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下咽鱗狀細(xì)胞癌CircRNA表達(dá)譜分析以及miR-548c-3p的功能研究

發(fā)布時間:2021-03-29 19:23
  [目的]下咽鱗狀細(xì)胞癌(Hypopharyngeal squamuscell carcinoma,HSCC)是來源于下咽部組織的惡性腫瘤,具有發(fā)病隱匿、轉(zhuǎn)移早和易復(fù)發(fā)的特點(diǎn)。從分子水平找出下咽癌差異性表達(dá)的基因及其可能調(diào)控的分子機(jī)制對于下咽癌的早期診斷以及生存率的提高具有重要意義。既往研究表明,miRNA在腫瘤發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用,circRNA具有海綿吸附miRNA的功能。本課題利用二代高通量測序技術(shù)檢測HSCC組織及癌旁組織中circRNA表達(dá)譜,篩選出差異性表達(dá)的circRNAs,通過生物信息學(xué)分析其海綿吸附miR-548c-3p。細(xì)胞水平上分析下咽癌細(xì)胞中miR-548c-3p及其靶基因TP53BP2對細(xì)胞増殖、克隆形成、遷移、侵襲、周期和凋亡等生物學(xué)功能的影響。本研究為探討circRNA在下咽癌中表達(dá)情況以及海綿吸附的miR-548c-3p對下咽癌細(xì)胞(FaDu)生物學(xué)功能的影響,這些發(fā)現(xiàn)對于進(jìn)一步闡明下咽癌的發(fā)生發(fā)展機(jī)制具有重要作用,對下咽癌早期診斷的靶點(diǎn)及下咽癌腫瘤標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)提供參考。[方法]1.本文研究對象是初次接受手術(shù)治療的63例HSCC患者,在手術(shù)中... 

【文章來源】:昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁數(shù)】:118 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

下咽鱗狀細(xì)胞癌CircRNA表達(dá)譜分析以及miR-548c-3p的功能研究


圖1-3?HSCC組織和癌旁非腫瘤正常組織之間circRNA的表達(dá)譜差異??

測序,腫瘤,標(biāo)本,內(nèi)參


circular?RNAs;?PC,principal?component;?N,?normal;?T,?tumor〇??2?qRT-PCR驗證circRNAs測序結(jié)果??下咽癌中差異性表達(dá)(顯著升高或下降)的19個circRNAs?(見表1-8)對送??檢標(biāo)本(1分正常組織、3份腫瘤組織)進(jìn)行RT-qPCR檢測,18?rRNA作為circRNAs??的內(nèi)參,U6作為miRNA的內(nèi)參,p<0.05具有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果差異性表達(dá)的12??個circRNAs與RT-qPCR檢測結(jié)果一致(見圖1-4)。所得圖像信號均勻、清晰,??無邊緣效應(yīng),陽性定位和陰性定位對照區(qū)域結(jié)果明顯,證明測序結(jié)果準(zhǔn)確、可靠。??in?1?產(chǎn)?r ̄]?t—??izucULl?\drnmm,??卜一?"J?|???一1?S^A?I?1?—1?。-??I?T?\?—?\?\??丁奏一.i?■■甲養(yǎng)z:?抑?養(yǎng)一?||??!二?r?H?p?b?i?!二?i??l:dm^m?i ̄'_iLJU??■*?、>*■、》■?士?>???*?^?、‘.?一7??J■士?■士?sT?彳?>??izi?^?rT?!::]?,丨彐?n?!:q?r??IzUIjL?izUwm^_?izUuL??I??-'!?I?一,?{-"l?1????I?T?I—?T?|??..■?JL^£???i??"????T?i?.一,?1?ii??idwn&i.....?i三In7??8?^?s*-?^?j-?,?-y?令?士?v-?^?>??in?。。〇、??卜.?J_^〇〇??h-??J(?氤?M.?I??i?〇

序列,內(nèi)含子,染色體,前體


tissue?and?3?tumor?tissue).?Twelve?of?them?were?identical?with?the?results?of?cirRNAs??detection?and?sequencing.?P?<?0.05?has?statistical?significance.??3?CircRNAs環(huán)化連接的方式及其染色體中的分布情況??柱狀圖(圖1-4?A)顯示通過基因組RNA通過反向剪接的方式產(chǎn)生的circRNA??百分比的條形圖。其中外顯子環(huán)化占比排第一位,其次是內(nèi)含子環(huán)化。差異性表??達(dá)circRNA中,(升高或者降低)circRNAs中外顯子環(huán)化同樣占第一位,內(nèi)含子??及內(nèi)含子-外顯子環(huán)化主要見于高表達(dá)的circRNAs?(圖1-5B)。染色體不同條帶??上?circRNA?分別也不一樣,chrl、chr2、chr7、chrl6、chr22?中?circRNA?分布較多??(圖?1-5?C)。??A??|?■?|?|?■?|?■_??0?95?私—?E?r?P'?^?V?■?intcrgciuc_rcgion??lllllll??N_1?N_2?N_3?C_1?C_2?C_3??2S??B?180?i?c??i>i?■?r?I??g?100?■?■up-regulated?〇?15?I?I??〇?80?drcRNAs??§??'T?-?7?^?llli.llllllilllillliL??圖1-5?CircRNAs連接的方式和染色體中的分布情況??(A)前體RNA?(pre-RNA)剪接去除基因內(nèi)的非編碼內(nèi)含子序列后通過反??向剪接方式形成的circRNA其成分百分比

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人鼻咽癌組織環(huán)狀RNA差異表達(dá)分析[J]. 黃靜,李欣曉,吳偉豪,阮曉文,潘璀璇,江丹賢,余忠華.  醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報. 2018(08)
[2]c-FOS基因在下咽鱗狀細(xì)胞癌對誘導(dǎo)化療藥物敏感性中的作用研究[J]. 翟杰,王茹,王海舟,劉術(shù)舟,楊一帆,廉猛,房居高.  中國耳鼻咽喉頭頸外科. 2018(04)
[3]環(huán)狀RNA與腫瘤的研究進(jìn)展[J]. 閆寧寧,徐迎春,張鳳春.  世界華人消化雜志. 2015(35)
[4]腫瘤標(biāo)志物聯(lián)合檢測對消化系統(tǒng)腫瘤的診斷價值[J]. 王秀芹,馬宏星,嚴(yán)惟力.  標(biāo)記免疫分析與臨床. 2010(02)

博士論文
[1]下咽癌FaDu細(xì)胞放療抵抗細(xì)胞系的建立與IncRNA和mRNA表達(dá)譜的基因芯片分析[D]. 李文明.山東大學(xué) 2016



本文編號:3108060

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