背景及目的:神經(jīng)膠質(zhì)瘤（glioma）是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的第一大腫瘤,是最具侵襲性的原發(fā)性顱內(nèi)腫瘤,發(fā)病率高且致死率位于顱內(nèi)腫瘤榜首,且放化療預(yù)后效果不明顯。近幾年伴隨著分子靶向治療的不斷發(fā)展,在細(xì)胞分子水平治療惡性腫瘤已成為研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。轉(zhuǎn)錄因子特化蛋白1（Specificity protein 1）是Sp家族成員之一,調(diào)控多種基因轉(zhuǎn)錄過程。Sp1基因在許多癌癥中高表達(dá),參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展并與不良預(yù)后有關(guān),是極具潛力的腫瘤早期診斷標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)。然而Sp1在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及調(diào)控方式尚不清楚。因此,本研究旨在通過一系列分子生物學(xué)及細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)檢測(cè)Sp1在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)方式。通過生物信息學(xué)、基因沉默、過表達(dá)、雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)等技術(shù)尋找調(diào)控Sp1表達(dá)的miRNA。探索Sp1參與膠質(zhì)瘤成瘤的分子機(jī)制,為Sp1成為膠質(zhì)瘤的早期診斷分子標(biāo)志物提供證據(jù)。方法:首先,通過分析TCGA、CGGA等公共數(shù)據(jù)集中膠質(zhì)瘤基因表達(dá)譜,探索Sp1在不同級(jí)別腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)情況以及Sp1與膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的關(guān)系。通過熒光定量PCR及Western blot技術(shù)比較Sp1在膠質(zhì)瘤細(xì)胞及HA1800正常膠質(zhì)細(xì)胞中表... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：93 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

技術(shù)路線圖

為了檢測(cè)Sp1基因在腦膠質(zhì)瘤的表達(dá)情況,我們借助GEPIA平臺(tái)對(duì)TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)集的膠質(zhì)瘤基因表達(dá)譜進(jìn)行分析。如圖2.1 A所示,低級(jí)別膠質(zhì)瘤組織LGG(Low-grade glioma,518例)和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤組織GBM(glioblastoma multiforme,153例)中Sp1表達(dá)均高于正常腦組織(207例)。然而,Sp1表達(dá)水平在LGG與HGG之間差異不明顯。為了進(jìn)一步分析Sp1表達(dá)與膠質(zhì)瘤病理級(jí)別的關(guān)系,我們對(duì)CGGA(The Chinese Glioma Genome Atlas,中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜)公共數(shù)據(jù)集CGGA1及CGGA2進(jìn)行分析。將CGGA1數(shù)據(jù)集301例樣本去除無意義數(shù)據(jù)后按照WHO標(biāo)準(zhǔn)分為病理II期(包括A,O,OA)病理III期(包括AA,AO,AOA,)及病理IV期(GBM)。如圖2.1 B所示,Sp1在三個(gè)級(jí)別的膠質(zhì)瘤組織中表達(dá)沒有顯著性差異。雖然CGGA1數(shù)據(jù)集中Sp1的表達(dá)量在WHO IV中表達(dá)量高于WHO II和WHO III級(jí),但WHO II和WHO III之間差別不明顯。以上結(jié)果表明,Sp1在膠質(zhì)瘤組織中高表達(dá),但與膠質(zhì)瘤的病理級(jí)別無明顯相關(guān)性。2.2.2 Sp1 的表達(dá)與膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的相關(guān)性分析

我們以Sp1表達(dá)水平中位數(shù)(Median)為標(biāo)準(zhǔn),首先將低級(jí)別膠質(zhì)瘤患者分為Sp1高表達(dá)組和低表達(dá)組。GEPIA平臺(tái)分析Sp1表達(dá)水平與LGG患者生存期的關(guān)系。如圖2.2 A所示,Sp1低表達(dá)的LGG患者總生存期(Overall Survival,OS)及無疾病生存期(disease-free survival,DFS)較長(zhǎng)。接下來,以Sp1表達(dá)水平中位數(shù)(Median)為標(biāo)準(zhǔn)將膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者也分為Sp1高表達(dá)組和低表達(dá)組,但Sp1表達(dá)量與GBM患者的生存期無明顯相關(guān)性(圖2.2B)。另外,我們還通過R2基因組分析可視化平臺(tái)(http://r2.amc.nl),依據(jù)IDH R132突變情況將French膠質(zhì)瘤數(shù)據(jù)集中的患者分為IDH R132野生型(IDH R132 wildtype)及IDH R132基因突變型(IDH R132 mutant)(圖2.2 C)。結(jié)果顯示,兩類膠質(zhì)瘤患者中Sp1高表達(dá)的患者的預(yù)后較差。以上結(jié)果暗示,Sp1基因表達(dá)與膠質(zhì)瘤患者的預(yù)后息息相關(guān),Sp1低表達(dá)患者預(yù)后較好,特別是在低級(jí)別膠質(zhì)瘤患者中更為顯著。2.2.3 Sp1 在膠質(zhì)瘤細(xì)胞及正常膠質(zhì)細(xì)胞中表達(dá)差異分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]MicroRNA在腦膠質(zhì)瘤臨床應(yīng)用中的研究進(jìn)展[J]. 朱如哲.  中國處方藥. 2018(08)
[2]神經(jīng)膠質(zhì)瘤中microRNA的研究進(jìn)展[J]. 沙力江·艾爾肯,蔡玲.  系統(tǒng)醫(yī)學(xué). 2018(08)
[3]膠質(zhì)瘤相關(guān)分子標(biāo)記物的研究進(jìn)展[J]. 楊孝燕,王春紅,胡昌辰,成睿,吉宏明.  中國藥物與臨床. 2018(03)
[4]Sp1和miR-92b在口腔癌組織中的表達(dá)及其意義[J]. 侯振偉,游珺,張風(fēng)華.  解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2018(02)
[5]PI3K/Akt信號(hào)通路及SP1在VEGF上調(diào)胃癌細(xì)胞MRP1中的作用[J]. 李娟,許文林,冷加燕.  世界華人消化雜志. 2014(36)
[6]Sp3對(duì)β-catenin基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用初探[J]. 黃蘭姍,黃子凌,馮振博,陳罡,危丹明.  中國病理生理雜志. 2014(11)
[7]ERK1/2-Sp1信號(hào)通路對(duì)肺癌細(xì)胞VEGF的調(diào)控作用[J]. 梁璇,丁新民,霍艷英,潘興斌,隋建麗,白貝,徐勤枝,周平坤.  癌變.畸變.突變. 2007(04)

博士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA-LINC01116在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及其腫瘤生物學(xué)功能與機(jī)制的研究[D]. 葉晶亮.第二軍醫(yī)大學(xué) 2017



本文編號(hào)：2991941