母豬繁殖力是養(yǎng)豬業(yè)最重要的經(jīng)濟參數(shù)之一,直接決定著豬場的盈利水平,然而種群個體之間的繁殖效率存在很大差異,提高母豬繁殖效率是育種者和生產(chǎn)者孜孜以求的目標(biāo)。豬的繁殖調(diào)控是一個十分復(fù)雜的過程,涉及到多個組織器官的調(diào)控。卵巢的主要功能是產(chǎn)生卵子、合成并分泌卵巢激素,卵巢上卵泡的發(fā)生、排卵、黃體形成以及消退呈周期變化,因而作為最重要的生殖器官對調(diào)節(jié)豬的繁殖過程有著不可替代的作用。目前研究已證實,非編碼RNA（lncRNA、circRNA和miRNA）在哺乳動物卵巢發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用。盡管先前的研究報道了豬卵巢組織中miRNA表達譜,但關(guān)于豬卵巢組織非編碼RNAs（ncRNAs）所介導(dǎo)的繁殖調(diào)控的研究還比較匱乏。本研究以黃體期（Luteal phase,L）和卵泡期（Follicular phase,F）的高產(chǎn)仔數(shù)（High,H）和低產(chǎn)仔數(shù)（Low,L）大白母豬為研究對象,基于RNA-seq和small RNA-seq技術(shù),旨在獲取不同時期高產(chǎn)和低產(chǎn)大白豬卵巢組織的全轉(zhuǎn)錄組表達譜數(shù)據(jù),挖掘調(diào)控繁殖力的關(guān)鍵基因,并采用雙熒光素酶報告系統(tǒng)、過表達、RNA干擾、Western Blot等技術(shù)深入... 

【文章來源】：河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：171 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖２－１?ｃｉｒｃＲＮＡ形成示意圖??

果與分析??３．１卵巢組織總ＲＮＡ質(zhì)量檢測??采集了黃體期（Ｌ）和卵泡期（Ｆ）的高（Ｈ）和低產(chǎn)仔數(shù)（Ｌ）大白母豬的卵巢組織共１６個樣??品，其中ＬＨ１、ＬＨ２、ＬＨ３和ＬＨ４分別代表ＬＨ組四個樣本；ＬＬ１、ＬＬ２、ＬＬ３和ＬＬ４分別代表??ＬＬ組四個樣本：ＦＨｌ、ＦＨ２、ＦＨ３和ＦＨ４分別代表ＦＨ組四個樣本；ＦＬ１、ＦＬ２、ＦＬ３和ＦＬ４分??別代表ＦＬ組四個樣本。采用ＴＲＺｏｌ法分別提取總ＲＮＡ，并利用１％瓊脂糖凝膠電泳對其進行檢??測，結(jié)果顯示每個樣本的總ＲＮＡ條帶清晰，無拖尾（圖３－丨和３－２），即總ＲＮＡ無降解現(xiàn)象。??Ｍ?１?２?３?４?５?６?７?８??注：Ｍ：?ＤＮＡＭａｒｋｅｒ２０００：卜４：?ＬＨ?組?ＲＮＡ?樣品：５？８：?ＬＬ?組?ＲＮＡ?樣品??Ｎｏｔｅ：?Ｍ：?ＤＮＡ?Ｍａｒｋｅｒ?２０００；?１?＇４：?ＲＮＡ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｏｒ?ＬＨ?ｇｒｏｕｐ；?５＾８：?ＲＮＡ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｏｒ?ＬＬ?ｇｒｏｕｐ??圖３－１?ＲＮＡ樣品凝膠電泳圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｔｏｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ??注：Ｍ：?ＤＮＡ?Ｍａｒｋｅｒ?２０００；卜４：?ＦＨ?組?ＲＮＡ?樣品；５？８：?ＦＬ?組?ＲＮＡ?樣品??Ｎｏｔｅ：?Ｍ：?ＤＮＡ?Ｍａｒｋｅｒ?２０００：?１?？４：?ＲＮＡ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｏｒ?ＦＨ?ｇｒｏｕｐ：?５？８：?ＲＮＡ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｏｒ?ＦＬ?ｇｒｏｕｐ??圖３－２?ＲＮＡ樣品凝膠電泳圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｔｏｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ??利用Ｎａｎｏｄｒｏｐ?２０００檢測各樣品總Ｒ

ＡＪｅ＾?ＡｕＵ８ＳｉＭ？ｍ？ｎ？ｊＵ＾Ｖ?ｎＭｅＣＶｐ??ＦＩＪＩ?ＦＨ２?ＦＨ３?ＦＩｆ４??ｉ｜?ｓ?案?｜?？＜?｜｜?．寶?｜?，．??Ａ?Ｉｆ．．．．??、．?．：?．．．■：＂?．二…?氣，．．?＾?ｒ．．????■■二二＇??－？？＂．＇－??Ｆ１．１?ＦＬ２?ＦＬ４??－Ｉ?？｜?４?－｜??？ｉ?？｜?ｓ；??：．＇???＼?■?■■■＇￣￣、?■，?????－?????．Ｖ．．．??圖３－４測序序列中堿基分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３－４?Ｂａｓｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｒｅａｄｓ??３＿２．２?ｍｉＲＮＡ－ｓｅｑ測序數(shù)據(jù)分析??１）原始數(shù)據(jù)質(zhì)控??從１６個卵巢組織ｍｉＲＮＡｓ測序文庫中共獲得了?４３３，７９２，９６３個ｒａｗ?ｒｅａｄｓ。原始數(shù)據(jù)經(jīng)過濾后??約７４．７５％？８８．３１％的ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ被保留下來，其中每個樣品的詳細(xì)信息見表３－３。此外，由表３－３??可見，１６個樣品中Ｑ２０均大于９８％，Ｑ３０均大于９７％，ＧＣ含量介于４３．７３％？４９．３５％之間。以??上分析結(jié)果均表明測序數(shù)據(jù)優(yōu)良，可以滿足后續(xù)分析。??表３－３?ｍｉＲＮＡｓ文庫測序數(shù)據(jù)信息??Ｔａｂｌｅ?３－３?Ｓｕｍｍａｒｙ?ｏｆ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｄａｔａ?ｆｒｏｍ?ｍｉＲＮＡｓ?ｌｉｂｒａｒｙ??樣品?過濾后ｒｅａｄｓ?過濾后堿基?ＧＣ含量（％）?長度（ｂｐ）??Ｑ２０?（％）?Ｑ３０?（％）??Ｓａｍｐｌｅ?Ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ?Ｃｌｅａｎ?ｂａｓｅｓ?ＧＣ?ｃｏｎｔｅｎｔ／％?Ｌｅｎｇ

【參考文獻】：
碩士論文
[1]lncRNA和miRNA在奶牛乳品質(zhì)調(diào)控中的作用[D]. 王學(xué)輝.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017



本文編號：3255379