基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)探究健脾復(fù)方胃腸安及活性化合物木犀草素的抗胃癌作用機制
發(fā)布時間:2021-07-26 14:52
以健脾為主的中藥復(fù)方胃腸安(WCA)是上海市名中醫(yī)、龍華醫(yī)院腫瘤科邱佳信教授的臨床驗方,在改善胃癌患者脾虛證、延長生存期、降低根治術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移、減輕化療不良反應(yīng)等方面具有確切的臨床療效。實驗研究表明基于胃癌“脾虛”病機的復(fù)方胃腸安具有明確的抗致突變作用,能在胃癌的起始和啟動階段起到阻斷作用;抑制人胃癌裸小鼠皮下移植瘤的生長和原位移植瘤的轉(zhuǎn)移;抑制胃癌細(xì)胞的增殖;誘導(dǎo)胃癌細(xì)胞的凋亡;抑制胃癌細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移及上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化;調(diào)節(jié)免疫等作用。目的:從中藥復(fù)方研究的整體角度出發(fā),采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法研究復(fù)方胃腸安的核心化學(xué)成分,作用靶點及信號通路;蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析復(fù)方胃腸安作用人胃癌裸小鼠皮下移植瘤模型后差異蛋白的變化;采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析,篩選網(wǎng)絡(luò)中復(fù)方胃腸安共同作用的潛在靶點及信號通路;同時研究復(fù)方胃腸安中重要活性化合物木犀草素抗胃癌的潛在作用機制。方法:1.運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,構(gòu)建化合物-靶標(biāo)、靶標(biāo)-疾病及靶標(biāo)-通路等多水平多層次的網(wǎng)絡(luò),利用Cytoscape軟件,構(gòu)建HIPPIE(Human Interated ProteinProtein Interaction r...
【文章來源】:上海中醫(yī)藥大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:138 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
復(fù)方胃腸安中藥-化學(xué)成分熱圖
82.3復(fù)方胃腸安靶標(biāo)的生物功能分析2.3.1基因本體(GO)富集分析對復(fù)方胃腸安的306個作用靶標(biāo)及胃癌相關(guān)疾病靶標(biāo)進行基因本體的富集分析,按照1.2.4的方法,發(fā)現(xiàn)復(fù)方胃腸安在分子功能(MF)水平顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有117個,與胃癌有顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有72個;在生物過程(BP)水平,與復(fù)方胃腸安顯著相關(guān)的GO術(shù)語有1578個,與胃癌有顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有1104個;在細(xì)胞組件(CC)水平,與復(fù)方胃腸安顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有71個,與胃癌有顯著相關(guān)的GO術(shù)語有54個。圖2,圖3,圖4分別為按P值排序,取前10個關(guān)聯(lián)程度最高的GO術(shù)語。復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與胃癌顯著共關(guān)聯(lián)的前30個GO術(shù)語,見圖5所示。GO分析的MF水平,復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與胃癌在轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcriptionfactorbinding)、磷脂酰肌醇3激酶活性(phosphatidylinositol3-kinaseactivity)顯著相關(guān)。見圖2所示。圖2復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與疾病前10個關(guān)聯(lián)程度最高的GO術(shù)語(MF)Fig.2GOterminology(MF)withthehighestcorrelationbetweenthetargetofWCAandthetop10diseases.
在 GO 分析的 BP 水平,復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與疾病靶標(biāo)顯示出了較多的重疊性,主要集中在腺體發(fā)育(gland development)、ERBB2 信號通路(ERBB2 signaling pathway)、磷脂酰肌醇 3 激酶信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(phosphatidylinositol 3-kinase signaling)、肌醇脂介導(dǎo)信號(inositol lipid-mediated signaling)、蛋白質(zhì)導(dǎo)入細(xì)胞核的調(diào)控(regulation of protein import into nucleus)、核質(zhì)轉(zhuǎn)運的正調(diào)控(positive regulation of nucleocytoplasmic transport)、蛋白調(diào)控(regulation of protein import)、核質(zhì)轉(zhuǎn)運的調(diào)控(regulation of nucleocytoplasmic transport)、細(xì)胞凋亡的負(fù)調(diào)控(negative regulation of cell adnesion),見圖 3 所示。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Performance of risk stratification systems for gastrointestinal stromal tumors: A multicenter study[J]. Tao Chen,Liang-Ying Ye,Xing-Yu Feng,Hai-Bo Qiu,Peng Zhang,Yi-Xin Luo,Li-Yi Yuan,Xin-Hua Chen,Yan-Feng Hu,Hao Liu,Yong Li,Kai-Xiong Tao,Jiang Yu,Guo-Xin Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(10)
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的含水蛭經(jīng)方抗腫瘤機制研究[J]. 曾潔,麥榮云,阮景晟,鞠佳霓,王宗玉,陳闖. 廣西醫(yī)學(xué). 2019(04)
[3]Luteolin induces hippocampal neurogenesis in the Ts65Dn mouse model of Down syndrome[J]. Wen-Bo Zhou,Zong-Ning Miao,Bin Zhang,Wei Long,Fang-Xiu Zheng,Jing Kong,Bin Yu. Neural Regeneration Research. 2019(04)
[4]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的康萊特注射液3種主要成分抗腫瘤機制研究[J]. 王博龍. 中國現(xiàn)代應(yīng)用藥學(xué). 2019(01)
[5]黃芪-莪術(shù)藥對基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的抗大腸癌分子機制[J]. 劉夫艷,唐德才,譚喜瑩. 中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(13)
[6]利用定量蛋白組學(xué)的方法研究甲異靛誘導(dǎo)K562細(xì)胞凋亡的機制[J]. 毛新荷,徐穎茜,邢海燕,田征,唐克晶,劉璐,饒青,王敏,王建祥. 中國實驗血液學(xué)雜志. 2018(06)
[7]胃腸安顆粒劑與湯劑抑制人胃癌裸鼠皮下移植瘤生長、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移作用比較及對RUFY3,SNAI1,VEGF和EMT蛋白的影響[J]. 李佳,陳偉霞,李朝燕,趙愛光. 中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(05)
[8]基于iTRAQ技術(shù)的慢性心力衰竭氣虛血瘀證及氣陰兩虛證組差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 孟永梅,王偉. 世界中醫(yī)藥. 2018(09)
[9]基于生物信息學(xué)方法分析復(fù)方苦參注射液治療肝癌的分子生物學(xué)機制[J]. 黃坤,陳偉偉,劉銳,劉承利. 山西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2018(09)
[10]健脾中藥胃腸安對胃癌MKN45細(xì)胞侵襲遷移能力的影響[J]. 陳偉霞,牛垚飛,陳彬,丁亞杰,唐亞榮,趙愛光. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2018(09)
本文編號:3303773
【文章來源】:上海中醫(yī)藥大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:138 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
復(fù)方胃腸安中藥-化學(xué)成分熱圖
82.3復(fù)方胃腸安靶標(biāo)的生物功能分析2.3.1基因本體(GO)富集分析對復(fù)方胃腸安的306個作用靶標(biāo)及胃癌相關(guān)疾病靶標(biāo)進行基因本體的富集分析,按照1.2.4的方法,發(fā)現(xiàn)復(fù)方胃腸安在分子功能(MF)水平顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有117個,與胃癌有顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有72個;在生物過程(BP)水平,與復(fù)方胃腸安顯著相關(guān)的GO術(shù)語有1578個,與胃癌有顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有1104個;在細(xì)胞組件(CC)水平,與復(fù)方胃腸安顯著關(guān)聯(lián)的GO術(shù)語有71個,與胃癌有顯著相關(guān)的GO術(shù)語有54個。圖2,圖3,圖4分別為按P值排序,取前10個關(guān)聯(lián)程度最高的GO術(shù)語。復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與胃癌顯著共關(guān)聯(lián)的前30個GO術(shù)語,見圖5所示。GO分析的MF水平,復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與胃癌在轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcriptionfactorbinding)、磷脂酰肌醇3激酶活性(phosphatidylinositol3-kinaseactivity)顯著相關(guān)。見圖2所示。圖2復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與疾病前10個關(guān)聯(lián)程度最高的GO術(shù)語(MF)Fig.2GOterminology(MF)withthehighestcorrelationbetweenthetargetofWCAandthetop10diseases.
在 GO 分析的 BP 水平,復(fù)方胃腸安靶標(biāo)與疾病靶標(biāo)顯示出了較多的重疊性,主要集中在腺體發(fā)育(gland development)、ERBB2 信號通路(ERBB2 signaling pathway)、磷脂酰肌醇 3 激酶信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(phosphatidylinositol 3-kinase signaling)、肌醇脂介導(dǎo)信號(inositol lipid-mediated signaling)、蛋白質(zhì)導(dǎo)入細(xì)胞核的調(diào)控(regulation of protein import into nucleus)、核質(zhì)轉(zhuǎn)運的正調(diào)控(positive regulation of nucleocytoplasmic transport)、蛋白調(diào)控(regulation of protein import)、核質(zhì)轉(zhuǎn)運的調(diào)控(regulation of nucleocytoplasmic transport)、細(xì)胞凋亡的負(fù)調(diào)控(negative regulation of cell adnesion),見圖 3 所示。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Performance of risk stratification systems for gastrointestinal stromal tumors: A multicenter study[J]. Tao Chen,Liang-Ying Ye,Xing-Yu Feng,Hai-Bo Qiu,Peng Zhang,Yi-Xin Luo,Li-Yi Yuan,Xin-Hua Chen,Yan-Feng Hu,Hao Liu,Yong Li,Kai-Xiong Tao,Jiang Yu,Guo-Xin Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(10)
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的含水蛭經(jīng)方抗腫瘤機制研究[J]. 曾潔,麥榮云,阮景晟,鞠佳霓,王宗玉,陳闖. 廣西醫(yī)學(xué). 2019(04)
[3]Luteolin induces hippocampal neurogenesis in the Ts65Dn mouse model of Down syndrome[J]. Wen-Bo Zhou,Zong-Ning Miao,Bin Zhang,Wei Long,Fang-Xiu Zheng,Jing Kong,Bin Yu. Neural Regeneration Research. 2019(04)
[4]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的康萊特注射液3種主要成分抗腫瘤機制研究[J]. 王博龍. 中國現(xiàn)代應(yīng)用藥學(xué). 2019(01)
[5]黃芪-莪術(shù)藥對基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的抗大腸癌分子機制[J]. 劉夫艷,唐德才,譚喜瑩. 中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(13)
[6]利用定量蛋白組學(xué)的方法研究甲異靛誘導(dǎo)K562細(xì)胞凋亡的機制[J]. 毛新荷,徐穎茜,邢海燕,田征,唐克晶,劉璐,饒青,王敏,王建祥. 中國實驗血液學(xué)雜志. 2018(06)
[7]胃腸安顆粒劑與湯劑抑制人胃癌裸鼠皮下移植瘤生長、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移作用比較及對RUFY3,SNAI1,VEGF和EMT蛋白的影響[J]. 李佳,陳偉霞,李朝燕,趙愛光. 中國實驗方劑學(xué)雜志. 2019(05)
[8]基于iTRAQ技術(shù)的慢性心力衰竭氣虛血瘀證及氣陰兩虛證組差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 孟永梅,王偉. 世界中醫(yī)藥. 2018(09)
[9]基于生物信息學(xué)方法分析復(fù)方苦參注射液治療肝癌的分子生物學(xué)機制[J]. 黃坤,陳偉偉,劉銳,劉承利. 山西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2018(09)
[10]健脾中藥胃腸安對胃癌MKN45細(xì)胞侵襲遷移能力的影響[J]. 陳偉霞,牛垚飛,陳彬,丁亞杰,唐亞榮,趙愛光. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2018(09)
本文編號:3303773
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