本文選題：缺血性中風(fēng) + 基因組富集　； 參考：《廣州中醫(yī)藥大學(xué)》2017年博士論文

【摘要】：目的:本研究旨在通過基因富集技術(shù)篩選出影響缺血性中風(fēng)病的重要通路-Toll樣受體信號通路(Toll-like receptor signaling pathway)并對其2個關(guān)鍵基因:腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子 6(Tumor necrosis factor receptor-associated factor6,TRAF6)基因及Toll樣受體4(Toll-like receptors4,TLR4)單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)與缺血性中風(fēng)(Ischemic Stroke,IS)及其中醫(yī)證候的相關(guān)性進行分析,此外,我們還對其關(guān)鍵基因多態(tài)性與血清血脂水平的相關(guān)性進行了分析,我們希望本研究可以為進一步研究缺血性中風(fēng)的遺傳機制奠定一定的基礎(chǔ),以及為揭示缺血性中風(fēng)病中醫(yī)辨證分型的科學(xué)內(nèi)涵提供一定的遺傳學(xué)依據(jù)。方法:本研究運用遺傳流行病學(xué)的方法采用基因組富集(Gene set enrichment analysis,GSEA)等生物信息學(xué)方法篩選出符合納入排除標(biāo)準(zhǔn)的基因芯片表達譜數(shù)據(jù),并初步篩選出在轉(zhuǎn)錄水平上影響缺血性中風(fēng)的通路及基因;繼而采用病例對照研究設(shè)計,共納入缺血性中風(fēng)病患者184例,對照組116例。運用Sanger基因分型技術(shù)對研究對象的外周靜脈血的TRTF6基因rs5030411、rs5030416功能SNPs、以及TLR4基因的rs10759932、rs11536889和rs1927914多態(tài)性進行基因分型檢測。使用SPSS17.0 for windows、STATA(STATA College Station,Texas,USA)軟件進行統(tǒng)計分析。結(jié)果:1.經(jīng)過篩查后,本研究在GEO數(shù)據(jù)庫中篩選到了 1套芯片數(shù)據(jù),即GSE16561,對此套數(shù)據(jù)直接進行基因組富集分析,得到了影響缺血性中風(fēng)的關(guān)鍵通路Toll樣受體信號通路及該通路上的關(guān)鍵差異基因(TLR4、TR4F6)。2.哈溫平衡(Hardy-WeinbergEquilibrium,HWE)檢驗:所研究的5個基因位點在對照組中的基因型分布均符合HWE平衡定律(P0.050)。3.TR F6基因單位點多態(tài)性與缺血性中風(fēng)易感性的分析結(jié)果(1)TRTF6基因的rs5030411和rs5030416多態(tài)性與缺血性中風(fēng)易感性的不存在關(guān)聯(lián),差異無統(tǒng)計學(xué)意義(均為P0.050)。(2)TF6基因的rs5030411和rs5030416多態(tài)性與男性、女性缺血性中風(fēng)易感性的不存在關(guān)聯(lián),差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均為P0.050)。4.TLR4基因單位點多態(tài)性與缺血性中風(fēng)易感性的分析結(jié)果(1)對rs10759932的研究,我們發(fā)現(xiàn)其3種遺傳模型與缺血性中風(fēng)易感性相關(guān):其中,在雜合子遺傳模型(Model 2:OR=0.095,95%CI:0.022-0.414,P=0.002)和純合子模型(Model 2:OR=0.130,95%CI:0.029-0.581,P=0.008)其多態(tài)性與性缺血性中風(fēng)的易感性相關(guān);在隱性遺傳模型中,rs10759932多態(tài)性與性缺血性中風(fēng)的易感性相關(guān),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(Model 2:OR=9.120,95%CI:2.224-37.396,P=0.002)。(2)對rs1927914分析,結(jié)果提示:純合子遺傳模型,我們發(fā)現(xiàn)rs1927914多態(tài)性與缺血性中風(fēng)易感性相關(guān)(Model 2:OR=0.226,95%CI:0.067-0.764,P=0.017);而隱性遺傳模型,我們發(fā)現(xiàn)rs1927914與缺血性中風(fēng)易感性相關(guān)(Model 1:OR=2.246,95%CI:1.214-4.158,P=0.010,Model 2:OR=3.522,95%CI:1.128-10.996,P=0.030)。(3)TLR4基因rs1 1536889多態(tài)性與缺血性中風(fēng)易感性的不存在關(guān)聯(lián),差異無統(tǒng)計學(xué)意義(均為P0.050)。(4)在女性分層的研究中,結(jié)果示:TLR4基因rs10759932多態(tài)性與女性缺血性中風(fēng)的易感性相關(guān)。雜合子模型:(Model 2:OR=0.024,95%CI:0.002-0.364,P=0.007);純合子遺傳模型結(jié)果為(Model 2:OR=0.014,95%CI:0.001-0.234,P=0.003);此外,隱性遺傳模型中,在經(jīng)過多因素調(diào)整的的Model 2中,結(jié)果示rs10759932多態(tài)性與女性缺血性中風(fēng)的易感性相關(guān)(OR=52.29,95%CI:3.753-728.48,P=0.003)。(5)在女性分層的研究中,結(jié)果示:TLR4基因rs1927914多態(tài)性與女性缺血性中風(fēng)的易感性相關(guān):雜合子遺傳模型(Model 2:OR=0.070,95%CI:0.006-0.865,P=0.038);純合子遺傳模型(Model 2:OR=0.065,95%CI:0.007-0.630,P=0.018);此外,在隱性遺傳模型的中,我們發(fā)現(xiàn)其多態(tài)性與缺血性中風(fēng)易感性相關(guān):(OR=15.078,95%CI:1.621-140.25,P=0.017)。(6)在男性的分層分析中,結(jié)果示:在經(jīng)過多因素校正的顯性遺傳模型的Model 2,TLR4基因rs1927914多態(tài)性與男性缺血性中風(fēng)的易感性相關(guān)(OR:0.147,95%CI:0.023-0.952,P=0.044)。5.Toll樣信號通路關(guān)鍵基因位點多態(tài)性與缺血性中風(fēng)不同中醫(yī)證候的分析結(jié)果(1)風(fēng)證:在對缺血性中風(fēng)風(fēng)證及非風(fēng)證的研究中,我們的研究結(jié)果表明:TRAF6基因rs5030411、rs5030416 多態(tài)性,以及 TLR4基因 rs10759932、rs11536889 和rs1927914多態(tài)性與缺血性中風(fēng)痰證易感性不存在關(guān)聯(lián),差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.050)。(2)痰證:在對痰證及非痰證缺血性中風(fēng)患者的分析中,研究結(jié)果表明TRAF6、TLR4基因所候選的5個基因位點多態(tài)性均與缺血性中風(fēng)痰證易感性不存在關(guān)聯(lián),差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.050)。(3)血瘀證:在對血瘀證及非血瘀證缺血性中風(fēng)患者的分析中,研究結(jié)果表明TRAF6基因 rs5030411、rs5030416 多態(tài)性,以及TLR4基因 rs10759932、rs11536889多態(tài)性與缺血性中風(fēng)痰證易感性的不存在關(guān)聯(lián),差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.050)。而在對TLR4財基因rs1927914多態(tài)性的研究中,我們發(fā)現(xiàn)其顯性模型在校正性別、年齡的Model 1中,其與缺血性中風(fēng)痰證易感性有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=2.182,95%CI:1.026-4.639,P=0.043),但是在多因素校正的Model 2,這一統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)則未被重復(fù)。(4)氣虛證:在對氣虛與非氣虛證缺血性中風(fēng)患者的研究中,我們的研究結(jié)果表明:TRAF6、TLR4基因多態(tài)性與缺血性中風(fēng)氣虛證易感性的不存在關(guān)聯(lián),差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.050)。6.TRAF6、TLR4基因位點多態(tài)性與缺血性中風(fēng)患者血脂水平的分析結(jié)果研究發(fā)現(xiàn)TLR4基因rs11536889多態(tài)性均與缺血性中風(fēng)患者血清LDL水平存在關(guān)聯(lián),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(Padj2=0.046)。結(jié)論:(1)Toll樣受體信號通路可能是影響缺血性中風(fēng)的關(guān)鍵通路。(2)TLR4基因rs10759932多態(tài)性可能與漢族人群缺血性中風(fēng)有關(guān),其A1A2和A2A2基因型可能是漢族人群缺血性中風(fēng)的保護因素,可能會降低漢族人群、特別是漢族女性人群缺血性中風(fēng)易感性的風(fēng)險。(3)TLR4基因rs1927914多態(tài)性可能與漢族人群缺血性中風(fēng)有關(guān),其A1A2和A2A2基因型可能是漢族人群缺血性中風(fēng)的保護因素,可能會降低漢族人群、特別是漢族女性人群缺血性中風(fēng)易感性的風(fēng)險;此結(jié)果在漢族男性人群同樣可以得到驗證。(4)TRAF6、TLR4基因rs5030411和rs5030416多態(tài)性可能與缺血性中風(fēng)風(fēng)證、痰證、氣虛證、血瘀證易感性風(fēng)險無關(guān)。(5)TLR4基因rs10759932、rs11536889以及rs1927914多態(tài)性可能與缺血性中風(fēng)風(fēng)證、痰證、氣虛證、血瘀證易感性風(fēng)險無關(guān)。(6)TLR4基因rs11536889多態(tài)性可能與缺血性中風(fēng)患者血清低密度脂蛋白代謝相關(guān)。
[Abstract]:Objective : To study the association of Toll - like receptor signaling pathway in ischemic stroke and to identify the association between the two key genes : tumor necrosis factor receptor - associated factor6 ( TRAF6 ) and Toll - like receptor 4 ( TLR ) 4 ( Toll - like receptors4 ) . We found that rs1927914 polymorphism is associated with susceptibility to ischemic stroke ( Model 2 : OR = 9.120 , 95 % CI : 2.224 - 37.396 , P = 0.002 ) . The polymorphism of rs1927914 is related to the susceptibility to ischemic stroke ( Model 2 : OR = 2.246 , 95 % CI : 1.214 - 4.158 , P = 0.010 , Model 2 : OR = 3.522 , 95 % CI : 1.128 - 10.996 , P = 0.030 ) . Results showed that rs10759932 polymorphism was associated with susceptibility to ischemic stroke in female ( OR = 52.29 , 95 % CI : 0.007 - 0.630 , P = 0 . 018 ) . In addition , in the recessive genetic model , we found that the polymorphism was associated with susceptibility to ischemic stroke : ( OR = 15.078 , 95 % CI : 1.621 - 140.25 , P = 0 . 017 ) . The results showed that the polymorphism of TRAF6 gene rs5030411 , rs5030416 and rs10759932 , rs11536889 and rs1927914 were not correlated with the susceptibility to ischemic stroke phlegm syndrome . Conclusion : ( 1 ) Toll - like receptor signaling pathway may be related to ischemic stroke in Han population .
【學(xué)位授予單位】：廣州中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R277.7

【參考文獻】

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本文編號：2029368