本文關鍵詞：腫瘤代謝相關基因單核苷酸多態(tài)性與非小細胞肺癌預后相關性研究及其機制

  更多相關文章： 非小細胞肺癌 單核苷酸多態(tài)性 三羧酸循環(huán) 糖代謝 核苷酸合成代謝 預后

【摘要】：據最新流行病學數據顯示,肺癌已經成為最為常見的惡性腫瘤,2012年全球肺癌新發(fā)病例約180萬,占新增癌癥病例總數的13%,已成為男性中發(fā)病率和死亡率最高的癌癥,在女性中發(fā)病率排第三位,死亡率排第二位。肺癌中約80%是非小細胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),由于我國肺癌篩查手段不足,難以做到早期診治,使得75%左右的NSCLC患者發(fā)現時已處中晚期,加上肺癌治療方法不夠規(guī)范和先進,僅有少數患者可通過手術獲益,造成了非小細胞肺癌的5年生存率較低,為此找到有效的分子標志物用于NSCLC患者的早期診治及預后評估,對于提高肺癌患者的總體生存期具有重要意義。NSCLC治療的首選方案和最主要的治療方法是外科手術。為了提高肺癌外科手術的治愈率和患者的生存率,常常需在術前或術后進行輔助化療、放療等治療。晚期NSCLC患者因不能手術或不宜手術,臨床上建議采用放療,放、化療結合綜合治療也是目前局部晚期NSCLC廣泛應用的治療策略。然而,由于腫瘤異質性的特點,采用同一種治療方案的不同患者療效差異顯著,為了解決這個問題,個體化醫(yī)療的概念被提出,但目前臨床中仍缺乏有效的區(qū)分不同患者個體差異的標志物,難以有效的區(qū)分患者個體差異實施個體化治療。目前,利用腫瘤細胞與正常細胞在分子、細胞水平差異,針對細胞受體、基因及調控分子等信號傳導為藥物靶點的分子靶向治療應用已成為當前肺癌臨床應用研究領域的熱點,但可以應用到臨床實踐的標志物仍然很少。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)是基因組中由單個堿基變異或短片段插入缺少而引起人群中DNA序列的多態(tài)性,變異在人群中達到一定頻率(大于1%)。隨著SNP研究的深入,已發(fā)現多個癌基因或抑癌基因中SNP與包括腫瘤在內多種疾病發(fā)生、發(fā)展密切相關,另有SNP也可用于腫瘤化療療效評估。在NSCLC中已發(fā)現部分與患者預后密切相關的SNP,但數目較少,且利用單個位點進行評估時效果有限,為此尋找更多的可用于NSCLC預后評估的SNP位點,制定聯合分析策略,在NSCLC個體化治療中具有重要意義。代謝異常是腫瘤重要特征之一,早在20世紀30年代,生物化學家Otto Warburg就發(fā)現即使在氧供充分的條件下腫瘤細胞依然保持旺盛的糖酵解,消耗大量葡萄糖。陸續(xù)研究發(fā)現腫瘤代謝重編程與腫瘤進展密切相關。目前,腫瘤中已發(fā)現多條代謝通路發(fā)生改變包括糖代謝、核苷酸代謝、線粒體能量代謝等影響生命活動的重要代謝通路。對于這些通路中關鍵基因的研究,尋找腫瘤特異的標志物,有利于NSCLC臨床個體化治療開展。目的:本研究以代謝通路關鍵基因為目標,尋找并證實與NSCLC患者預后密切相關的SNP標志物,為臨床個體化治療提供更多策略。方法:入組病例來自第四軍醫(yī)大學唐都醫(yī)院胸外科,經過剔除后最終入組500例NSCLC患者進行研究。通過SEQUENOM Mass Array基因質譜儀對上述樣本中代謝物轉運基因、三羧酸循環(huán)通路關鍵基因、糖代謝相關基因、核苷酸合成代謝基因共計15個基因43個SNP位點進行基因分型檢測,并結合患者臨床信息,采用Cox比例風險回歸模型、Kaplan-Meier法、Log-rank秩和檢驗、生存樹分析等多種統計方法分析SNP不同基因型與NSCLC患者預后之間的相關性,并利用TCGA公共數據進行基因差異表達和拷貝數分析。結果:研究發(fā)現,在NSCLC中代謝物轉運相關基因CD98 SNP位點rs1059292WV+VV型患者與WW型患者相比,死亡風險顯著升高,并且rs1059292 WV+VV型患者與WW型患者相比,促進腫瘤生長以及淋巴結轉移,該位點突變型可促進CD98基因轉錄增強。另一個基因MCT1 SNP位點rs1049434突變型患者與野性型患者相比死亡、復發(fā)風險均顯著降低,MCT2基因SNP位點rs995343 VV型患者與WW+WV型患者相比死亡風險升高。還發(fā)現三羧酸循環(huán)通路關鍵酶基因SDHC SNP位點rs12064957 WV+VV型NSCLC患者與WW型患者相比,死亡風險顯著降低。IDH2基因SNP位點rs11540478在Additive模型下,突變型患者死亡風險顯著升高。另外,FH基因rs1414493位點WV+VV型患者與WW型患者相比,死亡風險顯著升高。生存樹分析發(fā)現rs1414493位點對患者死亡影響最大,rs4932158對患者復發(fā)影響最大。NSCLC患者中糖代謝相關基因GPI 2個SNP位點rs7248411,rs8191356 VV型患者與WW+WV患者相比死亡、復發(fā)風險均顯著降低。2個SNP位點基因型進行累積效應分析發(fā)現危險基因型對患者死亡、復發(fā)風險隨危險基因型個數增加而具有遞增趨勢。用腫瘤分化級別、TNM分期分層后GPI基因2個SNP位點仍與患者預后密切相關。核苷酸合成代謝基因TYMS SNP位點rs2847153 VV型NSCLC患者與WW+WV患者相比復發(fā)風險顯著升高。rs2847153 WW+WV型患者中,術后化療患者與未化療患者相比死亡、復發(fā)風險均顯著下降。另一個核苷酸代謝基因RRM2B SNP位點rs2290707和rs2853231 VV型患者與WW+WV患者相比復發(fā)風險均顯著降低。結論:①代謝物轉運基因CD98、MCT1、MCT2中rs1059292、rs1049434、rs995343可用于NSCLC患者預后評估;②三羧酸循環(huán)通路基因中rs12064957、rs11540478、rs1414493等位點或可作為NSCLC患者早期預后不良的重要指標;③糖代謝相關基因GPI中rs7248411,rs8191356不同基因型與NSCLC患者預后密切相關;④核苷酸代謝基因TYMS、RRM2B中rs2847153、rs2290707和rs2853231位點可作為NSCLC患者預后評判的指導依據。
【關鍵詞】：非小細胞肺癌 單核苷酸多態(tài)性 三羧酸循環(huán) 糖代謝 核苷酸合成代謝 預后
【學位授予單位】：第四軍醫(yī)大學
【學位級別】：博士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R734.2
【目錄】：

• 縮略語表4-6
• 中文摘要6-9
• ABSTRACT9-13
• 前言13-14
• 文獻回顧14-31
• 正文31-96
• 第一部分 非小細胞肺癌樣本、信息收集及功能性SNP位點選擇與基因分型檢測31-45
• 1. 非小細胞肺癌樣本收集31-33
• 2．樣本臨床信息收集及預后分析33-36
• 3．功能性SNP位點篩選36-38
• 4．基于SEQUENOM Mass ARRAY?飛行質譜儀的功能性SNP分型檢測38-44
• 5. 主要實驗儀器及試劑44-45
• 第二部分 代謝物轉運相關基因CD98，，MCT SNP與非小細胞肺癌預后研究及其機制45-68
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準備45
• 2 方法45-53
• 3 結果53-66
• 4 討論66-68
• 第三部分 三羧酸循環(huán)通路關鍵基因SNP與非小細胞肺癌預后研究及其機制68-78
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準備68
• 2 方法68-70
• 3 結果70-76
• 4 討論76-78
• 第四部分 糖代謝相關基因GLUT1，GPI SNP與非小細胞肺癌預后研究78-87
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準備78
• 2 方法78-79
• 3 結果79-86
• 4 討論86-87
• 第五部分 核苷酸合成代謝基因TYMS，RRM2B SNP與非小細胞肺癌預后研究87-96
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準備87
• 2 方法87-89
• 3 結果89-94
• 4 討論94-96
• 小結96-98
• 參考文獻98-106
• 個人簡歷和研究成果106-108
• 致謝108

本文編號：1029670