本文關(guān)鍵詞：24例大腸癌PDX模型的熱點(diǎn)基因突變分析

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【摘要】：研究背景及目的:大腸癌是全世界范圍內(nèi)常見的致死性疾病之一,全球發(fā)病率處于第三,我國的大腸癌發(fā)病率也處于上升趨勢。大腸癌的早期篩查、治療策略、療效評(píng)價(jià)對(duì)于改善大腸癌患者預(yù)后有重要意義。大腸癌的發(fā)生發(fā)展受多個(gè)基因調(diào)節(jié)以及表觀遺傳學(xué)的調(diào)控,與大腸癌密切聯(lián)系的基因如抑癌基因APC、TP53,原癌基因KRAS、BRAF等的突變均是大腸癌演進(jìn)過程中的重要基因。基于高通量測序技術(shù)Ion Torrent和50個(gè)目前已知與腫瘤相關(guān)基因的CancerPanel,是大腸癌研究的重要工具。腫瘤研究離不開良好的動(dòng)物移植瘤模型,而PDX模型因?yàn)槟茌^完整保留腫瘤的生物學(xué)特性、傳代遺傳漂變極小等特點(diǎn)越來越成為腫瘤研究動(dòng)物模型的金標(biāo)準(zhǔn)。本實(shí)驗(yàn)基于大腸癌新鮮組織移植成功的PDX模型,取樣本進(jìn)行Ion Torrent,利用CancerPanel檢測突變基因,對(duì)發(fā)現(xiàn)的熱點(diǎn)突變作簡單分析,并探索熱點(diǎn)突變對(duì)移植瘤生長的影響,以期發(fā)現(xiàn)大腸癌個(gè)體化治療的新可能。實(shí)驗(yàn)內(nèi)容與方法:(1)篩選24例大腸癌病例,利用手術(shù)時(shí)所取得腫瘤組織種植PDX模型。(2)PDX模型種植成功后,取樣本進(jìn)行IonTorrent測序,使用PGM測序平臺(tái)和CancerPanel檢測熱點(diǎn)突變。(4)對(duì)檢測到的熱點(diǎn)突變進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,與CCSMIC數(shù)據(jù)庫對(duì)比。(5)篩選突變率較高的基因,分組后與移植瘤的成瘤時(shí)間行t檢驗(yàn),探索熱點(diǎn)突變對(duì)移植瘤生長速度的印影響。實(shí)驗(yàn)結(jié)果:(1)通過CancerPanel,共發(fā)現(xiàn)24個(gè)熱點(diǎn)突變基因,其中TP53、KRAS、APC、PIK3CA等基因突變率較高,與COSMIC數(shù)據(jù)庫對(duì)比相似。(2)NOTCH1、KDR兩個(gè)基因在本實(shí)驗(yàn)中突變率較高,與CCSMIC數(shù)據(jù)庫對(duì)比有較大差異,有進(jìn)一步用于藥敏性實(shí)驗(yàn)探究的可能。(3)本實(shí)驗(yàn)PDX模型的生長速度與樣本的臨床背景無明顯相關(guān)性。(4)KRAS基因突變對(duì)移植瘤生長速度有明顯加快作用(p=0.007),其他基因與移植瘤生長速度無明顯相關(guān)性(p0.05)。結(jié)論:(1)PDX模型通過Cancer Panel檢測熱點(diǎn)突變,有助于制定治療策略、指導(dǎo)藥物選擇和評(píng)估療效,實(shí)現(xiàn)個(gè)體化治療。(2)本實(shí)驗(yàn)中各樣本臨床背景與PDX模型的生長速度無明顯相關(guān)性。(3)本實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)KRAS基因突變能顯著加快PDX模型生長速度,但其他熱點(diǎn)突變與生長速度無明顯關(guān)系。
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R735.34

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

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本文編號(hào)：1305048