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核酸納米花制備技術(shù)的優(yōu)化及其在炎癥發(fā)生分子機(jī)制分析中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-12-08 22:47
  目的:本研究主要將核酸納米花(NFs)與RNA激活(RNAa)技術(shù)聯(lián)用在啟動(dòng)子水平上探究miR-155在炎癥發(fā)生過程中的作用機(jī)制以及miR-155與其靶基因共表達(dá)后對炎癥發(fā)生的作用影響,以期實(shí)現(xiàn)對重大疾病的早期預(yù)警,為炎癥的預(yù)防、相關(guān)疾病的治療和阻止其惡化提供新思路。方法:1.通過優(yōu)化連接反應(yīng)和滾環(huán)轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的條件、表征NFs的形態(tài)大小、檢測NFs對細(xì)胞的毒性作用、入胞效率和作用效果,構(gòu)建具RNAa作用的NFs。2.根據(jù)saRNA設(shè)計(jì)原則查找出可激活miR-155的序列、利用CCK-8法檢測細(xì)胞毒性、RT-qPCR法檢測miR-155表達(dá)情況從而篩選出可高效激活miR-155的saRNA;隨后通過對比細(xì)胞形態(tài)變化、細(xì)胞遷移能力以及炎癥相關(guān)效應(yīng)因子表達(dá)情況從而證實(shí)miR-155在炎癥發(fā)生過程中的作用機(jī)制。3.根據(jù)預(yù)測的miR-155靶基因及其富集通路,探究激活miR-155及其靶基因后探究二者共表達(dá)后相互作用對細(xì)胞的影響。結(jié)果:1.對NFs的成環(huán)過程與擴(kuò)增過程的反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化,選用高連接效率的T4 DNA連接酶、模板與引物濃度比為1:1、將雜交時(shí)間優(yōu)化為2 h和連接時(shí)間優(yōu)化為3 h、原料... 

【文章來源】:華僑大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:99 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

核酸納米花制備技術(shù)的優(yōu)化及其在炎癥發(fā)生分子機(jī)制分析中的應(yīng)用


miR-155的形成過程

免疫細(xì)胞,信號通路,過表達(dá)


5圖1.2miR-155在免疫細(xì)胞中的調(diào)控作用1.1.4miR-155-SHIP1-PI3K-AKT信號通路對miR-155的靶基因預(yù)測我們發(fā)現(xiàn)SHIP1是miR-155的靶標(biāo),且在SHIP1的3’-UTR中有保守的八聚體靶“種子”,具有高度保守的miR-155結(jié)合位點(diǎn)。SHIP1是肌醇5磷酸酶家族的成員之一,主要由造血區(qū)室中的細(xì)胞表達(dá);其功能是調(diào)控造血干細(xì)胞的生長、分化和作用發(fā)揮。在彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤(DLBCL)中,TNF-α誘導(dǎo)miR-155過表達(dá),隨后過表達(dá)的miR-155阻斷SHIP1,并進(jìn)一步增強(qiáng)TNF-α的促炎作用[24]。Viernes等[36]研究證明了SHIP1是炎癥反應(yīng)的負(fù)調(diào)節(jié)因子,可通過下調(diào)AKT的活性來抑制磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)炎癥信號通路的傳導(dǎo)途徑。PI3K-AKT信號通路是經(jīng)典的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡和周期進(jìn)程和葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)等多種細(xì)胞功能的調(diào)節(jié)。其信號過度激活可作用下游多種因子如促進(jìn)MMP和mTOR的表達(dá)、將FOXO和p53磷酸化從而喪失活性、促進(jìn)血管生成、激活I(lǐng)κB激酶(InhibitorKappaBKinase,IKK)信號體復(fù)合物從而激活NF-кB信號通路最終引起miR-155的表達(dá)增加。因此,過表達(dá)的miR-155靶向SHIP1導(dǎo)致AKT活化延長,從而正反饋炎癥信號通路,促使炎癥持續(xù)進(jìn)行[37]。綜上可知,炎癥反應(yīng)發(fā)生后miR-155將過表達(dá)并參與炎癥反應(yīng),過表達(dá)的miR-155與炎癥反應(yīng)的發(fā)展密切相關(guān),甚至還能誘導(dǎo)癌癥發(fā)生。然而,這些研究只能證明miR-155過表達(dá)后在相關(guān)信號通路和免疫細(xì)胞的調(diào)控中是重要的參與者,在miR-155表達(dá)增加的同時(shí),其他相關(guān)炎性因子表達(dá)也增加。因此,關(guān)于miR-155的研究亟需從其源頭上加以關(guān)注——若無外界炎性物質(zhì)刺激,僅增加miR-155的表達(dá),是否能引起炎癥的發(fā)生?

過程圖,過程,基因,技術(shù)


8(8)靶標(biāo)的3’端具有比其5’端熱力學(xué)穩(wěn)定性低。Ago2在saRNA相對于其3"末端的5’末端使用具有較低熱力學(xué)穩(wěn)定性的鏈作為指導(dǎo)。(9)第7個(gè)堿基是“T”;第19位堿基是“A”;第18位是“A”或“T”,最好是“A”。RNAa現(xiàn)象早在1969年就被發(fā)現(xiàn)[45],但當(dāng)時(shí)未引起關(guān)注,在近10年各位學(xué)者才對其重視。RNAa通過激活內(nèi)源性靶基因的表達(dá)來實(shí)現(xiàn)的基因功能恢復(fù),可恢復(fù)不同基因的功能作用。與傳統(tǒng)的基因過表達(dá)技術(shù)相比,RNAa技術(shù)顯示出操作簡單快捷、實(shí)驗(yàn)周期較短、實(shí)驗(yàn)成本低等特點(diǎn),為其用于實(shí)驗(yàn)探究提供了諸多優(yōu)勢。由于saRNA在基因調(diào)控、表觀遺傳、疾病治療等方面具有相當(dāng)大的應(yīng)用潛力,鑒于其諸多優(yōu)勢,RNAa可作為一種極有潛力的新型基因干預(yù)治療手段。且Dar研究團(tuán)隊(duì)[46]建立了saRNA數(shù)據(jù)庫(http://bioinfo.imtech.res.in/manojk/sarna/)來收集已驗(yàn)證有效的saRNA的詳細(xì)資料,用以基于基因治療的研究。因此,RNAa這一技術(shù)的研究與應(yīng)用也提示我們,在源頭上探究miR-155在炎癥中的作用機(jī)制,可通過利用RNAa僅將miR-155的宿主基因激活使其自主形成成熟的miR-155,從而研究其在炎癥發(fā)生過程中的作用機(jī)制,此技術(shù)也可大大降低實(shí)驗(yàn)技術(shù)的難點(diǎn)與減少實(shí)驗(yàn)周期。圖1.3RNAa的作用過程

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增及生物分析新方法研究[D]. 杜文芳.湖南大學(xué) 2018

碩士論文
[1]基于PLP-RCA的唐氏綜合癥產(chǎn)前篩查方法的建立與優(yōu)化[D]. 王倩倩.華僑大學(xué) 2019
[2]miR-146a、miR-155-5p在類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎中的作用機(jī)制研究[D]. 熊瑤.華僑大學(xué) 2019
[3]MiR-155通過靶向結(jié)合PI3K/Akt/mTOR信號通路促進(jìn)ox-LDL誘導(dǎo)的內(nèi)皮細(xì)胞自噬[D]. 殷霜霜.青島大學(xué) 2018
[4]基于適配體的RNAi調(diào)控與siRNA遞送的研究[D]. 程慧.上海大學(xué) 2017
[5]急性髓細(xì)胞白血病中miR-155、SHIP1及AKT的表達(dá)及臨床意義[D]. 胡獻(xiàn)麗.南昌大學(xué)醫(yī)學(xué)院 2015
[6]DNA自組裝納米花的設(shè)計(jì)制備與載藥及成像應(yīng)用研究[D]. 梅蕾.湖南大學(xué) 2015



本文編號:3529392

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