研究背景人類疾病的發(fā)病是由基因與環(huán)境的相互作用引起的,而生活在人體體內(nèi)和人體表面的微生物目前是公認(rèn)的引起人類疾病的重要環(huán)境因素。隨著多組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,包括人類微生物組計(jì)劃（Human Microbiome Project,HMP）在內(nèi)的人類微生物組研究產(chǎn)生了豐富的資源,證實(shí)了腸道微生物通過腸-腦軸對精神疾病患病中大腦功能和行為的潛在影響,如精神分裂癥、焦慮癥和抑郁癥。在重度抑郁障礙（Major depressive disorder,MDD）患者糞便樣本中,腸道微生物組分存在顯著改變,且這種改變存在明顯的性別差異。通過將抑郁障礙患者的糞便樣本移植到無菌鼠體內(nèi)成功構(gòu)建腸道菌群重塑小鼠后,小鼠表現(xiàn)出明顯的抑郁和焦慮樣行為,提示腸道菌群紊亂在抑郁障礙發(fā)病中的病因作用。然而,介導(dǎo)腸道微生物對大腦功能和行為影響的潛在機(jī)制是非常復(fù)雜的,至今仍不清楚。蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要承擔(dān)者,它的功能由不同的翻譯后修飾（Posttranslational modifications,PTMs）調(diào)節(jié),PTMs是調(diào)節(jié)各種細(xì)胞過程的關(guān)鍵方式。賴氨酸乙�；亲钬S富且進(jìn)化上最保守的PTMs類型之一。研究表明,組蛋白乙�；�... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：145 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

腸道微生物紊亂小鼠中Kac和Ksucc位點(diǎn)鑒定

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文35酸，而Ksucc修飾位點(diǎn)則傾向于接近酸性氨基酸。此外，基于小鼠腦組織中已鑒定的各種類型修飾位點(diǎn)的PTM關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果表明，本研究中鑒定的238個(gè)Kac修飾位點(diǎn)前期已報(bào)道其乙�；淖�。同時(shí)，鑒定的347個(gè)Kac修飾位點(diǎn)和485個(gè)Ksucc修飾位點(diǎn)前期已報(bào)導(dǎo)其泛素化改變。此外，我們發(fā)現(xiàn)143個(gè)Kac修飾位點(diǎn)和186個(gè)Ksucc修飾位點(diǎn)上下游各6個(gè)氨基酸側(cè)翼距離內(nèi)存在不同類型的PTMs，包括單甲基化、二甲基化、N-糖基化、O-連接β-N-乙酰葡萄糖胺和泛素化位點(diǎn)。在腸道微生物重塑小鼠海馬組織中，Kac修飾和Ksucc修飾與磷酸化修飾的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，72%的Kac修飾位點(diǎn)和65%的Ksucc修飾位點(diǎn)位于絲氨酸磷酸化附近。圖2基序分析結(jié)果。（A）Kac和（B）Ksucc位點(diǎn)上下游氨基酸組成的熱圖。Figure2Heatmapoftheaminoacidcompositionsofthe(A)Kacand(B)Ksuccsites.表2Kac和Ksucc修飾位點(diǎn)基序分析結(jié)果。Table2MotifanalysisofalltheidentifiedKacandKsuccsites.MotifMotifScoreForegroundBackgroundFoldIncreaseMatchesSizeMatchesSizeAcetylation..........KK.........1631411222533267372.95..........KR.........161878081472242043.81..........K.K........161666212091227322.91..........K.R........10.02654551232206412.39

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文40圖3乙�；顽牾；鞍椎亩壗Y(jié)構(gòu)預(yù)測。（A）含有Kac位點(diǎn)的二級結(jié)構(gòu)的分布。（B）含有Ksucc位點(diǎn)的二級結(jié)構(gòu)的分布。（C）Kac位點(diǎn)在蛋白表面的可能性預(yù)測。（D）Ksucc位點(diǎn)在蛋白表面的可能性預(yù)測。Figure3Secondarystructurespredictionforacetylatedandsuccinylatedproteins.(A)DistributionofsecondarystructurescontainingKacsites.(B)DistributionofsecondarystructurescontainingKsuccsites.(C)PredictedsurfaceaccessibilityofKacsites.(D)Predictedsurfaceaccessi.bilityofKsuccsites.2.6差異乙�；顽牾；揎椀鞍讈喖�(xì)胞定位分析結(jié)果為了明確腸道微生物紊亂是否參與調(diào)節(jié)不同細(xì)胞室中蛋白質(zhì)的乙�；顽牾；揎�，我們對在腸道菌群重塑小鼠海馬組織中鑒定出的所有差異乙酰化和琥珀�；揎椀鞍踪|(zhì)分別進(jìn)行了亞細(xì)胞定位預(yù)測分析。正如預(yù)想的那樣，Kac修蛋白富集于細(xì)胞核內(nèi)。同時(shí)，36%的胞質(zhì)Kac修飾蛋白部分或僅局限于線粒體（見圖4A）。這一結(jié)果表明，腸道微生物可能通過相關(guān)蛋白質(zhì)的乙�；瘉碚{(diào)節(jié)細(xì)胞核內(nèi)生物過程和線粒體功能。此外，相似數(shù)量的Ksucc修飾蛋白被預(yù)測存在于線粒體中，

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Circulating MicroRNAs as Novel Diagnostic Biomarkers for Very Early-onset（≤40 years） Coronary Artery Disease[J]. DU Ying,YANG Sheng Hua,LI Sha,CUI Chuan Jue,ZHANG Yan,ZHU Cheng Gang,GUO Yuan Lin,WU Na Qiong,GAO Ying,SUN Jing,DONG Qian,LIU Geng,LI Jian Jun.  Biomedical and Environmental Sciences. 2016(08)
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本文編號：3091898