小鼠應(yīng)對(duì)巴貝蟲(chóng)感染的蛋白調(diào)節(jié)分子機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2021-05-12 04:55
巴貝蟲(chóng)病是由巴貝蟲(chóng)(Babesia)引起的一種血液原蟲(chóng)病。全世界報(bào)道每年由巴貝蟲(chóng)病造成的損失高達(dá)數(shù)億美元。哺乳動(dòng)物是巴貝蟲(chóng)的中間宿主,蜱類是巴貝蟲(chóng)的終末宿主。近些年,新發(fā)巴貝蟲(chóng)病例報(bào)道越來(lái)越多,已對(duì)人類健康和畜牧業(yè)發(fā)展構(gòu)成了新的威脅。巴貝蟲(chóng)主要寄生于哺乳動(dòng)物的紅細(xì)胞內(nèi),通過(guò)硬蜱的吸血活動(dòng)使得其在哺乳動(dòng)物間或人與哺乳動(dòng)物間傳播;及拓愊x(chóng)病的宿主會(huì)出現(xiàn)高熱、貧血等癥狀,這是巴貝蟲(chóng)與宿主間相互拮抗的結(jié)果。雖然巴貝蟲(chóng)在發(fā)病時(shí)對(duì)宿主危害嚴(yán)重,但部分宿主能夠通過(guò)快速免疫系統(tǒng)的激活來(lái)抵御并清除巴貝蟲(chóng)而恢復(fù)健康。目前宿主的這種自身免疫調(diào)控機(jī)制尚不清楚。本研究利用基于DIA的定量和修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究BALB/c小鼠感染巴貝蟲(chóng)后脾臟、心臟和血液蛋白質(zhì)組表達(dá)和磷酸化修飾的動(dòng)態(tài)變化,找到疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的關(guān)鍵蛋白,作為疾病診斷標(biāo)志物或治療的靶分子,為巴貝蟲(chóng)預(yù)防、檢測(cè)和治療研究提供新的線索和依據(jù)。1.通過(guò)對(duì)巴貝蟲(chóng)感染小鼠不同時(shí)期脾臟組織病理學(xué)觀察,發(fā)現(xiàn)感染高峰期脾臟結(jié)構(gòu)破壞嚴(yán)重;感染后期脾臟組織可見(jiàn)棕褐色色素顆粒及較多蟲(chóng)體沉積。超微病理學(xué)觀察顯示,感染高峰期吞噬體及溶酶體數(shù)量最多,線粒體腫脹,嵴消失。感染...
【文章來(lái)源】:河北師范大學(xué)河北省
【文章頁(yè)數(shù)】:155 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第一章 巴貝蟲(chóng)及巴貝蟲(chóng)病
1.1 巴貝蟲(chóng)病原學(xué)
1.2 巴貝蟲(chóng)病的流行病學(xué)
1.3 巴貝蟲(chóng)致病機(jī)理
1.4 巴貝蟲(chóng)病的臨床癥狀
1.5 巴貝蟲(chóng)病的診斷和治療
1.6 巴貝蟲(chóng)免疫學(xué)
第二章 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
2.1 蛋白質(zhì)組概念
2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)
2.2.1 蛋白質(zhì)分離技術(shù)
2.2.1.1 雙向凝膠電泳技術(shù)
2.2.1.2 色譜
2.2.2 蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)
2.2.2.1 質(zhì)譜技術(shù)
2.2.2.2 蛋白芯片
2.3 修飾蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)
2.4 定量蛋白質(zhì)組學(xué)
2.5 生物信息學(xué)分析
2.6 瘧原蟲(chóng)侵染造成宿主蛋白質(zhì)組變化
2.7 巴貝蟲(chóng)侵染造成宿主蛋白質(zhì)組變化
第三章 本研究的目的和意義
第二篇 實(shí)驗(yàn)研究
第一章 巴貝蟲(chóng)的感染對(duì)小鼠脾臟病理變化及免疫功能的影響
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
1.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
1.2.3 血清提取
1.2.4 脾臟病理組織學(xué)觀察
1.2.5 脾臟超微病理學(xué)觀察
1.2.6 淋巴細(xì)胞亞群分化水平檢測(cè)
1.2.7 細(xì)胞因子水平檢測(cè)
1.3 數(shù)據(jù)處理
1.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
1.4.1 脾臟病理組織學(xué)觀察
1.4.2 脾臟超微病理學(xué)觀察
1.4.3 淋巴細(xì)胞亞群分化水平檢測(cè)
1.4.4 血清細(xì)胞因子水平檢測(cè)
1.5 討論
第二章 蛋白質(zhì)組學(xué)分析巴貝蟲(chóng)的感染對(duì)小鼠脾臟蛋白表達(dá)的影響
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
2.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
2.2.3 脾臟總蛋白的提取
2.2.4 蛋白酶解
2.2.5 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
2.2.6 DDA建庫(kù)
2.2.7 DIA質(zhì)譜分析
2.2.8 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
2.2.9 生物信息學(xué)分析
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 蛋白質(zhì)鑒定
2.3.2 Cluster聚類分析
2.3.3 GO功能注釋與分析
2.3.4 KEGG通路分析
2.4 討論
第三章 巴貝蟲(chóng)不同感染時(shí)期小鼠脾臟磷酸化蛋白的定量分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
3.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
3.2.3 脾臟總蛋白的提取
3.2.4 蛋白酶解
3.2.5 TiO_2 法富集磷酸化肽段
3.2.6 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
3.2.7 DDA建庫(kù)
3.2.8 DIA質(zhì)譜分析
3.2.9 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
3.2.10 生物信息學(xué)分析
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 磷酸化肽段定量結(jié)果
3.3.2 Cluster聚類分析
3.3.3 GO功能注釋與分析
3.3.4 KEGG通路分析
3.4 討論
第四章 蛋白質(zhì)組學(xué)分析巴貝蟲(chóng)的感染對(duì)小鼠心臟蛋白表達(dá)的影響
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
4.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
4.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
4.2.3 心臟總蛋白的提取
4.2.4 蛋白酶解
4.2.5 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
4.2.6 DDA建庫(kù)
4.2.7 DIA質(zhì)譜分析
4.2.8 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
4.2.9 生物信息學(xué)分析
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.1 蛋白質(zhì)鑒定
4.3.2 Cluster聚類分析
4.3.3 GO功能注釋與分析
4.3.5 KEGG通路分析
4.4 討論
第五章 巴貝蟲(chóng)不同感染時(shí)期小鼠心臟磷酸化蛋白的定量分析
5.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
5.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
5.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
5.2 實(shí)驗(yàn)方法
5.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
5.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
5.2.3 心臟總蛋白的提取
5.2.4 蛋白酶解
5.2.5 TiO_2 法富集磷酸化肽段
5.2.6 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
5.2.7 DDA建庫(kù)
5.2.8 DIA質(zhì)譜分析
5.2.9 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
5.2.10 生物信息學(xué)分析
5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.3.1 磷酸化肽段定量結(jié)果
5.3.2 Cluster聚類分析
5.3.3 GO功能注釋與分析
5.3.4 KEGG通路分析
5.4 討論
第六章 蛋白質(zhì)組學(xué)分析巴貝蟲(chóng)感染對(duì)小鼠血清蛋白表達(dá)的影響
6.1 實(shí)驗(yàn)材料
6.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
6.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
6.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
6.2 實(shí)驗(yàn)方法
6.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
6.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
6.2.3 血清提取
6.2.4 蛋白提取
6.2.5 酶解
6.2.6 脫鹽
6.2.7 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
6.2.8 DDA建庫(kù)
6.2.9 DIA質(zhì)譜分析
6.2.10 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
6.2.11 生物信息學(xué)分析
6.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
6.3.1 感染早期和恢復(fù)期蛋白變化
6.3.2 差異表達(dá)蛋白GO功能注釋與分析
6.3.3 差異表達(dá)蛋白KEGG分析
6.3.4 蛋白質(zhì)互作分析
6.4 討論
第七章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3182773
【文章來(lái)源】:河北師范大學(xué)河北省
【文章頁(yè)數(shù)】:155 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
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摘要
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第一篇 文獻(xiàn)綜述
第一章 巴貝蟲(chóng)及巴貝蟲(chóng)病
1.1 巴貝蟲(chóng)病原學(xué)
1.2 巴貝蟲(chóng)病的流行病學(xué)
1.3 巴貝蟲(chóng)致病機(jī)理
1.4 巴貝蟲(chóng)病的臨床癥狀
1.5 巴貝蟲(chóng)病的診斷和治療
1.6 巴貝蟲(chóng)免疫學(xué)
第二章 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
2.1 蛋白質(zhì)組概念
2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)
2.2.1 蛋白質(zhì)分離技術(shù)
2.2.1.1 雙向凝膠電泳技術(shù)
2.2.1.2 色譜
2.2.2 蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)
2.2.2.1 質(zhì)譜技術(shù)
2.2.2.2 蛋白芯片
2.3 修飾蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)
2.4 定量蛋白質(zhì)組學(xué)
2.5 生物信息學(xué)分析
2.6 瘧原蟲(chóng)侵染造成宿主蛋白質(zhì)組變化
2.7 巴貝蟲(chóng)侵染造成宿主蛋白質(zhì)組變化
第三章 本研究的目的和意義
第二篇 實(shí)驗(yàn)研究
第一章 巴貝蟲(chóng)的感染對(duì)小鼠脾臟病理變化及免疫功能的影響
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
1.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
1.2.3 血清提取
1.2.4 脾臟病理組織學(xué)觀察
1.2.5 脾臟超微病理學(xué)觀察
1.2.6 淋巴細(xì)胞亞群分化水平檢測(cè)
1.2.7 細(xì)胞因子水平檢測(cè)
1.3 數(shù)據(jù)處理
1.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
1.4.1 脾臟病理組織學(xué)觀察
1.4.2 脾臟超微病理學(xué)觀察
1.4.3 淋巴細(xì)胞亞群分化水平檢測(cè)
1.4.4 血清細(xì)胞因子水平檢測(cè)
1.5 討論
第二章 蛋白質(zhì)組學(xué)分析巴貝蟲(chóng)的感染對(duì)小鼠脾臟蛋白表達(dá)的影響
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
2.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
2.2.3 脾臟總蛋白的提取
2.2.4 蛋白酶解
2.2.5 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
2.2.6 DDA建庫(kù)
2.2.7 DIA質(zhì)譜分析
2.2.8 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
2.2.9 生物信息學(xué)分析
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 蛋白質(zhì)鑒定
2.3.2 Cluster聚類分析
2.3.3 GO功能注釋與分析
2.3.4 KEGG通路分析
2.4 討論
第三章 巴貝蟲(chóng)不同感染時(shí)期小鼠脾臟磷酸化蛋白的定量分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
3.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
3.2.3 脾臟總蛋白的提取
3.2.4 蛋白酶解
3.2.5 TiO_2 法富集磷酸化肽段
3.2.6 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
3.2.7 DDA建庫(kù)
3.2.8 DIA質(zhì)譜分析
3.2.9 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
3.2.10 生物信息學(xué)分析
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 磷酸化肽段定量結(jié)果
3.3.2 Cluster聚類分析
3.3.3 GO功能注釋與分析
3.3.4 KEGG通路分析
3.4 討論
第四章 蛋白質(zhì)組學(xué)分析巴貝蟲(chóng)的感染對(duì)小鼠心臟蛋白表達(dá)的影響
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
4.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
4.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
4.2.3 心臟總蛋白的提取
4.2.4 蛋白酶解
4.2.5 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
4.2.6 DDA建庫(kù)
4.2.7 DIA質(zhì)譜分析
4.2.8 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
4.2.9 生物信息學(xué)分析
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.1 蛋白質(zhì)鑒定
4.3.2 Cluster聚類分析
4.3.3 GO功能注釋與分析
4.3.5 KEGG通路分析
4.4 討論
第五章 巴貝蟲(chóng)不同感染時(shí)期小鼠心臟磷酸化蛋白的定量分析
5.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
5.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
5.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
5.2 實(shí)驗(yàn)方法
5.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
5.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
5.2.3 心臟總蛋白的提取
5.2.4 蛋白酶解
5.2.5 TiO_2 法富集磷酸化肽段
5.2.6 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
5.2.7 DDA建庫(kù)
5.2.8 DIA質(zhì)譜分析
5.2.9 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
5.2.10 生物信息學(xué)分析
5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.3.1 磷酸化肽段定量結(jié)果
5.3.2 Cluster聚類分析
5.3.3 GO功能注釋與分析
5.3.4 KEGG通路分析
5.4 討論
第六章 蛋白質(zhì)組學(xué)分析巴貝蟲(chóng)感染對(duì)小鼠血清蛋白表達(dá)的影響
6.1 實(shí)驗(yàn)材料
6.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及實(shí)驗(yàn)蟲(chóng)株
6.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
6.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
6.2 實(shí)驗(yàn)方法
6.2.1 巴貝蟲(chóng)的復(fù)蘇
6.2.2 巴貝蟲(chóng)感染小鼠模型建立
6.2.3 血清提取
6.2.4 蛋白提取
6.2.5 酶解
6.2.6 脫鹽
6.2.7 高pH高效液相色譜(HPLC)的樣品分級(jí)分離
6.2.8 DDA建庫(kù)
6.2.9 DIA質(zhì)譜分析
6.2.10 蛋白質(zhì)的DIA鑒定與數(shù)據(jù)分析
6.2.11 生物信息學(xué)分析
6.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
6.3.1 感染早期和恢復(fù)期蛋白變化
6.3.2 差異表達(dá)蛋白GO功能注釋與分析
6.3.3 差異表達(dá)蛋白KEGG分析
6.3.4 蛋白質(zhì)互作分析
6.4 討論
第七章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3182773
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