本文關(guān)鍵詞：瘢痕疙瘩中l(wèi)ncRNA表達(dá)譜及基因組甲基化異常的初探

  更多相關(guān)文章： 瘢痕疙瘩 長(zhǎng)鏈非編碼RNA DNA甲基化調(diào)控

【摘要】：背景:瘢痕疙瘩是人類特有的皮膚纖維增生性良性腫瘤。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)對(duì)編碼基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控和DNA甲基化調(diào)控的表觀遺傳學(xué)基因調(diào)控,廣泛參與各種生物學(xué)過程,在多種疾病尤其是腫瘤發(fā)病中發(fā)揮重要作用。研究表明,瘢痕疙瘩中存在lncRNA和DNA甲基化調(diào)控,但具體機(jī)制尚不清楚。目的:初步探討lncRNA在瘢痕疙瘩中的表達(dá)以及其在瘢痕疙瘩發(fā)病機(jī)制中的潛在生物學(xué)作用。初步分析DNA啟動(dòng)子區(qū)甲基化調(diào)控在瘢痕疙瘩發(fā)病中所起的作用。方法:1.對(duì)5例瘢痕疙瘩組織(實(shí)驗(yàn)組)及瘤旁正常組織(對(duì)照組),進(jìn)行l(wèi)ncRNA/mRNA芯片、lncRNA子類分析、信號(hào)通路分析及編碼-非編碼RNA共表達(dá)分析,篩選實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中差異表達(dá)的lncRNA/mRNA,分析差異表達(dá)的lncRNA與mRNA之間相關(guān)作用關(guān)系。2.從瘢痕疙瘩組織、包皮組織中分別分離并培養(yǎng)原代瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞(實(shí)驗(yàn)組)、正常成纖維細(xì)胞(對(duì)照組),3例實(shí)驗(yàn)組和3例對(duì)照組通過lncRNA/mRNA芯片、信號(hào)通路分析方法,篩選出組織和細(xì)胞中共同差異表達(dá)的lncRNA/mRNA,以及目的lncRNA,并在組織樣本中采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證。3.對(duì)3例瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞和3例正常成纖維細(xì)胞進(jìn)行甲基化DNA免疫沉淀-測(cè)序、啟動(dòng)子區(qū)差異甲基化表達(dá)分析,找出組織和細(xì)胞中共同差異表達(dá)的mRNA與啟動(dòng)子區(qū)差異甲基化的關(guān)系,篩選出目的mRNA并在組織和細(xì)胞樣本中測(cè)定RNA相對(duì)表達(dá)水平,在擴(kuò)大的組織樣本中驗(yàn)證。結(jié)果:1.瘢痕疙瘩組織與正常組織相比,有3680個(gè)差異表達(dá)的lncRNAs和5448個(gè)差異表達(dá)的mRNAs。其中上調(diào)和下調(diào)的lncRNA分別為2238個(gè)和1442個(gè);上調(diào)和下調(diào)的mRNA分別為2526個(gè)和2922個(gè)(差異倍數(shù)≥2且p值0.05)。2.上調(diào)的mRNAs主要參與細(xì)胞外骨架形成和細(xì)胞外基質(zhì)合成,參與的信號(hào)通路最活躍的是細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用通路,其余包括粘附、Wnt及PI3K/Akt通路等。下調(diào)的mRNAs主要參與物質(zhì)代謝過程和氧化還原過程,參與的信號(hào)通路最活躍的為纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的降解通路,其余還有碳代謝通路等。3.lncRNAs子類分析中,72.5%geniclncRNAs與其相關(guān)的mRNAs調(diào)節(jié)方向一致,27.5%genic lncNRAs與其相關(guān)的mRNAs調(diào)節(jié)方向相反。393個(gè)enhancer-like lncRNAs和864個(gè)lincRNAs與其鄰近的差異性表達(dá)的基因有調(diào)節(jié)變化。4.上調(diào)最活躍的通路中,5 個(gè) mRNAs(COL5A2、COL6A2、ITGA1、ITGB1和 THBS3)有相關(guān)的 genic lncRNAs(ENST00000419029、uc010gqe.2、uc003jox.1、ENST00000414157 和 ENST00000447623)。下調(diào)最活躍信號(hào)通路中,僅ACAT2有相關(guān)的geniclncRNA:NR_037166。Wnt信號(hào)通路中,有 8 個(gè) mRNAs 存在相關(guān)的 genic lncRNAs,1 個(gè) mRNAs-PRKACB 有enhancer-like lncRNA-ENST00000439186,3 個(gè) mRNAs(CTBP1、FZD1 和PRKACB)有 lincRNAs(TCONS_00007951、TCONS_00013884、TCONS_00014352 和 TCONS_00001546)。PI3K/Akt 信號(hào)通路中,9 個(gè)mRNAs 有相關(guān)的 genic lncRNAs,2 個(gè) mRNAs(COL5A1 和 THBS2)有enhancer-like lncRNAs(ENST00000423455、ENST00000439730 和ENST00000413324),5 個(gè) mRNAs 存在 lincRNAs。5.mRNAs-lncRNAs 共表達(dá)分析中,ITGB1、COL5A2 是與 lncRNAs 交聯(lián)最多的基因。一個(gè)lncRNA可與多個(gè)mRNAs相互作用,一個(gè)mRNA可與多個(gè)lncRNAs相互作用。6.與正常成纖維細(xì)胞相比,瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞中有1231個(gè)差異表達(dá)的lncRNAs和1744個(gè)差異表達(dá)的mRNAs。其中上調(diào)和下調(diào)的lncRNAs分別為738個(gè)和493個(gè),上調(diào)和下調(diào)的mRNAs分別為1165個(gè)和579個(gè)(差異倍數(shù)≥2且p值0.05)。7.瘢痕疙瘩組織和瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞中有71-個(gè)共同差異表達(dá)的lncRNAs,271個(gè)共同差異表達(dá)的mRNAs。其中59個(gè)為上調(diào)的lncRNAs、12個(gè)為下調(diào)的lncRNAs,上調(diào)和下調(diào)的mRNAs分別為183個(gè)和88個(gè)。8.lncRNA(uc003jox.1、ENST00000414157 和 ENST00000439703)表達(dá)上調(diào)并且與PI3K/Akt信號(hào)通路密切相關(guān)。在瘢痕疙瘩組織中l(wèi)ncRNA(uc003jox.1和ENST00000439703)表達(dá)較正常組織高。9.瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞中存在758個(gè)與mRNA相關(guān)的啟動(dòng)子區(qū)差異甲基化,其中380個(gè)為與mRNA相關(guān)的啟動(dòng)子區(qū)差異高甲基化,378個(gè)為與mRNA相關(guān)的啟動(dòng)子區(qū)差異低甲基化。10.在組織和細(xì)胞中共同相對(duì)高表達(dá),且啟動(dòng)子區(qū)低甲基化的mRNAs有STEAP1、SLC38A5、CRISPLD2和IL32。在組織和細(xì)胞中共同相對(duì)低表達(dá),且啟動(dòng)子區(qū)高甲基化的mRNA為ALX1。11.在細(xì)胞中,目的mRNAs(STEAP1、SLC38A5和IL32)實(shí)驗(yàn)組表達(dá)高于對(duì)照。在組織中,目的mRNAs(STEAP1、SLC38A5和CRISPLD2)實(shí)驗(yàn)組表達(dá)高于對(duì)照。結(jié)論:1.多種lncRNAs和mRNAs的相互作用參與瘢痕疙瘩的發(fā)生和發(fā)展。2.PI3K/Akt信號(hào)通路激活,且與之相關(guān)的lncRNAs(uc003jox.1和ENST00000439703)在瘢痕疙瘩中表達(dá)增高。3.高表達(dá)的mRNAs(STEAP1、SLC38A5和CRISPLD2)啟動(dòng)子區(qū)低甲基化調(diào)控在瘢痕疙瘩發(fā)病中發(fā)揮作用。
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R739.5

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1 馬潞娜,張紅,張淑梅,金泉;4種不同治療方法對(duì)瘢痕疙瘩的療效比較[J];臨床皮膚科雜志;2000年06期

2 劉明義,孫喬莉;雙側(cè)耳垂巨大瘢痕疙瘩12例[J];山東醫(yī)藥;2000年22期

3 劉美蓮,陳煌基,魏明,張克勤;不同放射方法治療155例瘢痕疙瘩術(shù)后療效分析[J];廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2000年01期

4 王少華,呂世軍,王燕華,吳洪娟,黃文波,呂建萍,郭愛華;細(xì)胞生長(zhǎng)因子與瘢痕疙瘩形成的關(guān)系[J];濰坊醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2000年03期

5 景紅霞,李秀研,景黎明,葉寧;康尼克通治療瘢痕疙瘩效果觀察[J];牡丹江醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2000年02期

6 劉文閣,李素娟,蔡玉琴;綜合療法治療瘢痕疙瘩的療效觀察[J];中國美容醫(yī)學(xué);2000年01期

7 鄭學(xué)毅,涂平,張建中,馬圣清;血小板衍生生長(zhǎng)因子在瘢痕疙瘩的表達(dá)[J];中華醫(yī)學(xué)美容雜志;2000年02期

8 許鳳芝,馬奇,林艷芳,魏?jiǎn)⒋?117例胸前瘢痕疙瘩的治療[J];臨床皮膚科雜志;2001年05期

9 林尚澤,張楠,梁亞;耳垂瘢痕疙瘩的綜合治療[J];中華耳鼻咽喉科雜志;2001年02期

10 賀翠云,陳冬軍,趙巧云;冷凍治療耳垂瘢痕疙瘩86例療效觀察[J];包頭醫(yī)學(xué);2001年03期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 胡傳揆;方大定;趙炳南;葉干連;馬海德;;用中藥治療瘢痕疙瘩的初步結(jié)果[A];中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)皮膚科分會(huì)第六次學(xué)術(shù)年會(huì)、趙炳南學(xué)術(shù)思想研討會(huì)、全國皮膚科中醫(yī)外治高級(jí)研修班論文集[C];2009年

2 張國軍;金小峰;劉軍;;瘢痕疙瘩手術(shù)聯(lián)合放射治療的觀察[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)放射腫瘤治療學(xué)分會(huì)六屆二次暨中國抗癌協(xié)會(huì)腫瘤放療專業(yè)委員會(huì)二屆二次學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2009年

3 李惠斌;陳芳;;手術(shù)配合術(shù)后早期放療治療瘢痕疙瘩的療效分析[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)燒傷外科學(xué)分會(huì)2009年學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2009年

4 蔡景龍;;瘢痕疙瘩的臨床特點(diǎn)及分類探討[A];第七屆中國醫(yī)師協(xié)會(huì)美容與整形醫(yī)師大會(huì)論文集[C];2010年

5 李楊;郭樹忠;張曦;盧丙侖;舒茂國;;難治性瘢痕疙瘩聯(lián)合治療一例報(bào)道[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)整形外科學(xué)分會(huì)第十一次全國會(huì)議、中國人民解放軍整形外科學(xué)專業(yè)委員會(huì)學(xué)術(shù)交流會(huì)、中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)美容專業(yè)委員會(huì)全國會(huì)議論文集[C];2011年

6 王友彬;梁偉中;孫顯松;王曉軍;;“X”切口瘢痕瓣形成在瘢痕疙瘩切除后耳廓形態(tài)修復(fù)中的應(yīng)用[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)整形外科學(xué)分會(huì)第十一次全國會(huì)議、中國人民解放軍整形外科學(xué)專業(yè)委員會(huì)學(xué)術(shù)交流會(huì)、中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)美容專業(yè)委員會(huì)全國會(huì)議論文集[C];2011年

7 李楊;郭樹忠;張曦;盧丙侖;舒茂國;;難治性瘢痕疙瘩聯(lián)合治療一例報(bào)道[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)整形外科學(xué)分會(huì)第十一次全國會(huì)議、中國人民解放軍整形外科學(xué)專業(yè)委員會(huì)學(xué)術(shù)交流會(huì)、中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)美容專業(yè)委員會(huì)全國會(huì)議論文集[C];2011年

8 陳曉棟;張國成;葉順章;;血小板衍化生長(zhǎng)因子受體蛋白在瘢痕疙瘩中的表達(dá)[A];2003中國中西醫(yī)結(jié)合皮膚性病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2003年

9 楊崇格;馮麗娟;;30例瘢痕疙瘩綜合治療分析[A];中國康復(fù)醫(yī)學(xué)會(huì)修復(fù)重建外科專業(yè)委員會(huì)第十四次全國學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2004年

10 姜春秋;;耳廓瘢痕疙瘩的相關(guān)因素及診療探討(附非洲萊索托88例分析)[A];第十一次湖北省整形外科學(xué)術(shù)會(huì)議第四次湖北省醫(yī)學(xué)美容學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2004年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 文伍;瘢痕疙瘩該如何治療[N];大眾衛(wèi)生報(bào);2004年

2 衣曉峰;治療瘢痕疙瘩 避免步入誤區(qū)[N];健康報(bào);2004年

3 皮膚科 黎勝強(qiáng);瘢痕疙瘩的防治[N];家庭醫(yī)生報(bào);2003年

4 特約記者 衣曉峰;治療瘢痕疙瘩 避免步入誤區(qū)[N];家庭醫(yī)生報(bào);2004年

5 水天;同息通治療瘢痕疙瘩的療效觀察[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2005年

6 中國醫(yī)科院整形外科醫(yī)院 王連召;瘢痕疙瘩不能一切了之[N];健康報(bào);2008年

7 武警總醫(yī)院 白曉東 陶海;瘢痕疙瘩綜合治療不復(fù)發(fā)[N];衛(wèi)生與生活報(bào);2008年

8 胡獻(xiàn)國（副主任醫(yī)師）;巧除瘢痕疙瘩[N];上海中醫(yī)藥報(bào);2003年

9 趙晴晴;瘢痕疙瘩咋治療？[N];健康時(shí)報(bào);2004年

10 河北 主治醫(yī)師 胡松;祛除瘢痕疙瘩外治方[N];家庭醫(yī)生報(bào);2005年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 滕國棟;全基因組重測(cè)序技術(shù)分析漢族瘢痕疙瘩家系基因多態(tài)性及初步研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2014年

2 劉清亮;瘢痕疙瘩及其周圍皮膚血流灌注的差異及其相關(guān)因素的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2016年

3 趙竟伊;同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量（iTRAQ）蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在瘢痕疙瘩特異性標(biāo)志物研究中的應(yīng)用[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2017年

4 苑春雨;瘢痕疙瘩中l(wèi)ncRNA表達(dá)譜及基因組甲基化異常的初探[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2017年

5 毛運(yùn)春;前胸部瘢痕疙瘩微循環(huán)與膠原表達(dá)研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

6 羅勇;瘢痕疙瘩差異表達(dá)基因的篩選及標(biāo)志蛋白的分析[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2005年

7 陳曉棟;纖維化相關(guān)細(xì)胞因子受體在瘢痕疙瘩中表達(dá)的研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2002年

8 朱飛;中國漢族人瘢痕疙瘩易感基因相關(guān)性研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2013年

9 夏煒;瘢痕疙瘩與正常皮膚成纖維細(xì)胞中結(jié)締組織生長(zhǎng)因子差異表達(dá)及調(diào)控機(jī)制的研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2008年

10 焦虎;瘢痕疙瘩自身免疫疾病特征和多聚嘧啶序列結(jié)合蛋白為治療靶點(diǎn)的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

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1 胡幸蕙;應(yīng)用電子線對(duì)瘢痕疙瘩術(shù)后治療效果的臨床研究—去除剖腹產(chǎn)及隆乳手術(shù)造成之瘢痕疙瘩[D];大連醫(yī)科大學(xué);2008年

2 丁麗;手術(shù)聯(lián)合電子線治療瘢痕疙瘩臨床療效觀察[D];吉林大學(xué);2009年

3 李輝正;瘢痕疙瘩術(shù)后電子線治療70例回顧性研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2011年

4 孟洪君;瘢痕疙瘩術(shù)后電子線治療57例分析[D];大連醫(yī)科大學(xué);2007年

5 郭雷洋;瘢痕疙瘩微淋巴管密度與侵襲性生長(zhǎng)的相關(guān)性研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2012年

6 丁云鵬;兩種瘢痕疙瘩綜合治療方案對(duì)比研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年

7 道日娜;V形離斷式術(shù)式治療耳廓瘢痕疙瘩[D];大連醫(yī)科大學(xué);2013年

8 唐潔;TSG-6與MMP-9在瘢痕疙瘩邊緣部的表達(dá)及意義[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2014年

9 杜光遠(yuǎn);耳瘢痕疙瘩及其臨床研究進(jìn)展[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

10 唐小清;CYLD在瘢痕疙瘩中的表達(dá)及曲古抑菌素A和三羥基異黃酮對(duì)CYLD的影響[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

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本文編號(hào)：1281642