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風(fēng)濕性心臟病慢性房顫患者的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2018-01-02 21:13

  本文關(guān)鍵詞:風(fēng)濕性心臟病慢性房顫患者的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究 出處:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2017年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


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【摘要】:目的:心房顫動(dòng)(atrial fibrillation)簡(jiǎn)稱房顫,是臨床常見的快速性心律失常。本研究通過對(duì)風(fēng)濕性心臟病慢性房顫及竇性心律患者進(jìn)行血漿蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究,從蛋白質(zhì)組和代謝組水平揭示心房顫動(dòng)時(shí)的細(xì)胞生物學(xué)改變,深入闡明房顫?rùn)C(jī)理,為發(fā)現(xiàn)更安全有效的房顫防治方法奠定基礎(chǔ)。方法:選取2013年1月-2016年12月就診于天津泰達(dá)國(guó)際心血管病醫(yī)院并診斷為風(fēng)濕性心臟病、進(jìn)行心臟瓣膜置換手術(shù)的患者100例(慢性房顫患者70例,竇性心律患者30例)納入研究。手術(shù)前一日采集患者外周靜脈血2ml,離心后取上層血漿-80℃凍存?zhèn)溆谩_x取慢性房顫和竇性心律(sinus rhythm,SR)患者各12例進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)定,采用同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技術(shù)標(biāo)記樣本后,利用質(zhì)譜(mass spectrometry,MS)技術(shù)對(duì)樣本中的肽段進(jìn)行識(shí)別,將串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫中的理論質(zhì)譜數(shù)據(jù)匹配分析后,得到蛋白質(zhì)的鑒定結(jié)果。以蛋白質(zhì)的差異變化倍數(shù)(fold change,FC)為1.2倍且p-value =0.05為標(biāo)準(zhǔn)篩選差異蛋白。對(duì)差異蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,包括GO富集分析、KEGG pathway分析和蛋白互作(PPI)分析。選取差異蛋白中的10種進(jìn)行酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)驗(yàn)證。利用氣相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(gas chromatography-mass spectrometer,GC-MS)對(duì) 30 例慢性房顫患者和26例竇性心律患者的血漿進(jìn)行代謝組學(xué)研究分析。采用多維分析和單維分析相結(jié)合的辦法篩選組間差異代謝物,并對(duì)差異代謝物進(jìn)行KEGG pathway分析。在血漿蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究的基礎(chǔ)上,結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,利用生物信息學(xué)工具進(jìn)行整合組學(xué)分析。結(jié)果:iTRAQ測(cè)定共發(fā)現(xiàn)了 27344個(gè)Unique肽段,鑒別出447種非冗余蛋白質(zhì),以FC變化為1.2倍且p-value=0.05為條件篩選出57種差異蛋白,其中33種蛋白質(zhì)表達(dá)上調(diào),24種蛋白質(zhì)表達(dá)下調(diào)。KEGG pathway分析發(fā)現(xiàn)過氧化物酶體增殖劑激活受體α通路、腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)及凝血和補(bǔ)體系統(tǒng)等多個(gè)通路在房顫的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。選取載脂蛋白A1(apolipoprotein A1)、載脂蛋白 A2(apolipoproteinA2)、LIM 結(jié)構(gòu)域蛋白 7(LIMdomainonly protein 7)、凝血酶原片段 1+2(prothrombin fragment 1+2)、玻連蛋白(vitronectin)、血管緊張素原(angiotensinogen)、ficolin-3、血清淀粉樣蛋白P(serum amyloid P-component)、巨噬細(xì)胞集落刺激因子受體1(macrophage colony-stimulating factor 1 receptor)、嘌呤核苷磷酸化酶(purine nucleoside phosphorylase)等 10 種蛋白質(zhì)進(jìn)行 ELISA 檢測(cè),其中載脂蛋白A1(房顫組為499.5 ± 59.79ug/ml,竇性心律組為725.8 ± 83.75ug/ml)、LIM結(jié)構(gòu)域蛋白7(房顫組為22.31±1.50pg/ml,竇性心律組為16.99±1.88pg/ml)、巨噬細(xì)胞集落刺激因子受體1(房顫組為37.76 ±2.65ng/ml,竇性心律組為66.30 ± 10.82ng/l)、玻連蛋白(房顫組為53.28 ± 7.20ug/ml,竇性心律組為84.89 ± 15.87ug/ml)、凝血酶原片段F1+2(房顫組為0.97±0.06nmol/ml,竇性心律組為0.76±0.05 nmol/ml)和血管緊張素原(房顫組為208.3 ± 18.29pg/ml,竇性心律組為294.1 ± 36.84pg/ml)在房顫組和竇性心律組差異表達(dá)。采用GC-MS代謝組學(xué)技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)了 322種代謝產(chǎn)物,以O(shè)PLS-DA模型VIP1,且p值0.05為標(biāo)準(zhǔn)篩選出差異代謝物55種,其中表達(dá)上調(diào)的差異代謝物有38種,表達(dá)下調(diào)的差異代謝物有17種。對(duì)差異代謝物進(jìn)行KEGG pathway分析,發(fā)現(xiàn)半乳糖代謝、不飽和脂肪酸合成、亞油酸代謝、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)子和淀粉與蔗糖代謝等代謝通路與慢性房顫有關(guān)。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn)風(fēng)濕性心臟病慢性房顫患者與竇性心律患者的血漿中存在差異表達(dá)的蛋白質(zhì)和代謝產(chǎn)物,這些差異蛋白和差異代謝物及其參與的過氧化物酶體增殖劑激活受體α通路、腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)、凝血和補(bǔ)體系統(tǒng)、半乳糖代謝、不飽和脂肪酸合成、亞油酸代謝、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)子和淀粉與蔗糖代謝等通路與房顫密切相關(guān)。另外,慢性房顫時(shí)心臟出現(xiàn)代謝重構(gòu),心肌對(duì)脂肪酸的利用減少,對(duì)葡萄糖的利用增加,而PPARα通路在心臟的代謝重構(gòu)中發(fā)揮著重要作用。
[Abstract]:Objective : To study the changes of plasma proteomic and metabolic groups in patients with chronic atrial fibrillation and sinus rhythm in patients with chronic atrial fibrillation ( AF ) and sinus rhythm . iTRAQ嫻嬪畾鍏卞彂鐜頒簡(jiǎn) 27344涓猆nique鑲芥,閴村埆鍑,

本文編號(hào):1370928

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