花生(Arachis hypogaea L.)是我國(guó)重要的油料作物和經(jīng)濟(jì)作物,是食用植物油和蛋白質(zhì)的重要來(lái)源,在國(guó)民經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展占有重要地位。進(jìn)一步提高花生單產(chǎn)是滿足我國(guó)植物油日益增長(zhǎng)需求的重要途徑。種子大小對(duì)花生產(chǎn)量影響最大,是衡量花生單產(chǎn)的重要指標(biāo),對(duì)提高花生單產(chǎn)至關(guān)重要。本課題前期以中花10號(hào)與ICG 12625進(jìn)行雜交,通過(guò)多年自交,構(gòu)建了一套高世代的重組自交系(RIL)群體,并利用簡(jiǎn)單序列重復(fù)(SSR)標(biāo)記對(duì)該雜交組合的F₂代群體、F₆代群體分別構(gòu)建了遺傳連鎖圖。但是由于部分SSR標(biāo)記無(wú)法準(zhǔn)確地比對(duì)到基因組上,初定位的QTL無(wú)法獲知準(zhǔn)確的物理位置。本研究對(duì)親本及100份RIL家系的未成熟種子進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,構(gòu)建了基于單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記的遺傳連鎖圖,結(jié)合多環(huán)境下的種子長(zhǎng)、種子寬及百仁重的表型變異,進(jìn)行QTL鑒定,獲得穩(wěn)定的種子長(zhǎng)、種子寬及百仁重的主效QTL。此外,獲得的基因表達(dá)量可以作為表型性狀,分析群體基因表達(dá)的變異,結(jié)合遺傳連鎖圖進(jìn)行全基因組的eQTL分析,鑒定eQTL熱點(diǎn)區(qū),并以紫色種皮為例說(shuō)明群體轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)在挖掘...

【文章頁(yè)數(shù)】：95 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 研究問(wèn)題的由來(lái)
    1.2 植物種子大小的調(diào)控途徑研究進(jìn)展
    1.3 花生種子大小相關(guān)性狀QTL定位研究進(jìn)展
        1.3.1 花生遺傳圖譜構(gòu)建的研究進(jìn)展
        1.3.2 花生種子大小相關(guān)性狀QTL定位研究進(jìn)展
    1.4 基因表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)定位研究進(jìn)展
        1.4.1 基因表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)概述
        1.4.2 植物eQTL定位研究進(jìn)展
    1.5 本研究的目的與意義
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料與田間種植
    2.2 種子大小相關(guān)性狀表型的考察
    2.3 未成熟種子轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        2.3.1 樣品RNA的制備
        2.3.2 文庫(kù)的構(gòu)建
        2.3.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)據(jù)的質(zhì)控
    2.4 未成熟種子基因表達(dá)量變異分析
    2.5 花生遺傳圖譜的構(gòu)建
    2.6 種子大小相關(guān)性狀和基因表達(dá)的QTL定位
    2.7 eQTL熱點(diǎn)區(qū)分析
    2.8 聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和表型QTL挖掘花生紫皮候選基因
3 結(jié)果與分析
    3.1 花生RIL群體種子大小相關(guān)性狀的表型變異
        3.1.1 種子大小相關(guān)性狀在不同環(huán)境下的表型變異
        3.1.2 表型超親家系的挖掘
    3.2 花生RIL群體未成熟種子基因表達(dá)量遺傳變異
    3.3 基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的花生遺傳圖譜構(gòu)建
    3.4 花生種子大小相關(guān)性狀QTL定位
        3.4.1 花生種子長(zhǎng)QTL定位
        3.4.2 花生種子寬QTL定位
        3.4.3 花生百仁重QTL定位
        3.4.4 種子長(zhǎng)、種子寬、百仁重QTL共定位
        3.4.5 百仁重條件QTL分析
    3.5 花生基因表達(dá)QTL定位
        3.5.1 花生基因表達(dá)QTL定位
        3.5.2 基因表達(dá)量QTL熱點(diǎn)區(qū)
    3.6 群體轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)在花生紫皮候選基因挖掘上的應(yīng)用
4 討論
    4.1 花生RIL群體未成熟種子基因表達(dá)的遺傳分析
    4.2 花生遺傳圖譜的構(gòu)建
    4.3 花生種子大小相關(guān)性狀的QTL
    4.4 花生RIL群體eQTL定位
    4.5 群體轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)在花生性狀候選基因挖掘上的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
附錄
    附錄1 94個(gè)熱點(diǎn)區(qū)的信息
    附錄2 紫皮主效QTL區(qū)間內(nèi)設(shè)計(jì)的223個(gè)SSR引物在親本之間的擴(kuò)增信息
    附錄3 在讀期間發(fā)表的論文
致謝



本文編號(hào)：3844229