基于母子細(xì)胞系及其酶消化的胎兒染色體非整倍體無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)游離DNA參考物質(zhì)的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-25 20:59
1997年,香港中文大學(xué)盧煜明教授在孕婦血漿中發(fā)現(xiàn)存在胎兒游離DNA,隨著新一代高通量測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)的出現(xiàn)及成熟,基于血漿游離DNA(cell-free DNA,cfDNA)的胎兒染色體非整倍體無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)(noninvasive prenatal testing,NIPT)成為可能。目前臨床上最常用的基于NGS的NIPT方法主要有全基因組大規(guī)模平行測(cè)序(random massively parallel sequencing,MPS)和靶向測(cè)序。NIPT技術(shù)創(chuàng)傷性小、無(wú)流產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn),且與傳統(tǒng)產(chǎn)前檢測(cè)手段相比檢測(cè)準(zhǔn)確性顯著提高。然而由于孕婦血漿中胎兒游離DNA 比例極低,針對(duì)其染色體微小差異的比較對(duì)檢測(cè)方法的準(zhǔn)確性要求很高,且NIPT流程復(fù)雜,不同環(huán)節(jié)中出現(xiàn)的各種因素,如游離DNA提取、文庫(kù)制備及GC偏倚糾正等均可導(dǎo)致不同實(shí)驗(yàn)室間檢測(cè)結(jié)果的不一致。因此,無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)迫切需要標(biāo)準(zhǔn)化,而制備出接近真實(shí)樣本的參考物質(zhì)是進(jìn)行臨床實(shí)驗(yàn)室無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)質(zhì)量保證和實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化的關(guān)鍵。國(guó)內(nèi)外現(xiàn)有的無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)參考物質(zhì)包括天然母體血漿樣本和片段化人基因組DN...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:153 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2?pET-15b載體圖譜??Figure?2.?Illustration?for?vector?pET-15b??1.2實(shí)驗(yàn)方法??
圖3?Qubit?3.0簡(jiǎn)明操作流程??Figure?3.?Quick?reference?for?Qubit?3.0??D.開啟焚光計(jì)開關(guān),點(diǎn)擊“dsDNA”選項(xiàng),再點(diǎn)擊“High?Sensitivity”選項(xiàng)屏幕進(jìn)入檢測(cè)頁(yè)面,打開檢測(cè)孔蓋,首先檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品管,將S1管插入檢孔,點(diǎn)擊“Read?Standard?1”選項(xiàng),測(cè)得數(shù)據(jù)后將S1管取出,再置入S2管,??點(diǎn)擊“Read?Standard?2”選項(xiàng),測(cè)出數(shù)據(jù)后焚光計(jì)將自動(dòng)在屏幕上繪制出條標(biāo)準(zhǔn)曲線;??E.然后將待測(cè)樣本管依次插入檢測(cè)孔中,點(diǎn)擊“Run?Samples”選項(xiàng),通過(guò)擊屏幕上的“+/-”選項(xiàng)進(jìn)行待測(cè)樣本體積的選擇,再選擇相應(yīng)所顯示的度單位,點(diǎn)擊“read?tubes”選項(xiàng)進(jìn)行各個(gè)樣本的檢測(cè),讀取所檢測(cè)濃度并記錄。??.5.2電泳驗(yàn)證DFF消化產(chǎn)物??瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證D-cfDNA??一
595nni處的吸光度值繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,經(jīng)計(jì)算得到該標(biāo)準(zhǔn)曲線的方程為:y?=?0.01786?+??0.06983x(爐=0.99197),再利用該標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出DFF蛋白的濃度為0.585?nig/mL。??結(jié)果如表9和圖6所示。??表9?BSA標(biāo)準(zhǔn)品和待測(cè)樣本的體積、蛋白量及OD595值對(duì)照表??Table?9.?List?of?volumes,?quantities?and?OD595?for?BSA?standards?and?samples??SI?S2?S3?S4?S5?S6?待測(cè)樣本??體積(pL)?0?2?4?6?8?10?6??PBS?(pL)?30?28?26?24?22?20?24??稀釋后蛋白濃??0.000?0.067?0.133?0.200?0.267?0.333?0.117??度(mg/mL)??原始樣本濃度??1.000?1.000?1.000?1.000?1.000?1.000?0.585??(mg/mL)??-54-??
本文編號(hào):3302768
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
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【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2?pET-15b載體圖譜??Figure?2.?Illustration?for?vector?pET-15b??1.2實(shí)驗(yàn)方法??
圖3?Qubit?3.0簡(jiǎn)明操作流程??Figure?3.?Quick?reference?for?Qubit?3.0??D.開啟焚光計(jì)開關(guān),點(diǎn)擊“dsDNA”選項(xiàng),再點(diǎn)擊“High?Sensitivity”選項(xiàng)屏幕進(jìn)入檢測(cè)頁(yè)面,打開檢測(cè)孔蓋,首先檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品管,將S1管插入檢孔,點(diǎn)擊“Read?Standard?1”選項(xiàng),測(cè)得數(shù)據(jù)后將S1管取出,再置入S2管,??點(diǎn)擊“Read?Standard?2”選項(xiàng),測(cè)出數(shù)據(jù)后焚光計(jì)將自動(dòng)在屏幕上繪制出條標(biāo)準(zhǔn)曲線;??E.然后將待測(cè)樣本管依次插入檢測(cè)孔中,點(diǎn)擊“Run?Samples”選項(xiàng),通過(guò)擊屏幕上的“+/-”選項(xiàng)進(jìn)行待測(cè)樣本體積的選擇,再選擇相應(yīng)所顯示的度單位,點(diǎn)擊“read?tubes”選項(xiàng)進(jìn)行各個(gè)樣本的檢測(cè),讀取所檢測(cè)濃度并記錄。??.5.2電泳驗(yàn)證DFF消化產(chǎn)物??瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證D-cfDNA??一
595nni處的吸光度值繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,經(jīng)計(jì)算得到該標(biāo)準(zhǔn)曲線的方程為:y?=?0.01786?+??0.06983x(爐=0.99197),再利用該標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出DFF蛋白的濃度為0.585?nig/mL。??結(jié)果如表9和圖6所示。??表9?BSA標(biāo)準(zhǔn)品和待測(cè)樣本的體積、蛋白量及OD595值對(duì)照表??Table?9.?List?of?volumes,?quantities?and?OD595?for?BSA?standards?and?samples??SI?S2?S3?S4?S5?S6?待測(cè)樣本??體積(pL)?0?2?4?6?8?10?6??PBS?(pL)?30?28?26?24?22?20?24??稀釋后蛋白濃??0.000?0.067?0.133?0.200?0.267?0.333?0.117??度(mg/mL)??原始樣本濃度??1.000?1.000?1.000?1.000?1.000?1.000?0.585??(mg/mL)??-54-??
本文編號(hào):3302768
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