JAK2 exon12與CALR基因共突變一例ET患者的克隆分析及對JAK2 exon12不典型新突變的功能研究
發(fā)布時間:2020-12-18 06:47
目的:Ph染色體陰性的經(jīng)典骨髓增殖性腫瘤(MPN)以紅系、粒系和巨核系中一系或多系髓細胞過度增殖為主要特征,是一種惡性血液腫瘤疾病。臨床上主要以真性紅細胞增多癥(PV)、原發(fā)性血小板增多癥(ET)和原發(fā)性骨髓纖維化(PMF)多見。目前,研究證實MPN的主要分子病因包括JAK2、MPL和CALR基因突變,在MPN疾病中相互排斥發(fā)生。其中,JAK2基因突變見于95%的PV患者,突變類型主要為JAK2 V617F和JAK2 exon12。MPLW515是最常見的MPL基因突變類型,僅見于1%-10%的ET和PMF患者。CALR基因的突變熱點位于9號外顯子,主要表現(xiàn)為兩種突變類型(52-bp缺失和5-bp插入),主要見于ET和PMF患者。其余未檢測到上述三種驅(qū)動基因主要熱點突變的MPN稱為“三陰性”MPN(TN-MPN),主要見于15%的ET和低于10%的PMF患者。近年來,研究者在少數(shù)MPN患者中發(fā)現(xiàn)了驅(qū)動基因雙突變的患者,以JAK2 V617F和CALR基因共突變多見,可見于PV、ET及PMF患者。臨床工作中我們首次發(fā)現(xiàn)JAK2 exonl2(JAK2 N533S不典型突變)和CALR(5...
【文章來源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
JAK2N533S和CALRtype1雙突變患者初診的臨床結(jié)果
山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文182.2臨床水平分析患者JAK2N533S和CALRtypeⅠ型共突變的克隆關(guān)系2.2.1BFU-E和CFU-G集落形成圖提取患者新鮮外周血中單個核細胞,用DMEM基礎(chǔ)培養(yǎng)基將提取的單個核細胞稀釋成1×102cells/mL的細胞密度,輕柔吹打混勻成單細胞懸液,用有限稀釋法培養(yǎng)獲取單細胞克隆,然后挑取單細胞克隆,分別用含3U/mlrhEPO和100ng/mlrhG-CSF的甲基纖維素培養(yǎng)基培養(yǎng)單細胞克隆15天,誘導(dǎo)形成暴發(fā)型紅系集落形成單位(BFU-E)和粒細胞集落形成單位(CFU-G),結(jié)果如下:圖2BFU-E和CFU-G集落形成圖(X10)2.2.2BFU-E及CFU-G單個集落JAK2N533S和CALR-typeⅠ型突變檢測結(jié)果我們共挑取了17個BFU-E集落和21個CFU-G集落,并提取每個集落細胞的DNA,用相應(yīng)引物對JAK2exon12和CALRexon9進行PCR擴增,然后取10ul擴增產(chǎn)物進行一代測序。我們用九格圖對測序結(jié)果進行描述分析,九格圖的橫軸從左到右依次為CALR野生型(WT)、CALRtypeⅠ型雜合型(Het)和純合型(Hom),縱軸自上而下依次為JAK2N533S純合型(Hom)、雜合型(Het)和野生型(WT)。我們用一個點表示一個集落,紅點代表BFU-E集落,藍點代表CFU-G集落,用每個點在九格圖的位置代表檢測結(jié)果。具體結(jié)果如下:
山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文19①挑取的17個BFU-E集落,經(jīng)檢測全部攜帶JAK2N533S雜合突變,14個(82%)集落攜帶CALRtype1雜合突變,2個(12%)集落為CALR野生型,1個(6%)集落檢測到CALRtype1純合突變。②挑取的21個CFU-G集落,經(jīng)檢測均存在JAK2N533S雜合突變,20個(95%)集落攜帶CALRtype1雜合突變,1個(5%)集落為CALR野生型。圖3BFU-E及CFU-G單個集落JAK2N533S和CALR-typeⅠ型突變檢測結(jié)果圖(左上:BFU-E集落測序結(jié)果分析九格圖右上:BFU-E集落測序峰圖左下:CFU-G集落測序結(jié)果分析九格圖右下:CFU-G集落測序峰圖)2.2.3患者毛囊DNA中JAK2N533S和CALR基因突變檢測的結(jié)果我們在紅系及粒系所有集落中均檢測出JAK2N533S雜合突變,推測該突變可能為胚系突變。因此,我們通過提取該患者的毛囊DNA,檢測JAK2N533S及CALR基因突變情況并進行一代測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)JAK2N533S雜合突變?nèi)詾殛栃,而CALR基因為野生型,從而驗證了JAK2N533S突變?yōu)榕呦低蛔。JAK2N533S和CALR基因測序峰圖如下:
本文編號:2923561
【文章來源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
JAK2N533S和CALRtype1雙突變患者初診的臨床結(jié)果
山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文182.2臨床水平分析患者JAK2N533S和CALRtypeⅠ型共突變的克隆關(guān)系2.2.1BFU-E和CFU-G集落形成圖提取患者新鮮外周血中單個核細胞,用DMEM基礎(chǔ)培養(yǎng)基將提取的單個核細胞稀釋成1×102cells/mL的細胞密度,輕柔吹打混勻成單細胞懸液,用有限稀釋法培養(yǎng)獲取單細胞克隆,然后挑取單細胞克隆,分別用含3U/mlrhEPO和100ng/mlrhG-CSF的甲基纖維素培養(yǎng)基培養(yǎng)單細胞克隆15天,誘導(dǎo)形成暴發(fā)型紅系集落形成單位(BFU-E)和粒細胞集落形成單位(CFU-G),結(jié)果如下:圖2BFU-E和CFU-G集落形成圖(X10)2.2.2BFU-E及CFU-G單個集落JAK2N533S和CALR-typeⅠ型突變檢測結(jié)果我們共挑取了17個BFU-E集落和21個CFU-G集落,并提取每個集落細胞的DNA,用相應(yīng)引物對JAK2exon12和CALRexon9進行PCR擴增,然后取10ul擴增產(chǎn)物進行一代測序。我們用九格圖對測序結(jié)果進行描述分析,九格圖的橫軸從左到右依次為CALR野生型(WT)、CALRtypeⅠ型雜合型(Het)和純合型(Hom),縱軸自上而下依次為JAK2N533S純合型(Hom)、雜合型(Het)和野生型(WT)。我們用一個點表示一個集落,紅點代表BFU-E集落,藍點代表CFU-G集落,用每個點在九格圖的位置代表檢測結(jié)果。具體結(jié)果如下:
山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文19①挑取的17個BFU-E集落,經(jīng)檢測全部攜帶JAK2N533S雜合突變,14個(82%)集落攜帶CALRtype1雜合突變,2個(12%)集落為CALR野生型,1個(6%)集落檢測到CALRtype1純合突變。②挑取的21個CFU-G集落,經(jīng)檢測均存在JAK2N533S雜合突變,20個(95%)集落攜帶CALRtype1雜合突變,1個(5%)集落為CALR野生型。圖3BFU-E及CFU-G單個集落JAK2N533S和CALR-typeⅠ型突變檢測結(jié)果圖(左上:BFU-E集落測序結(jié)果分析九格圖右上:BFU-E集落測序峰圖左下:CFU-G集落測序結(jié)果分析九格圖右下:CFU-G集落測序峰圖)2.2.3患者毛囊DNA中JAK2N533S和CALR基因突變檢測的結(jié)果我們在紅系及粒系所有集落中均檢測出JAK2N533S雜合突變,推測該突變可能為胚系突變。因此,我們通過提取該患者的毛囊DNA,檢測JAK2N533S及CALR基因突變情況并進行一代測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)JAK2N533S雜合突變?nèi)詾殛栃,而CALR基因為野生型,從而驗證了JAK2N533S突變?yōu)榕呦低蛔。JAK2N533S和CALR基因測序峰圖如下:
本文編號:2923561
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