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GWLS發(fā)現(xiàn)新的冠心病易感區(qū)域,系統(tǒng)回顧及與GWAS結(jié)果的對比分析

發(fā)布時間:2017-11-06 08:30

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【摘要】:目的:全基因組連鎖分析(GWLS)篩選新的冠心病遺傳易感區(qū)域,并對冠心病遺傳易感性相關(guān)的研究進(jìn)行系統(tǒng)回顧和對比。方法:本研究包括GeneQuest和GeneQuest Ⅱ兩個獨立的冠心病家系群。GeneQuest包括428個家系,總計1613例,冠心病患者974例,平均發(fā)病年齡44.4±9.7歲,平均家系成員為4.7位,入選者中大多涉及兩代家系成員,91.7%為白種人群,以男性為主,為1152例。GeneQuest Ⅱ包括24個家系,總計458例,100%為白種人,平均每個家系有15.7±9.18位成員,入選者涉及三代及以上的家系成員,其中男性226例,女性232例,發(fā)病年齡不限。采集靜脈血,提取基因組DNA,進(jìn)行基因分型,采用全基因組連鎖分析(GWLS)的方法,對兩個家系群中的入選個體進(jìn)行分析,并將本研究中的研究結(jié)果與既往報道的冠心病遺傳易感基因的GWLS和GWAS的研究結(jié)果進(jìn)行總結(jié),對比和分析。結(jié)果:在GeneQuest家系中,發(fā)現(xiàn)兩個冠心病密切相關(guān)的易感區(qū)域,分別是3p25.1(peak NPL=5.49),3q29 (peak NPL=6.84).在GeneQuest Ⅱ家系中,發(fā)現(xiàn)3q29和7p22.3與冠心病遺傳易感性密切相關(guān)(peak NPL=5.93,5.26); 3q23,5q11.2,7p22.2, and 17q11.2,與冠心病遺傳易感性相關(guān)(NPL=4.08-4.98);另外有11個區(qū)域, 與冠心病遺傳易感性可能相關(guān),分別是3p26.3,5ql3.2,5q15,7q35,9p24.2,9q22.33, 9q34.11,10q24.32,17p12,20q13.32和21q22.3 (NPL=3.18-4.07).對GeneQuest和GeneQuest Ⅱ分別進(jìn)行掃描后發(fā)現(xiàn),3q29和9q22.33在兩個家系中均都與冠心病遺傳易感性相關(guān),3q23,9p24.2,9q34.11與既往GWAS研究中發(fā)現(xiàn)的冠心病相關(guān)位點rs2306374, rs7025417和rs579459只差1.07-2.1 M1o。同時,對既往報道的冠心病遺傳易感性相關(guān)的GWLS和GWAS研究結(jié)果進(jìn)行了系統(tǒng)回顧,對比和分析。結(jié)論:對于GeneQuest家系群研究發(fā)現(xiàn),3p25.1和3q29與冠心病風(fēng)險密切相關(guān),9q22.33,9q34.11,17p12和21q22.3與冠心病發(fā)病可能相關(guān);而對于GeneQuest Ⅱ家系群研究發(fā)現(xiàn),3q29和7p22.3與冠心病的發(fā)病風(fēng)險密切相關(guān),3q23,5q11.2,7p22.2和17q1 1.2與冠心病風(fēng)險有相關(guān)性,而3p26.3,5q13.2,5q15,7q35,9p24.2,9q22.33,10q24.32和20q13.32與冠心病的風(fēng)險可能相關(guān)。
【學(xué)位授予單位】:蘭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R541.4

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本文編號:1148139

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