本文關鍵詞：腎癌中MMP-7的表達及生物信息學分析

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【摘要】：研究背景腎細胞癌(Renal cell carcinoma,RCC)是成人腎臟最常見的惡性腫瘤,近年來隨著社會的進步和經(jīng)濟的發(fā)展,生活水平的提高,其發(fā)病率和死亡率呈上升趨勢。目前,雖然在生物治療與手術治療等方面取得了一定的進展,但因腎癌具有發(fā)現(xiàn)晚、進展快、轉移早、預后仍差的特點,嚴重影響患者生活質量。因此,進一步對RCC相關基因的研究對探討腎癌的發(fā)生機制及腎癌的早期診斷、早期治療具有非常重要的意義。研究目的本研究旨在探討基質溶解素(MMP-7)及微血管密度(MVD)在腎癌浸潤轉移中的作用,深入了解腎癌中癌細胞轉移的分子生理機制,初步建立腎癌相關基因的調控網(wǎng)絡模型,為臨床上腎癌的靶向治療提供一定的理論依據(jù)。材料與方法1.收集80例來自鄭州大學附屬腫瘤醫(yī)院泌尿外科2014年3月-2015年10月手術切除,臨床資料完整和經(jīng)病理檢查確診的腎透明細胞癌組織標本。其中男性50例,女性30例,年齡20~76歲。臨床分期標準(TNM)分為:TNM1期24例,TNM2期21例,TNM3期18例,TNM4期7例;按Fuhrman分級,1級20例、2級28例、3級24例、4級4例;采用免疫組織化學S-P法檢測80例腎細胞癌及癌旁正常腎組織中MMP-7和MVD的表達情況。運用SPSS21.0軟件分析兩者的表達與臨床病例特征之間的關系以及兩者之間的相關性。2.以MMP-7蛋白為研究對象,采用生物信息學方法,對其氨基酸組成、跨膜結構、卷曲螺旋、亞細胞定位、信號肽、功能及各級結構進行了分析。3.利用基因本體數(shù)據(jù)庫(GO)和京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫(KEGG)對腎癌相關基因p53、PTEN、MMP-9、KISS-1、MMP-7和VHL等六種基因標志物進行GO功能分析和KEGG信號通路分析,初步建立腎癌調控網(wǎng)絡模型。研究結果1.MMP-7在腎癌組織和癌旁正常組織中的表達率分別為65.00%,25.00%;腎癌組織和癌旁正常組織中MVD均值分別為(147.53±32.72),(53.17±11.87)。MMP-7及MVD在腎癌中的表達與癌旁正常組織中的表達分別比較,差異有統(tǒng)計學意義(P0.05);腎癌組織中MVD和MMP-7的表達均與腎包膜侵襲、病理分級、淋巴結轉移、不同臨床分期及腫瘤直徑密切相關(P0.05);與患者年齡,性別無關(P0.05;無統(tǒng)計學意義);MMP-7陽性者的MVD值明顯高于陰性者,表明MMP-7陽性表達與MVD均呈正相關。2.MMP-7基因共含有1131bp,包含編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩個部分,編碼區(qū)共編碼了一條含有267個氨基酸的肽鏈,該肽鏈主要靠無規(guī)則卷曲和α螺旋,并進一步超螺旋,形成了一個穩(wěn)定的中性親水蛋白。亞細胞定位分析結果顯示,該蛋白存在分泌途徑,且定位于胞外,N端1-17位氨基酸是信號肽剪切位點,成熟肽鏈起始于第18氨基酸,可見該蛋白屬于分泌蛋白。通過功能結構域分析發(fā)現(xiàn)該蛋白含有兩個功能域,分別為PG結合域和ZnMc—MMP結構域,并且發(fā)現(xiàn)該蛋白相互交聯(lián)的蛋白,也是癌細胞增殖轉移相關的蛋白。3.結合GO功能分析和KEGG信號通路分析結果,初步建立了由p53、PTEN、MMP-9、KISS-1、MMP-7、VHL和VEGF七個基因標志物及其他相關基因組成的腎癌初級調控網(wǎng)絡模型。結論MMP-7與血管生成關系密切,聯(lián)合檢測MVD和MMP-7對RCC惡性程度的評估、轉移及其預后具有一定的研究價值;MMP-7蛋白屬于分泌蛋白,與該蛋白相互交聯(lián)的蛋白,也是癌細胞增殖轉移相關的蛋白;初步建立了p53、PTEN、MMP-9、KISS-1、MMP-7、VHL和VEGF基因標志物參與的腎癌調控網(wǎng)絡模型,可作為腎癌靶向治療的潛在靶點。
【學位授予單位】：鄭州大學
【學位級別】：博士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R737.11

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本文編號：1270275