biāo)志物,對術(shù)后的個體化監(jiān)測與治療具有重要意義。代謝組學(xué)致力于研究生物體對環(huán)境、疾病以及遺傳變異等壓力因素影響的最終應(yīng)答,它的提出為發(fā)現(xiàn)潛在腫瘤標(biāo)志物提供了新思路。目前已有學(xué)者利用色譜、質(zhì)譜、核磁共振等技術(shù)平臺從患者血液、尿液、組織等標(biāo)本中尋找代謝差異,發(fā)現(xiàn)潛在的肝癌標(biāo)志物,但絕大多數(shù)研究只采用了非靶向代謝組學(xué)研究,而且只分析了單一種類的生物樣本,其器官靶向性與臨床應(yīng)用受到極大限制。在本研究中,通過結(jié)合非靶向與靶向代謝組學(xué)分析方法,對肝癌組織與血清樣本中的代謝物進(jìn)行檢測,篩選具有器官靶向性的診斷與預(yù)后標(biāo)志物。在本研究的第一部分,對312例肝臟組織（156對肝癌與癌旁）進(jìn)行了代謝組學(xué)分析,通過兩步萃取法對親水性與親脂性代謝物分別提取檢測,建立正交偏最小二乘法判別分析（OPLS-DA）模型... 

【文章來源】：中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校

【文章頁數(shù)】：121 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

非靶向代謝組學(xué)PCA模型（A）親水性代謝物ESI+模式；（B）親水性代謝物ESI-模式；（C）親脂性代謝物ESI+模式；（D）親脂性代謝物ESI-模式

海軍軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文（三）代謝組學(xué) OPLS-DA 模型建立由于 PCA 模型對無法較好的區(qū)分肝癌組織與癌旁組織，因此本課題采用具有監(jiān)督性的 OPLS-DA 模型對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，即在模型擬合前先對不同組別的樣本人為分組，以獲得對 HCT 與 DNT 分組差異有重要影響的變量。本研究對 156 對肝癌（藍(lán)）與癌旁組織（綠）進(jìn)行代謝組學(xué)分析后，建立 OPLS-DA 模型，對于親水性代謝物在 ESI+模式下（圖 3A），其 OPLS-DA 模型解釋率 R2Y為 0.743，預(yù)測率 Q2為 0.719；對于親水性代謝物在 ESI-模式下（圖 3B），R2Y 為0.865，Q2為 0.847；對于親脂性代謝物在 ESI+模式下（圖 3C），R2Y 為 0.79，Q2 為0.766；對于親脂性代謝物在 ESI-模式下（圖 3D），R2Y 為 0.832，Q2為 0.809。R2Y為模型解釋率，Q2為預(yù)測率，兩者數(shù)值越接近與 1，表明模型效果越好。

- 21 -圖 4 OPLS-DA 模型三維得分圖 （A）親水性代謝物 ESI+模式；（B）親水性代謝物 ESI-模式；（C）親脂性代謝物 ESI+模式；（D）親脂性代謝物 ESI-模式為了考察該模型是否存在過度擬合的情況，本研究對上述 4 個模型均進(jìn)行重采集建模（7-fold cross permutation test）。200 次重采集后，對于親水性代謝物在 ESI+模式下（圖 5A），其 R2Y-intercept 為 0.059，Q2-intercept 為-0.135；對于親水性代謝物在 ESI-模式下（圖 5B），R2Y-intercept 為 0.076，Q2-intercept 為-0.158；對于親脂性代謝物在 ESI+模式下（圖 5C），R2Y-intercept 為 0.077，Q2-intercept 為-0.149；對于親脂性代謝物在 ESI-模式下（圖 5D），R2Y-intercept 為 0.076，Q2-intercept 為-0.15。在以上圖中，左側(cè) R2Y-intercept 與 Q2-intercept 均低于右側(cè)數(shù)值，且 Q2-intercept 均低于 0。根據(jù)以上參數(shù)，OPLS-DA 均不存在過度擬合的現(xiàn)象，因此該代謝模型穩(wěn)定可靠，可以用于肝組織代謝組學(xué)的分析。


本文編號：3532940