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下咽鱗狀細胞癌CircRNA表達譜分析以及miR-548c-3p的功能研究

發(fā)布時間:2021-03-29 19:23
  [目的]下咽鱗狀細胞癌(Hypopharyngeal squamuscell carcinoma,HSCC)是來源于下咽部組織的惡性腫瘤,具有發(fā)病隱匿、轉(zhuǎn)移早和易復發(fā)的特點。從分子水平找出下咽癌差異性表達的基因及其可能調(diào)控的分子機制對于下咽癌的早期診斷以及生存率的提高具有重要意義。既往研究表明,miRNA在腫瘤發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用,circRNA具有海綿吸附miRNA的功能。本課題利用二代高通量測序技術檢測HSCC組織及癌旁組織中circRNA表達譜,篩選出差異性表達的circRNAs,通過生物信息學分析其海綿吸附miR-548c-3p。細胞水平上分析下咽癌細胞中miR-548c-3p及其靶基因TP53BP2對細胞増殖、克隆形成、遷移、侵襲、周期和凋亡等生物學功能的影響。本研究為探討circRNA在下咽癌中表達情況以及海綿吸附的miR-548c-3p對下咽癌細胞(FaDu)生物學功能的影響,這些發(fā)現(xiàn)對于進一步闡明下咽癌的發(fā)生發(fā)展機制具有重要作用,對下咽癌早期診斷的靶點及下咽癌腫瘤標志物的發(fā)現(xiàn)提供參考。[方法]1.本文研究對象是初次接受手術治療的63例HSCC患者,在手術中... 

【文章來源】:昆明醫(yī)科大學云南省

【文章頁數(shù)】:118 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

下咽鱗狀細胞癌CircRNA表達譜分析以及miR-548c-3p的功能研究


圖1-3?HSCC組織和癌旁非腫瘤正常組織之間circRNA的表達譜差異??

測序,腫瘤,標本,內(nèi)參


circular?RNAs;?PC,principal?component;?N,?normal;?T,?tumor〇??2?qRT-PCR驗證circRNAs測序結果??下咽癌中差異性表達(顯著升高或下降)的19個circRNAs?(見表1-8)對送??檢標本(1分正常組織、3份腫瘤組織)進行RT-qPCR檢測,18?rRNA作為circRNAs??的內(nèi)參,U6作為miRNA的內(nèi)參,p<0.05具有統(tǒng)計學意義。結果差異性表達的12??個circRNAs與RT-qPCR檢測結果一致(見圖1-4)。所得圖像信號均勻、清晰,??無邊緣效應,陽性定位和陰性定位對照區(qū)域結果明顯,證明測序結果準確、可靠。??in?1?產(chǎn)?r ̄]?t—??izucULl?\drnmm,??卜一?"J?|???一1?S^A?I?1?—1?。-??I?T?\?—?\?\??丁奏一.i?■■甲養(yǎng)z:?抑?養(yǎng)一?||??!二?r?H?p?b?i?!二?i??l:dm^m?i ̄'_iLJU??■*?、>*■、》■?士?>???*?^?、‘.?一7??J■士?■士?sT?彳?>??izi?^?rT?。海海?,丨彐?n?!:q?r??IzUIjL?izUwm^_?izUuL??I??-'!?I?一,?{-"l?1????I?T?I—?T?|??..■?JL^£???i??"????T?i?.一,?1?ii??idwn&i.....?i三In7??8?^?s*-?^?j-?,?-y?令?士?v-?^?>??in?。。〇、??卜.?J_^〇〇??h-??J(?氤?M.?I??i?〇

序列,內(nèi)含子,染色體,前體


tissue?and?3?tumor?tissue).?Twelve?of?them?were?identical?with?the?results?of?cirRNAs??detection?and?sequencing.?P?<?0.05?has?statistical?significance.??3?CircRNAs環(huán)化連接的方式及其染色體中的分布情況??柱狀圖(圖1-4?A)顯示通過基因組RNA通過反向剪接的方式產(chǎn)生的circRNA??百分比的條形圖。其中外顯子環(huán)化占比排第一位,其次是內(nèi)含子環(huán)化。差異性表??達circRNA中,(升高或者降低)circRNAs中外顯子環(huán)化同樣占第一位,內(nèi)含子??及內(nèi)含子-外顯子環(huán)化主要見于高表達的circRNAs?(圖1-5B)。染色體不同條帶??上?circRNA?分別也不一樣,chrl、chr2、chr7、chrl6、chr22?中?circRNA?分布較多??(圖?1-5?C)。??A??|?■?|?|?■?|?■_??0?95?私—?E?r?P'?^?V?■?intcrgciuc_rcgion??lllllll??N_1?N_2?N_3?C_1?C_2?C_3??2S??B?180?i?c??i>i?■?r?I??g?100?■?■up-regulated?〇?15?I?I??〇?80?drcRNAs??§??'T?-?7?^?llli.llllllilllillliL??圖1-5?CircRNAs連接的方式和染色體中的分布情況??(A)前體RNA?(pre-RNA)剪接去除基因內(nèi)的非編碼內(nèi)含子序列后通過反??向剪接方式形成的circRNA其成分百分比

【參考文獻】:
期刊論文
[1]人鼻咽癌組織環(huán)狀RNA差異表達分析[J]. 黃靜,李欣曉,吳偉豪,阮曉文,潘璀璇,江丹賢,余忠華.  醫(yī)學研究生學報. 2018(08)
[2]c-FOS基因在下咽鱗狀細胞癌對誘導化療藥物敏感性中的作用研究[J]. 翟杰,王茹,王海舟,劉術舟,楊一帆,廉猛,房居高.  中國耳鼻咽喉頭頸外科. 2018(04)
[3]環(huán)狀RNA與腫瘤的研究進展[J]. 閆寧寧,徐迎春,張鳳春.  世界華人消化雜志. 2015(35)
[4]腫瘤標志物聯(lián)合檢測對消化系統(tǒng)腫瘤的診斷價值[J]. 王秀芹,馬宏星,嚴惟力.  標記免疫分析與臨床. 2010(02)

博士論文
[1]下咽癌FaDu細胞放療抵抗細胞系的建立與IncRNA和mRNA表達譜的基因芯片分析[D]. 李文明.山東大學 2016



本文編號:3108060

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