中國地鼠口腔黏膜癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)microRNA的篩選鑒定與體外功能分析
發(fā)布時(shí)間:2023-11-11 09:24
目的:建立中國地鼠口腔黏膜癌動物模型,根據(jù)WHO的分級標(biāo)準(zhǔn)將動物模型中口腔黏膜癌的發(fā)展分為四個(gè)階段:正常階段(normal stage),單純增生階段(simple hyperplasia stage),異常增生階段(abnormal hyperplasia stage),鱗癌階段(squamous cell and invasive carcinoma,cancer);運(yùn)用高通量測序技術(shù)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(qRT-PCR)對中國地鼠口腔黏膜癌發(fā)生發(fā)展過程中的各個(gè)階段進(jìn)行測序并驗(yàn)證測序結(jié)果,構(gòu)建各階段microRNA(miRNA)表達(dá)譜,并預(yù)測其靶基因,進(jìn)一步采用生物信息學(xué)的方法對其進(jìn)行功能分析,篩選出癌變過程中可能發(fā)揮重要作用的關(guān)鍵GO條目、信號通路及可能的生物標(biāo)志物。此外,通過體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步明確候選基因miRNA-181a-5p對人類口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞系Tca-8113和CAL-27生物學(xué)行為的影響,并對其靶基因和下游相關(guān)互作基因進(jìn)行驗(yàn)證。從非編碼RNA層面和基因表達(dá)的角度深入探究口腔鱗狀細(xì)胞癌形成過程中可能存在的調(diào)控機(jī)制,揭示候選miRNA在腫瘤細(xì)胞凋亡、周期、增殖、遷...
【文章頁數(shù)】:171 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對照表
前言
第一部分 中國地鼠口腔黏膜癌動物模型的建立
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)動物
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 肉眼觀察
2.2 HE病理鑒定
2.3 透射電鏡超微觀結(jié)構(gòu)觀察
2.4 AFP、TNF-ɑ、SCC-Ag的血清含量檢測
3 討論
4 結(jié)論
第二部分 口腔黏膜癌病變各階段差異表達(dá)miRNA表達(dá)譜的構(gòu)建與生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 樣品準(zhǔn)備
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 組織RNA樣本的質(zhì)控
2.2 測序數(shù)據(jù)過濾及質(zhì)控
2.3 差異表達(dá)miRNA的鑒定
2.4 差異miRNA靶基因的預(yù)測與篩選
2.5 GO富集分析
2.6 KEGG富集分析
3 討論
4 結(jié)論
第三部分 候選基因在各階段口腔黏膜癌組織中的q RT-PCR驗(yàn)證
1 材料與方法
1.1 樣品準(zhǔn)備
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論
第四部分 miR-181a-5p對人類口腔鱗癌細(xì)胞系生物學(xué)行為的影響
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 qRT-PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)染效率
2.2 最佳轉(zhuǎn)染條件的探究
2.3 miR-181a-5p表達(dá)的改變調(diào)節(jié)OSCC細(xì)胞增殖
2.4 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系平板克隆的影響
2.5 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系周期的影響
2.6 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系凋亡的影響
2.7 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系侵襲的影響
2.8 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系遷移的影響
3 討論
4 結(jié)論
第五部分 miR-181a-5p靶向調(diào)控TIMP1 影響人類口腔鱗癌細(xì)胞的生物學(xué)功能
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 miR-181a-5p靶基因的預(yù)測
2.2 靶基因的互作與預(yù)后分析
2.3 各處理組細(xì)胞中靶基因及其互作基因的表達(dá)驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個(gè)人簡介
本文編號:3862365
【文章頁數(shù)】:171 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對照表
前言
第一部分 中國地鼠口腔黏膜癌動物模型的建立
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)動物
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 肉眼觀察
2.2 HE病理鑒定
2.3 透射電鏡超微觀結(jié)構(gòu)觀察
2.4 AFP、TNF-ɑ、SCC-Ag的血清含量檢測
3 討論
4 結(jié)論
第二部分 口腔黏膜癌病變各階段差異表達(dá)miRNA表達(dá)譜的構(gòu)建與生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 樣品準(zhǔn)備
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 組織RNA樣本的質(zhì)控
2.2 測序數(shù)據(jù)過濾及質(zhì)控
2.3 差異表達(dá)miRNA的鑒定
2.4 差異miRNA靶基因的預(yù)測與篩選
2.5 GO富集分析
2.6 KEGG富集分析
3 討論
4 結(jié)論
第三部分 候選基因在各階段口腔黏膜癌組織中的q RT-PCR驗(yàn)證
1 材料與方法
1.1 樣品準(zhǔn)備
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論
第四部分 miR-181a-5p對人類口腔鱗癌細(xì)胞系生物學(xué)行為的影響
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 qRT-PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)染效率
2.2 最佳轉(zhuǎn)染條件的探究
2.3 miR-181a-5p表達(dá)的改變調(diào)節(jié)OSCC細(xì)胞增殖
2.4 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系平板克隆的影響
2.5 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系周期的影響
2.6 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系凋亡的影響
2.7 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系侵襲的影響
2.8 miR-181a-5p對 OSCC細(xì)胞系遷移的影響
3 討論
4 結(jié)論
第五部分 miR-181a-5p靶向調(diào)控TIMP1 影響人類口腔鱗癌細(xì)胞的生物學(xué)功能
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 miR-181a-5p靶基因的預(yù)測
2.2 靶基因的互作與預(yù)后分析
2.3 各處理組細(xì)胞中靶基因及其互作基因的表達(dá)驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
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本文編號:3862365
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