本文關(guān)鍵詞：基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型的定性分析

  更多相關(guān)文章： 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 斑馬魚模型 交叉擴(kuò)散 穩(wěn)定性 Hopf分岔 圖靈斑圖

【摘要】：隨著生物信息學(xué)的迅速發(fā)展和DNA芯片技術(shù)的出現(xiàn),使得測定基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)成為可能.目前基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)成為生物信息學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究的一個(gè)新領(lǐng)域,并且對(duì)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)理論和實(shí)驗(yàn)的研究引發(fā)了越來越多的關(guān)注.因?yàn)榛蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)主要描述基因產(chǎn)物,如m RNA和蛋白質(zhì)之間高度復(fù)雜的相互作用的動(dòng)態(tài)生化系統(tǒng),因此基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對(duì)于人們理解基因和蛋白質(zhì)是如何運(yùn)作而形成一個(gè)可以表現(xiàn)各種生物功能的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)具有重要意義.例如,由于基因的調(diào)控作用才使得斑馬魚細(xì)胞內(nèi)的基因合成功能蛋白,而這些蛋白質(zhì)通過有序排列形成皮膚組織,從而形成體表斑圖.所以從基因?qū)哟窝芯堪唏R魚斑圖對(duì)于系統(tǒng)地了解斑馬魚斑圖的形成過程具有重要的意義.本文在分析和總結(jié)由s RNA調(diào)節(jié)的時(shí)滯基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型和斑馬魚模型研究現(xiàn)狀的基礎(chǔ)上,通過穩(wěn)定性理論、Turing分岔理論等分析方法,分別對(duì)上述兩種模型的動(dòng)力學(xué)行為進(jìn)行研究.本文的組織如下:第一章概述時(shí)滯基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),帶有時(shí)滯和交叉擴(kuò)散的斑馬魚模型,研究其現(xiàn)狀及進(jìn)展,并且闡述本文的主要內(nèi)容.第二章建立由s RNA調(diào)節(jié)的時(shí)滯基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型,選取時(shí)滯?為分岔參數(shù),研究系統(tǒng)正平衡點(diǎn)的局部漸近穩(wěn)定和Hopf分岔.第三章研究帶有交叉擴(kuò)散的斑馬魚模型,分析系統(tǒng)的Turing分岔,推導(dǎo)系統(tǒng)的振幅方程并且研究系統(tǒng)圖靈斑圖的選擇和穩(wěn)定性.第四章討論帶有交叉擴(kuò)散和時(shí)滯的斑馬魚模型,以時(shí)滯為分岔參數(shù)分析系統(tǒng)的Turing不穩(wěn)定性,并且討論時(shí)滯對(duì)斑圖產(chǎn)生的影響.第五章總結(jié)全文的工作,并對(duì)今后的工作進(jìn)行展望.
【關(guān)鍵詞】：基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 斑馬魚模型 交叉擴(kuò)散 穩(wěn)定性 Hopf分岔 圖靈斑圖
【學(xué)位授予單位】：南京航空航天大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：O175
【目錄】：

• 摘要4-5
• ABSTRACT5-10
• 注釋表10-11
• 第一章 緒論11-17
• 1.1 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究背景11-12
• 1.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究意義及現(xiàn)狀12-13
• 1.3 斑馬魚模型的研究意義及現(xiàn)狀13-15
• 1.4 本文的主要工作和創(chuàng)新點(diǎn)15-17
• 第二章 由sRNA調(diào)節(jié)的時(shí)滯基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動(dòng)力學(xué)分析17-24
• 2.1 模型描述17
• 2.2 平衡點(diǎn)的穩(wěn)定性和Hopf分岔17-20
• 2.3 數(shù)值仿真與討論20-23
• 2.4 本章小結(jié)23-24
• 第三章 一類具有交叉擴(kuò)散的斑馬魚模型的空間動(dòng)力學(xué)分析24-41
• 3.1 模型描述24-25
• 3.2 Hopf分岔和Turing分岔分析25-27
• 3.3 推導(dǎo)振幅方程27-32
• 3.4 圖靈斑圖分析32-35
• 3.5 數(shù)值舉例35-40
• 3.5.1 斑圖選擇35-38
• 3.5.2 交叉擴(kuò)散對(duì)斑圖選擇的影響38-40
• 3.6 本章小結(jié)40-41
• 第四章 一類帶有時(shí)滯和交叉擴(kuò)散的斑馬魚模型的動(dòng)力學(xué)分析41-47
• 4.1 模型描述41
• 4.2 穩(wěn)定性分析41-43
• 4.3 數(shù)值仿真43-46
• 4.3.1 時(shí)滯對(duì)斑圖選擇的影響43-45
• 4.3.2 交叉擴(kuò)散對(duì)斑圖選擇的影響45-46
• 4.4 本章小結(jié)46-47
• 第五章 總結(jié)與展望47-49
• 5.1 總結(jié)47
• 5.2 展望47-49
• 參考文獻(xiàn)49-53
• 致謝53-54
• 在碩士期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文54

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1 吳佳s，

本文編號(hào)：861982