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高覆蓋度甲基化重測(cè)序解析巴馬香豬組織和時(shí)序特異位點(diǎn)以及基因組全序列關(guān)聯(lián)分析研究F2家系肌纖維性狀的遺傳機(jī)理

發(fā)布時(shí)間:2021-06-14 02:00
  巴馬香豬體型小、耐近交,是藥理試驗(yàn)、疾病模型構(gòu)建和異種器官移植的重要模型動(dòng)物。DNA甲基化在基因的表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮著重要作用,是當(dāng)前的研究熱點(diǎn)之一。至今,不同時(shí)序年齡巴馬香豬不同組織的全基因組高分辨率甲基化研究還未見(jiàn)報(bào)道。本試驗(yàn)利用全基因組重亞硫酸鹽測(cè)序技術(shù)研究1歲、4歲和9歲共三個(gè)年齡段巴馬香豬公豬的睪丸和肌肉組織,首次以高覆蓋度甲基化重測(cè)序系統(tǒng)地解析巴馬香豬的組織特異和時(shí)序特異位點(diǎn),繪制了巴馬香豬睪丸和肌肉組織單堿基高分辨率全基因組甲基化圖譜,探討了DNA甲基化在巴馬香豬繁殖功能衰退和肌肉衰老機(jī)制,為動(dòng)物育種和人類(lèi)醫(yī)學(xué)研究提供重要的理論參考。結(jié)果表明,不同年齡段巴馬香豬公豬不同組織的全基因組總體甲基化水平約為4.4%,甲基化主要發(fā)生在CG環(huán)境下,約占70%(mCG/CG),平均占總甲基化水平的89.57%以上(mCG/mG),mCG環(huán)境下各染色體的甲基化水平基本一致,CHG和CHH環(huán)境的甲基化水平與總體甲基化水平(mC)在不同染色體上的分布趨勢(shì)一致;各染色體的甲基化水平與染色體長(zhǎng)度基本呈反比。不同年齡段、不同組織巴馬香豬基因功能區(qū)域全基因組甲基化模式相似,基因的內(nèi)含子區(qū)和3’UTR區(qū)... 

【文章來(lái)源】:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省

【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

高覆蓋度甲基化重測(cè)序解析巴馬香豬組織和時(shí)序特異位點(diǎn)以及基因組全序列關(guān)聯(lián)分析研究F2家系肌纖維性狀的遺傳機(jī)理


-1DNA甲基化示意圖

甲基化轉(zhuǎn)移酶,家族,甲基化酶,哺乳動(dòng)物


圖 1-1-2 甲基化轉(zhuǎn)移酶家族[7]Fig 1.1.2 Members of the DNMT family.2.2.1 維持甲基化酶DNMT1 是在哺乳動(dòng)物中含量最豐富、最早被發(fā)現(xiàn)并克。1988 年由 Bestor

照片,公豬,不同年齡,照片


圖 1-2-1 不同年齡巴馬香豬公豬照片F(xiàn)ig 1.2.1 Differents age of Bamaxiang boars因組 DNA 的提取及樣品檢測(cè)用標(biāo)準(zhǔn)酚-氯仿法提取睪丸組織和肌肉組織的基因組 DNA,將提取的 D

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]從江香豬基因組甲基化修飾與體重之間的相關(guān)性研究[J]. 林如濤,冉雪琴,王嘉福.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(04)
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博士論文
[1]京海黃雞腿肌全基因組甲基化和轉(zhuǎn)錄組分析研究[D]. 薛倩.揚(yáng)州大學(xué) 2017
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[6]金華豬和長(zhǎng)白豬肌纖維組成差異及ERK基因?qū)±w維轉(zhuǎn)化的影響研究[D]. 郭佳.浙江大學(xué) 2011

碩士論文
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[2]豬背部淺層和背部深層脂肪組織全基因組甲基化研究[D]. 張小麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]仔豬睪丸組織DNA甲基化及印記基因表達(dá)的研究[D]. 楊思強(qiáng).四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013



本文編號(hào):3228821

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