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呼吸機(jī)誘導(dǎo)肺損傷動(dòng)物模型中的長鏈非編碼RNAs提示其潛在炎癥作用

發(fā)布時(shí)間:2021-10-29 11:29
  第一部分呼吸機(jī)誘導(dǎo)肺損傷動(dòng)物模型中的長鏈非編碼RNAs提示其潛在炎癥作用目的:目前,呼吸機(jī)誘導(dǎo)肺損傷(ventilator-induced lung injury,VILI)炎癥中的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因素仍未明確。長鏈非編碼RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)參與了許多疾病的炎癥反應(yīng);然而,他們在VILI中的作用尚不清楚。因此,我們?nèi)ILI小鼠動(dòng)物模型與對照小鼠的肺組織運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組測序進(jìn)行l(wèi)ncRNAs與信使RNA(messenger RNA,mRNAs)的轉(zhuǎn)錄組分析。方法:通過生物信息學(xué)分析方法,我們對lncRNAs與mRNAs表達(dá)譜及相關(guān)生物學(xué)功能進(jìn)行分析,并對VILI模型組的不同時(shí)間點(diǎn)與對照組進(jìn)行多重比較。通過轉(zhuǎn)錄組測序和qRT-PCR對差異表達(dá)的基因進(jìn)行分析。最后,我們進(jìn)行l(wèi)ncRNAs-mRNAs共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建,并分析差異表達(dá)lncRNAs的功能。成果:差異表達(dá)的mRNAs,lncRNAs-mRNAs共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,以及差異表達(dá)lncRNAs的功能分析表明其主要在免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)/炎癥過程、應(yīng)激反應(yīng)和炎癥通路中富集。同時(shí),我們發(fā)現(xiàn)一條名為Gm43181的ln... 

【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

呼吸機(jī)誘導(dǎo)肺損傷動(dòng)物模型中的長鏈非編碼RNAs提示其潛在炎癥作用


圖1大潮氣量機(jī)械通氣誘導(dǎo)VILI小鼠模型的違、鑒定??

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?北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博士論文???差異表達(dá)mRNAs的基因熱閣。??A?VILI?0?h?vs?Control?B?VILI?6?h?vs?Control?C?VILI?6?h?vs?VILI?0?h??g???-*?*■??J?1042?934?§?1100?961?J?4?741?478??03?(0?I?^?CQ??i3?i?^"?k?、,32?丨?L??r:暹?r:;?M?署。?轟??^20?0?20?-20?0?20?-20?0?20??log2?(fold?change)?log2?(fold?change)?log2?(fold?change)??D?Total?E?Up-regulated?F?Down-regulated??VILI?6?h?vs?VILI?0?h?vs?VILI?0?h?vs?VILI?6?h?vs?VILI?6?h?vs?VILI?0?h?vs??Control?Control?Control?Control?Control?Control??1384?677?1299?705?337?624?767?333?601??i??I?!??i?i?—????g?rrh??aE??n??0?<?<??1?C?C??i?°????圖2?VILI中若異灰達(dá)mRNAs的分析??(A-C),不同比較組中差異表達(dá)mRNAs的火山圖:上調(diào)轉(zhuǎn)錄本為紅色?下調(diào)轉(zhuǎn)錄本為鉍色,未達(dá)??17??

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?北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博士論文???A?Total?B?Up-regulated?C?Down-regulated??VILI?0?h?vs?VILI?6?h?vs?VILI?0?h?vs?VILI?6?h?vs?VILI?0?h?vs?VILI?6?h?vs??Control?Control?Control?Control?Control?Control??57?25?33?12?3?9?45?22?24??D?E?F??VILI?0?h?vs?Control?VILI?6?h?vs?Control?VILI?6?h?vs?VILI?Oh??19?0%?257%??■??lincANA??57.1%?71.4%?33.3/c?55.6〇/〇?^??G?H????.???RNA-seq?^?^?§?H?RNA-seq?^?^?§??1?=]■?RT-PCR?#?#?爹?1?g^_RT_PCR?#?#?|????iMi?I?Mi??。唬?£?n""*?£?j????■>??Transcripts?name?^?^??%?%?%?%??h^F??^?<3-?^?e??jy£:-Ps?VJ?)?V3?>??o?<?<??§?c?c??3??????圖3?VILI中差異表達(dá)的IncRNAs??(A-C).不同比較組中總的、上調(diào)與下調(diào)差異表達(dá)丨ncRNAs的文氏圖;(D-E),??.個(gè)比較組中斧異??表達(dá)IncRNAs分類情況的餅狀圖;G).對照組、VILI?()?h組和V1LI?6?h組斧片?友達(dá)IncRNAs的埃??19??


本文編號:3464570

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