蛋白質(zhì)是所有生命體內(nèi)重要的組成部分,與各種形式的生命活動緊密地聯(lián)系在一起,既是生命活動的主要承擔(dān)者,也是生命現(xiàn)象的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。因此,開展對蛋白質(zhì)的研究從而更加深入地揭示生命活動的奧秘成為當(dāng)今生命科學(xué)研究的前沿。由氨基酸序列信息所編碼的蛋白質(zhì)三維立體結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)分子行使各種各樣生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。因此要了解蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能,首先要對其三維立體結(jié)構(gòu)信息有所了解。由于X射線衍射以及核磁共振技術(shù)的發(fā)展,人們已經(jīng)積累了關(guān)于蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息的豐富知識,但是蛋白質(zhì)如何由一維序列折疊到其特定的三維結(jié)構(gòu)目前仍存在基礎(chǔ)性困難。過去對蛋白質(zhì)折疊的研究主要集中在一些能夠自發(fā)進(jìn)行折疊的單域蛋白,這些蛋白的折疊大多符合兩態(tài)折疊機制,并且人們已經(jīng)提出了幾個能夠解釋實驗數(shù)據(jù)的理論模型,如擴(kuò)散-碰撞模型,成核-凝聚模型等。尤其是能量面理論的提出,為解釋蛋白質(zhì)折疊的動力學(xué)和熱力學(xué)性質(zhì)提供了一個統(tǒng)一的框架。隨著實驗和計算能力的發(fā)展.目前人們對蛋白質(zhì)的研究已經(jīng)擴(kuò)展到更加復(fù)雜的體系,特別是包含輔助因子的蛋白質(zhì)的折疊,這種蛋白質(zhì)的折疊行為很大程度上受到輔助因子的調(diào)控,因此具有一些新的特點。但是由于實驗方法分辨率的限制,目前從... 

【文章來源】：南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：98 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 前言
    1.1 蛋白質(zhì)
        1.1.1 氨基酸的結(jié)構(gòu)特征
        1.1.2 氨基酸的分類
    1.2 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)
        1.2.1 一級結(jié)構(gòu)
        1.2.2 二級結(jié)構(gòu)
        1.2.3 結(jié)構(gòu)模體
        1.2.4 三級結(jié)構(gòu)
        1.2.5 四級結(jié)構(gòu)
    1.3 驅(qū)動蛋白質(zhì)折疊的因素
    1.4 蛋白質(zhì)的折疊
        1.4.1 物理學(xué)基礎(chǔ)
        1.4.2 蛋白質(zhì)折疊的機制
    1.5 輔助因子對蛋白質(zhì)的影響
        1.5.1 非共價修飾
        1.5.2 共價修飾
    1.6 模擬方法
        1.6.1 粗�；Ｐ�
        1.6.2 AICG2+勢能函數(shù)
        1.6.3 副本交換
    1.7 論文研究內(nèi)容
第二章 血紅素綁定對肌紅蛋白折疊的影響
    2.1 引言
    2.2 材料和方法
    2.3 結(jié)果和討論
        2.3.1 Q值隨時間的波動和分布
        2.3.2 HoloMb和ApoMb的中間態(tài)
        2.3.3 基于Q_(AGH)和Q_(BCE)自由能圖
        2.3.4 肌紅蛋白折疊的動力學(xué)描述
        2.3.5 F螺旋對折疊機制的影響
    2.4 結(jié)論
第三章 鋅離子綁定對同源蛋白質(zhì)折疊機制的影響
    3.1 引言
    3.2 材料和方法
    3.3 結(jié)果和討論
        3.3.1 Q值隨時間的演化和分布
        3.3.2 折疊機制的動力學(xué)描述
    3.4 結(jié)論
第四章 磷酸化對絲氨酸和蘇氨酸肽骨架構(gòu)象內(nèi)稟傾向性的影響
    4.1 引言
    4.2 材料和方法
    4.3 結(jié)果和討論
        4.3.1 磷酸化對絲氨酸和蘇氨酸短肽構(gòu)象分布的影響
        4.3.2 磷酸化對骨架構(gòu)象內(nèi)稟傾向性影響的物理機制
    4.4 結(jié)論
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間完成的工作
致謝



本文編號：3196461