本文關(guān)鍵詞：連云港市結(jié)核桿菌分子分型及其與臨床特征的關(guān)聯(lián)研究

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【摘要】：背景與目的:結(jié)核病是由結(jié)核桿菌感染引起的慢性傳染性疾病。世界衛(wèi)生組織2016年全球結(jié)核病報(bào)告顯示,2015年全球新發(fā)結(jié)核病例1040萬(wàn),140萬(wàn)人因結(jié)核病死亡。中國(guó)是結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國(guó)家,病例數(shù)僅次于印度和印度尼西亞,位居第三。我國(guó)結(jié)核病疫情存在高感染率、高患病率、高耐藥率、高復(fù)發(fā)率、低發(fā)現(xiàn)率的特點(diǎn)。傳統(tǒng)的流行病學(xué)研究方法在確認(rèn)結(jié)核病傳染源及傳播規(guī)律方面往往存在局限性,而分子流行病學(xué)的發(fā)展則為結(jié)核病研究提供了有力武器,能夠有效追蹤傳染源、發(fā)現(xiàn)結(jié)核桿菌傳播規(guī)律、識(shí)別重點(diǎn)人群,為結(jié)核病防治工作提供科學(xué)依據(jù)。本次研究運(yùn)用分子流行病學(xué)方法對(duì)連云港市傳染性肺結(jié)核病人臨床分離株進(jìn)行基因分型,探討其遺傳多樣性、菌株成簇性及其與臨床特征等因素的關(guān)聯(lián)性,分析成簇菌株的地理位置分布及系統(tǒng)進(jìn)化特點(diǎn),為連云港市結(jié)核病防治提供科學(xué)依據(jù)。方法:本研究選擇江蘇省連云港市為研究現(xiàn)場(chǎng),以2013～2014年新診斷的痰培養(yǎng)陽(yáng)性結(jié)核病患者為研究對(duì)象,收集人口學(xué)特征、臨床資料、診治經(jīng)過(guò)等信息。本次研究包括兩個(gè)部分。第一部分采用數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列-結(jié)核桿菌散在重復(fù)單位(variable number tandem repeats-mycobacterial interspersed repetitive units,VNTR-MIRU)15位點(diǎn)組合方法對(duì)結(jié)核桿菌臨床分離株進(jìn)行分子分型,探討其遺傳多樣性和特異指紋圖譜,分析連云港市結(jié)核病傳播規(guī)律及與臨床特征的關(guān)聯(lián)。VNTR-MIRU位點(diǎn)組合對(duì)菌株分辨力的判斷采用Hunter-Gaston指數(shù)(Hunter-Gaston discriminatory index,HGDI)表示。第二部分在結(jié)核桿菌分子分型的基礎(chǔ)上,采用R語(yǔ)言pheatmap軟件包對(duì)數(shù)字化分型結(jié)果進(jìn)行聚類(lèi)分析,運(yùn)用BioNumerics7.0軟件構(gòu)建最小生成樹(shù),開(kāi)展成簇性分析,并探討菌株成簇性影響因素。成簇風(fēng)險(xiǎn)分析采用Logistic回歸模型,并用比值比(OR)及其95%可信區(qū)間(CI)表示。結(jié)果:(1)對(duì)742株菌株采用15位點(diǎn)VNTR-MIRU基因分型,結(jié)果顯示,總分辨力HGDI值為0.99998,其中遺傳多樣性最高的是Qub11b位點(diǎn),h=0.763,遺傳多樣性最小的位點(diǎn)為ETRC,h=0.037。(2)成簇性分析發(fā)現(xiàn)菌株共聚成643個(gè)類(lèi),其中未成簇而形成的"唯一"類(lèi)的共597個(gè),145例成簇菌株形成46個(gè)簇,成簇比例為19.54%。成簇菌株中形成較大簇(所含菌株例數(shù)≥5例)的菌株比例為35.17%。將較大簇菌株病例的居住位置在地圖上標(biāo)注后,呈現(xiàn)一定的地區(qū)聚集性,南北部均有特定基因型菌株聚集,大部分成簇菌株沿主干交通線分布。(3)菌株成簇性影響因素分析發(fā)現(xiàn),職業(yè)、治療結(jié)局等與菌株成簇性的關(guān)聯(lián)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,非農(nóng)民職業(yè)的患者感染株表現(xiàn)出更高的成簇風(fēng)險(xiǎn)(調(diào)整OR=2.35,95%CI:1.33-4.15,P=0.003),不良治療結(jié)局的患者表現(xiàn)出較高的成簇風(fēng)險(xiǎn)(調(diào)整 OR=1.85,95%CI:1.00-3.45,P=0.050)。(4)對(duì)連云港市結(jié)核桿菌流行株構(gòu)建最小生成樹(shù)分析并未發(fā)現(xiàn)特定的聚集性現(xiàn)象,結(jié)論:(1)連云港市結(jié)核桿菌流行株呈現(xiàn)較高的遺傳多樣性,成簇比例與附近縣市相近,與距離較遠(yuǎn)的其他地區(qū)存在差異�；颊咧薪趥鞑ケ壤^低,提示復(fù)燃及既往感染不容忽視。(2)空間分析顯示成較大簇的病例呈現(xiàn)相對(duì)集中的特點(diǎn),提示該類(lèi)菌株存在小范圍流行。成較大簇患者有沿交通干線分布的特點(diǎn),提示需加強(qiáng)人口密集區(qū)和流動(dòng)人口較多地區(qū)的結(jié)核病防制工作。(3)職業(yè)、治療結(jié)局與菌株成簇性的關(guān)聯(lián)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
【學(xué)位授予單位】：南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類(lèi)號(hào)】：R52

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本文編號(hào)：1288803