基于核酸序列依賴擴增技術診斷侵襲性念珠菌病的實驗研究
發(fā)布時間:2021-01-21 02:59
目的:侵襲性念珠菌。╥nvasive candidiasis,IC)是一種臨床癥狀和體征不典型,且發(fā)病率和病死率逐年增高的感染性疾病。早期的診斷和治療有助于提高患者生存率并改善患者預后。本研究擬構建核酸序列依賴擴增(nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)技術檢測念珠菌,用于快速診斷IC,并結合G試驗和血培養(yǎng)結果,確定實驗室診斷IC的最佳方案。方法:首先確定針對念珠菌屬18S rRNA的高度保守序列的引物,建立NASBA結合電泳檢測白色念珠菌標準株(ATCC14053)的方法,并對其靈敏度和特異性進行評估。然后,參照EORTC/MSG對侵襲性真菌病定義的標準,擬定IC陽性病例組和排除IC的陰性對照組的納入標準,收集并最終納入統(tǒng)計38例臨床樣本(病例組18例(確診15例,擬診3例),對照組20例),應用本研究構建的NASBA法進行檢測,收集所有病例的血培養(yǎng)和G試驗檢查結果,并計算三種方法的診斷性能參數(shù)。結果:NASBA產物電泳結果顯示臨床七種不同的念珠菌(白色念珠菌、熱帶念珠菌、近平滑念珠菌、光滑念珠菌、克柔念珠菌、都柏林念珠菌、...
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
NASBA法結合電泳檢測白色念珠菌的靈敏度評價Fig1.1SensitivityevaluationofNASBAcombinedwithelectrophoresisassayfordetecting
重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文14圖1.1NASBA法結合電泳檢測白色念珠菌的靈敏度評價Fig1.1SensitivityevaluationofNASBAcombinedwithelectrophoresisassayfordetectingCandidaalbicans注:M為DL5000bpmarker,1-6分別為電泳檢測NASBA擴增105CFU/ml、104CFU/ml、103CFU/ml、102CFU/ml、101CFU/ml、1CFU/ml白色念珠菌的結果。3.2特異性評價如圖1.2和圖1.3所示,本次實驗建立的NASBA結合電泳法檢測7種不同念珠菌株呈陽性結果,而其他非念珠菌真菌及細菌均呈陰性結果。表明特異性良好。圖1.2念珠菌屬不同菌株經NASBA擴增后的電泳結果Fig1.2ElectrophoresisresultsofdifferentspeciesofCandidaamplifiedbyNASBA注:M為DL500bpmarker,1-7分別為電泳檢測NASBA擴增白色念株菌ATCC14053、近平滑念珠菌ATCC22019、克柔念珠菌ATCC6258、熱帶念珠菌(臨床分離菌株)、光滑念珠菌ATCC2950、都柏林念珠菌(臨床分離菌株)、季也蒙念珠菌(臨床分離菌株)的菌株RNA結果。
重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文15圖1.3各種非念珠菌屬菌株經NASBA擴增后的電泳結果Fig1.3Electrophoresisresultsofvariousnon-CandidastrainsamplifiedbyNASBA注:M為DL1000bpmarker,1-9分別為電泳檢測NASBA擴增新型隱球菌(臨床分離菌株)、煙曲霉(ATCCMYA-3626)、金黃色葡萄球菌ATCC25923、大腸埃希菌ATCC25922、銅綠假單胞菌(ATCC27853)、紋帶棒狀桿菌(臨床分離菌株)、艱難梭菌(ATCC43255)、新型隱球菌(臨床分離菌株)、煙曲霉(ATCCMYA-3626)的菌株RNA結果。4討論念珠菌是一種廣泛存在于自然界,同時也是寄居在人體最常見的真菌。一般認為,念珠菌是人體皮膚、口腔、陰道、胃腸道等與外界相通部位的正常菌群成員,不會導致深部器官或組織感染。當人體免疫力低下、生理屏障破壞、菌群失調時,念珠菌可侵入人體組織、器官、血液,導致IC的發(fā)生[3,28,29]。及時、準確診斷IC是指導臨床正確管理IC患者的關鍵。傳統(tǒng)的念珠菌培養(yǎng)法和組織病理學檢查存在檢驗周期長和敏感性低的缺陷,某些情況下還需對患者進行侵入性操作才能采集標本送檢。檢測血清標志物BDG在一定程度可降低檢驗周轉時間,達到早期、快速的診斷需求,但其診斷IC的假陽性問題突出,不能滿足臨床準確診斷IC的需求。分子檢測技術是診斷感染性疾病的發(fā)展方向,傳統(tǒng)PCR法存在復雜的熱變性過程,對儀器設備的精密程度要求較高,且存在外源性DNA污染的問題,盡管目前多種基于PCR的分子診斷技術被研發(fā)用于診斷IC,但尚無標準化操作程序[5]。NASBA技術相較于PCR技術的優(yōu)勢在于以單鏈RNA為模板,在AMV逆轉
【參考文獻】:
碩士論文
[1]核酸序列依賴擴增技術檢測侵襲性曲霉菌感染的實驗研究[D]. 王立朋.重慶醫(yī)科大學 2014
[2]基于NASBA技術檢測細菌耐藥性方法的建立[D]. 賀爾娜.寧波大學 2014
本文編號:2990319
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
NASBA法結合電泳檢測白色念珠菌的靈敏度評價Fig1.1SensitivityevaluationofNASBAcombinedwithelectrophoresisassayfordetecting
重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文14圖1.1NASBA法結合電泳檢測白色念珠菌的靈敏度評價Fig1.1SensitivityevaluationofNASBAcombinedwithelectrophoresisassayfordetectingCandidaalbicans注:M為DL5000bpmarker,1-6分別為電泳檢測NASBA擴增105CFU/ml、104CFU/ml、103CFU/ml、102CFU/ml、101CFU/ml、1CFU/ml白色念珠菌的結果。3.2特異性評價如圖1.2和圖1.3所示,本次實驗建立的NASBA結合電泳法檢測7種不同念珠菌株呈陽性結果,而其他非念珠菌真菌及細菌均呈陰性結果。表明特異性良好。圖1.2念珠菌屬不同菌株經NASBA擴增后的電泳結果Fig1.2ElectrophoresisresultsofdifferentspeciesofCandidaamplifiedbyNASBA注:M為DL500bpmarker,1-7分別為電泳檢測NASBA擴增白色念株菌ATCC14053、近平滑念珠菌ATCC22019、克柔念珠菌ATCC6258、熱帶念珠菌(臨床分離菌株)、光滑念珠菌ATCC2950、都柏林念珠菌(臨床分離菌株)、季也蒙念珠菌(臨床分離菌株)的菌株RNA結果。
重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文15圖1.3各種非念珠菌屬菌株經NASBA擴增后的電泳結果Fig1.3Electrophoresisresultsofvariousnon-CandidastrainsamplifiedbyNASBA注:M為DL1000bpmarker,1-9分別為電泳檢測NASBA擴增新型隱球菌(臨床分離菌株)、煙曲霉(ATCCMYA-3626)、金黃色葡萄球菌ATCC25923、大腸埃希菌ATCC25922、銅綠假單胞菌(ATCC27853)、紋帶棒狀桿菌(臨床分離菌株)、艱難梭菌(ATCC43255)、新型隱球菌(臨床分離菌株)、煙曲霉(ATCCMYA-3626)的菌株RNA結果。4討論念珠菌是一種廣泛存在于自然界,同時也是寄居在人體最常見的真菌。一般認為,念珠菌是人體皮膚、口腔、陰道、胃腸道等與外界相通部位的正常菌群成員,不會導致深部器官或組織感染。當人體免疫力低下、生理屏障破壞、菌群失調時,念珠菌可侵入人體組織、器官、血液,導致IC的發(fā)生[3,28,29]。及時、準確診斷IC是指導臨床正確管理IC患者的關鍵。傳統(tǒng)的念珠菌培養(yǎng)法和組織病理學檢查存在檢驗周期長和敏感性低的缺陷,某些情況下還需對患者進行侵入性操作才能采集標本送檢。檢測血清標志物BDG在一定程度可降低檢驗周轉時間,達到早期、快速的診斷需求,但其診斷IC的假陽性問題突出,不能滿足臨床準確診斷IC的需求。分子檢測技術是診斷感染性疾病的發(fā)展方向,傳統(tǒng)PCR法存在復雜的熱變性過程,對儀器設備的精密程度要求較高,且存在外源性DNA污染的問題,盡管目前多種基于PCR的分子診斷技術被研發(fā)用于診斷IC,但尚無標準化操作程序[5]。NASBA技術相較于PCR技術的優(yōu)勢在于以單鏈RNA為模板,在AMV逆轉
【參考文獻】:
碩士論文
[1]核酸序列依賴擴增技術檢測侵襲性曲霉菌感染的實驗研究[D]. 王立朋.重慶醫(yī)科大學 2014
[2]基于NASBA技術檢測細菌耐藥性方法的建立[D]. 賀爾娜.寧波大學 2014
本文編號:2990319
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